201 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1945 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  55.33 
 
 		 1500 aa  1691    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  54.41 
 
 		 1406 aa  1574    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  53 
 
 		 1584 aa  1570    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  41.78 
 
 		 1503 aa  1111    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  53.62 
 
 		 1563 aa  1623    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  57.99 
 
 		 1578 aa  1204    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  56.77 
 
 		 1421 aa  1626    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1406  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  51.33 
 
 		 975 aa  1018    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.25548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1215  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  51.02 
 
 		 975 aa  1017    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  100 
 
 		 1428 aa  2953    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  53.52 
 
 		 1436 aa  1562    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  58.27 
 
 		 1661 aa  1218    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  44.62 
 
 		 1444 aa  1268    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  63.99 
 
 		 1426 aa  1911    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  52.23 
 
 		 1411 aa  1550    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1387  chaperone protein DnaJ  50.35 
 
 		 981 aa  999    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  65.7 
 
 		 1433 aa  1988    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  59.14 
 
 		 1415 aa  1779    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  61.83 
 
 		 1420 aa  1857    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  50.46 
 
 		 1424 aa  1431    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  49.86 
 
 		 1647 aa  1059    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  52.49 
 
 		 1416 aa  1501    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  36.64 
 
 		 1461 aa  876    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  38.66 
 
 		 1434 aa  1019    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  57.32 
 
 		 1431 aa  1728    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1473  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.12 
 
 		 1137 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2596  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.52 
 
 		 1206 aa  385  1e-105  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0629261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.9 
 
 		 1036 aa  380  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  44.61 
 
 		 419 aa  372  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1405  hypothetical protein  43.64 
 
 		 420 aa  357  1e-96  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1214  hypothetical protein  43.64 
 
 		 421 aa  356  2e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.17 
 
 		 1415 aa  320  1e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.34 
 
 		 1415 aa  319  3e-85  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.81 
 
 		 1343 aa  318  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.55 
 
 		 1021 aa  314  5.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  24.48 
 
 		 1354 aa  313  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  26.29 
 
 		 1500 aa  277  1.0000000000000001e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  25.62 
 
 		 1442 aa  261  8e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.95 
 
 		 1422 aa  257  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.45 
 
 		 1437 aa  256  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  24.64 
 
 		 1414 aa  209  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.63 
 
 		 1487 aa  196  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1370  CoA enzyme activase  34.81 
 
 		 319 aa  178  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2218  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.38 
 
 		 323 aa  177  1.9999999999999998e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2076  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.23 
 
 		 329 aa  171  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.460545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07110  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.42 
 
 		 331 aa  169  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1123  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.97 
 
 		 327 aa  168  6.9999999999999995e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3433  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.02 
 
 		 344 aa  167  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1149  CoA enzyme activase  33.86 
 
 		 320 aa  166  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0201  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.43 
 
 		 347 aa  165  6e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.655613 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0354  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.09 
 
 		 329 aa  164  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1743  CoA enzyme activase  33.78 
 
 		 339 aa  164  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.386364  normal  0.436212 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1465  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.01 
 
 		 330 aa  162  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0628  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.19 
 
 		 336 aa  161  9e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0214776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1035  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.1 
 
 		 327 aa  159  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2557  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  30.06 
 
 		 320 aa  159  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000851772  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0251  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.95 
 
 		 320 aa  157  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.013721  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1977  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.55 
 
 		 339 aa  156  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0632  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  30.63 
 
 		 331 aa  155  5e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0662  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.45 
 
 		 319 aa  154  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00950425  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0580  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.51 
 
 		 367 aa  151  9e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0111  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.96 
 
 		 324 aa  148  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233838 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_485  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase  31.91 
 
 		 283 aa  138  8e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0544  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  31.91 
 
 		 283 aa  137  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0520  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.27 
 
 		 283 aa  135  5e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.211756  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1412  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.45 
 
 		 272 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2868  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.45 
 
 		 272 aa  124  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1745  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.56 
 
 		 261 aa  118  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  23.35 
 
 		 716 aa  116  4.0000000000000004e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2771  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.94 
 
 		 267 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1310  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.91 
 
 		 253 aa  112  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0200  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.33 
 
 		 539 aa  111  1e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000427749  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0864  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.59 
 
 		 249 aa  109  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  22.97 
 
 		 634 aa  107  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0885  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.12 
 
 		 259 aa  104  1e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71068  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1005  CoA enzyme activase  29.69 
 
 		 255 aa  103  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.350991  hitchhiker  0.000148209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1898  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.06 
 
 		 539 aa  102  5e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0893  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.24 
 
 		 273 aa  102  6e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1693  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.74 
 
 		 250 aa  101  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1706  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.17 
 
 		 262 aa  100  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  22.13 
 
 		 747 aa  99  6e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  26.65 
 
 		 333 aa  97.8  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0496  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.79 
 
 		 408 aa  97.4  2e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16070  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.02 
 
 		 260 aa  97.1  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0387  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  28.41 
 
 		 249 aa  96.3  4e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000890821  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0619  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.58 
 
 		 359 aa  95.9  5e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2776  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.89 
 
 		 272 aa  95.9  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  24.11 
 
 		 330 aa  95.5  6e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2057  CoA enzyme activase  27.65 
 
 		 256 aa  94.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1536  benzoyl-CoA reductase, subunit A  30.05 
 
 		 437 aa  94.7  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0726  benzoyl-CoA reductase, subunit A  30.05 
 
 		 437 aa  94  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.810305  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0272  CoA enzyme activase  26.57 
 
 		 268 aa  93.6  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.727827  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  24.85 
 
 		 327 aa  94  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0090  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.14 
 
 		 253 aa  94  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3161  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.97 
 
 		 275 aa  94.4  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0040907  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  22.93 
 
 		 727 aa  93.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2039  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.84 
 
 		 256 aa  92.8  5e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1417  CoA enzyme activase  31.14 
 
 		 260 aa  92.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000376879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1027  benzoyl-CoA reductase, subunit A  29.11 
 
 		 437 aa  91.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1326  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.35 
 
 		 242 aa  90.9  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0887236  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>