63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_2219 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_2219  hypothetical protein  100 
 
 
371 aa  767    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0353  hypothetical protein  50.94 
 
 
371 aa  409  1e-113  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3434  hypothetical protein  43.25 
 
 
379 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2273  hypothetical protein  39.39 
 
 
373 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07100  hypothetical protein  40.82 
 
 
361 aa  281  1e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1122  hypothetical protein  35.83 
 
 
366 aa  279  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1371  hypothetical protein  39 
 
 
360 aa  277  2e-73  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1466  hypothetical protein  39.66 
 
 
364 aa  270  2.9999999999999997e-71  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2075  hypothetical protein  35.26 
 
 
366 aa  270  4e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0110  hypothetical protein  36.34 
 
 
359 aa  259  6e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000391649 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1763  hypothetical protein  37.09 
 
 
368 aa  252  8.000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.569772  normal  0.24898 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1185  hypothetical protein  36.49 
 
 
358 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.355273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1150  hypothetical protein  33.43 
 
 
370 aa  245  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1655  hypothetical protein  34.86 
 
 
369 aa  241  2e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2558  hypothetical protein  34.15 
 
 
366 aa  236  4e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000293353  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0631  hypothetical protein  32.13 
 
 
369 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0250  hypothetical protein  33.52 
 
 
365 aa  231  1e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0728462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  32.63 
 
 
716 aa  218  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  31.93 
 
 
383 aa  212  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  31.75 
 
 
747 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0579  hypothetical protein  32.13 
 
 
364 aa  199  7e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  30 
 
 
727 aa  188  1e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0202  hypothetical protein  27.51 
 
 
381 aa  153  5.9999999999999996e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  23.82 
 
 
327 aa  84  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2220  hypothetical protein  22.38 
 
 
326 aa  77.8  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0249  hypothetical protein  22.64 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1372  hypothetical protein  24.64 
 
 
325 aa  65.5  0.000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07090  hypothetical protein  22.32 
 
 
330 aa  63.9  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  22.76 
 
 
330 aa  63.5  0.000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  24.86 
 
 
333 aa  63.2  0.000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0109  hypothetical protein  27.81 
 
 
327 aa  62.4  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2272  hypothetical protein  20.86 
 
 
304 aa  62  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  19.59 
 
 
1416 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1537  hypothetical protein  22.13 
 
 
396 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1762  hypothetical protein  24.27 
 
 
323 aa  57.8  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.851546  normal  0.326658 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3435  hypothetical protein  26.83 
 
 
368 aa  57.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2074  hypothetical protein  38.75 
 
 
333 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  21.5 
 
 
1415 aa  57  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1151  hypothetical protein  40.62 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0660  hypothetical protein  38.82 
 
 
333 aa  55.1  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00202264  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0578  hypothetical protein  21.93 
 
 
313 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  21.51 
 
 
1424 aa  54.3  0.000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.23 
 
 
1426 aa  53.9  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.32 
 
 
1421 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  22.14 
 
 
1415 aa  52.8  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  23.99 
 
 
1503 aa  52.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  24.43 
 
 
419 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.43 
 
 
1411 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1184  hypothetical protein  42.37 
 
 
329 aa  52  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.738501  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1656  hypothetical protein  23.39 
 
 
324 aa  51.2  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  23.15 
 
 
1420 aa  51.2  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  22.87 
 
 
1433 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  24.2 
 
 
1428 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.43 
 
 
1584 aa  50.4  0.00005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  24 
 
 
1461 aa  50.1  0.00006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  27.59 
 
 
1500 aa  48.9  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.44 
 
 
1415 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  21.56 
 
 
1436 aa  46.6  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  21.1 
 
 
634 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1830  CoA enzyme activase  31.03 
 
 
453 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.17 
 
 
1487 aa  44.3  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1467  hypothetical protein  31.15 
 
 
292 aa  43.5  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  24.18 
 
 
1647 aa  42.7  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>