79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2272 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2272  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  630  1e-180  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  40.76 
 
 		 330 aa  263  3e-69  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2220  hypothetical protein  36.93 
 
 		 326 aa  233  3e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0109  hypothetical protein  37.11 
 
 		 327 aa  229  6e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123514 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  37.19 
 
 		 327 aa  216  4e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2074  hypothetical protein  35.4 
 
 		 333 aa  208  8e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1372  hypothetical protein  34.08 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  35.28 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1184  hypothetical protein  36.91 
 
 		 329 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.738501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07090  hypothetical protein  36.16 
 
 		 330 aa  199  5e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0249  hypothetical protein  35.87 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1151  hypothetical protein  31.86 
 
 		 328 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3435  hypothetical protein  31.12 
 
 		 368 aa  185  7e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1656  hypothetical protein  34.59 
 
 		 324 aa  185  7e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1762  hypothetical protein  33.55 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.851546  normal  0.326658 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0660  hypothetical protein  32.92 
 
 		 333 aa  172  7.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00202264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0578  hypothetical protein  30.62 
 
 		 313 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  31.8 
 
 		 727 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  28.09 
 
 		 716 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0203  hypothetical protein  27.22 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.509977 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  30.49 
 
 		 747 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.15 
 
 		 1021 aa  127  3e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1467  hypothetical protein  25.97 
 
 		 292 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  27.53 
 
 		 1500 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  28.71 
 
 		 1354 aa  109  6e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.39 
 
 		 1426 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.71 
 
 		 1343 aa  97.8  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.02 
 
 		 1036 aa  95.1  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.58 
 
 		 1415 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  25.88 
 
 		 1415 aa  91.3  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1387  chaperone protein DnaJ  27.39 
 
 		 981 aa  91.3  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1406  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.35 
 
 		 975 aa  90.5  3e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.25548  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.24 
 
 		 1415 aa  90.5  3e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1215  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  27.73 
 
 		 975 aa  89.4  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.38 
 
 		 1424 aa  88.6  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.33 
 
 		 1406 aa  86.7  5e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.81 
 
 		 1433 aa  85.5  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  25.16 
 
 		 1428 aa  81.6  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.28 
 
 		 1411 aa  81.6  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.66 
 
 		 1444 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.4 
 
 		 1563 aa  77.4  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  25.23 
 
 		 1500 aa  77  0.0000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  24.37 
 
 		 1436 aa  76.3  0.0000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.16 
 
 		 1434 aa  75.9  0.0000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  25.47 
 
 		 1578 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  24.92 
 
 		 1420 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  22.81 
 
 		 1503 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.52 
 
 		 1421 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.99 
 
 		 1584 aa  70.1  0.00000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  23.31 
 
 		 1416 aa  70.1  0.00000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3434  hypothetical protein  23.08 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.87 
 
 		 1431 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1763  hypothetical protein  24.93 
 
 		 368 aa  68.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.569772  normal  0.24898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1371  hypothetical protein  24.49 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  24.47 
 
 		 1461 aa  66.6  0.0000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1150  hypothetical protein  23.65 
 
 		 370 aa  66.2  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0631  hypothetical protein  22.77 
 
 		 369 aa  62.8  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2219  hypothetical protein  20.86 
 
 		 371 aa  62  0.00000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.08 
 
 		 1422 aa  62  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1185  hypothetical protein  26.86 
 
 		 358 aa  60.1  0.00000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.355273  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0353  hypothetical protein  27.37 
 
 		 371 aa  60.5  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0110  hypothetical protein  27.04 
 
 		 359 aa  59.7  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000391649 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  25.93 
 
 		 1661 aa  59.7  0.00000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2558  hypothetical protein  23.58 
 
 		 366 aa  59.3  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000293353  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  20.93 
 
 		 1647 aa  58.5  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1655  hypothetical protein  25.64 
 
 		 369 aa  58.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2596  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.5 
 
 		 1206 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0629261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2273  hypothetical protein  42.11 
 
 		 373 aa  55.8  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.65 
 
 		 1437 aa  55.8  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07100  hypothetical protein  26.57 
 
 		 361 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  23.65 
 
 		 1442 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  23.08 
 
 		 1414 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1122  hypothetical protein  32.58 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  40.35 
 
 		 383 aa  50.8  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2075  hypothetical protein  24.43 
 
 		 366 aa  49.7  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0250  hypothetical protein  40.35 
 
 		 365 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0728462  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.08 
 
 		 1487 aa  47.4  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0579  hypothetical protein  36.84 
 
 		 364 aa  44.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0202  hypothetical protein  36.21 
 
 		 381 aa  42.7  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.531807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>