81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2559 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  690    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0109  hypothetical protein  47.72 
 
 
327 aa  337  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  44.98 
 
 
327 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1151  hypothetical protein  44.61 
 
 
328 aa  291  1e-77  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  40.67 
 
 
330 aa  272  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1184  hypothetical protein  40.42 
 
 
329 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.738501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07090  hypothetical protein  40.24 
 
 
330 aa  264  1e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2074  hypothetical protein  42.12 
 
 
333 aa  261  1e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0249  hypothetical protein  40.79 
 
 
327 aa  249  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1372  hypothetical protein  38.55 
 
 
325 aa  238  1e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0660  hypothetical protein  37.8 
 
 
333 aa  232  7.000000000000001e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00202264  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2220  hypothetical protein  35.84 
 
 
326 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1656  hypothetical protein  37.65 
 
 
324 aa  230  3e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2272  hypothetical protein  35.28 
 
 
304 aa  204  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3435  hypothetical protein  33.71 
 
 
368 aa  204  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  31.31 
 
 
716 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1762  hypothetical protein  29.91 
 
 
323 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.851546  normal  0.326658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0578  hypothetical protein  30.09 
 
 
313 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  33.23 
 
 
747 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  33.03 
 
 
727 aa  159  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0203  hypothetical protein  30.56 
 
 
339 aa  145  8.000000000000001e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.509977 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.64 
 
 
1343 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  28.1 
 
 
1500 aa  118  9.999999999999999e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.97 
 
 
1036 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  29.46 
 
 
1354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1467  hypothetical protein  28.24 
 
 
292 aa  113  4.0000000000000004e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.59 
 
 
1424 aa  112  7.000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.83 
 
 
1415 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.76 
 
 
1415 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.68 
 
 
1021 aa  110  3e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.7 
 
 
1433 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.81 
 
 
1415 aa  106  5e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.69 
 
 
1434 aa  103  3e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  26.83 
 
 
1436 aa  102  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.65 
 
 
1421 aa  100  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.11 
 
 
1426 aa  100  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.54 
 
 
1444 aa  99.8  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  26.74 
 
 
1500 aa  98.6  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1215  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  26.75 
 
 
975 aa  99  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  26.65 
 
 
1428 aa  97.8  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1406  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.14 
 
 
975 aa  95.9  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.25548  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  25.51 
 
 
1503 aa  94  3e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.27 
 
 
1411 aa  92.8  7e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  26.71 
 
 
1416 aa  92.4  8e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.49 
 
 
1406 aa  90.5  3e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1387  chaperone protein DnaJ  26.71 
 
 
981 aa  89.4  9e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.14 
 
 
1584 aa  88.2  2e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  25.43 
 
 
1420 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07100  hypothetical protein  24.6 
 
 
361 aa  84  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1185  hypothetical protein  28.29 
 
 
358 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.355273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0353  hypothetical protein  27.43 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  23.77 
 
 
1578 aa  81.6  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0110  hypothetical protein  24.47 
 
 
359 aa  80.5  0.00000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000391649 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  25.82 
 
 
1461 aa  79.3  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1763  hypothetical protein  24.93 
 
 
368 aa  79.3  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.569772  normal  0.24898 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  24.07 
 
 
1661 aa  77.8  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.83 
 
 
1431 aa  77  0.0000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  26.15 
 
 
383 aa  77  0.0000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0250  hypothetical protein  26.17 
 
 
365 aa  75.9  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0728462  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2558  hypothetical protein  25.75 
 
 
366 aa  76.3  0.0000000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000293353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.51 
 
 
1422 aa  75.9  0.0000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.05 
 
 
1414 aa  75.1  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1150  hypothetical protein  26.86 
 
 
370 aa  73.9  0.000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.3 
 
 
1487 aa  72.4  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.71 
 
 
1563 aa  67.4  0.0000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  24.58 
 
 
1647 aa  63.9  0.000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2219  hypothetical protein  24.86 
 
 
371 aa  63.2  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  25.6 
 
 
1442 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0631  hypothetical protein  24.86 
 
 
369 aa  61.2  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.6 
 
 
1437 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2075  hypothetical protein  24.66 
 
 
366 aa  60.8  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2596  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.13 
 
 
1206 aa  60.1  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0629261 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3434  hypothetical protein  23.58 
 
 
379 aa  59.7  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2273  hypothetical protein  39.68 
 
 
373 aa  57.4  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1122  hypothetical protein  28.21 
 
 
366 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1371  hypothetical protein  28.95 
 
 
360 aa  53.9  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1466  hypothetical protein  22.16 
 
 
364 aa  49.3  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1655  hypothetical protein  38.6 
 
 
369 aa  49.3  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0579  hypothetical protein  42.86 
 
 
364 aa  48.5  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0202  hypothetical protein  25.29 
 
 
381 aa  47.8  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1473  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  21.47 
 
 
1137 aa  47  0.0004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>