165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1310 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1310  CoA-substrate-specific enzyme activase  100 
 
 
253 aa  499  1e-140  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16070  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  50.8 
 
 
260 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3452  CoA-substrate-specific enzyme activase  52 
 
 
261 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1417  CoA enzyme activase  52.36 
 
 
260 aa  227  2e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000376879  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0200  CoA-substrate-specific enzyme activase  47.22 
 
 
539 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000427749  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1706  CoA-substrate-specific enzyme activase  51.18 
 
 
262 aa  224  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0885  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  51.2 
 
 
259 aa  219  3e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71068  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1745  CoA-substrate-specific enzyme activase  43.7 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0411  CoA enzyme activase  48.82 
 
 
258 aa  211  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1005  CoA enzyme activase  47.39 
 
 
255 aa  210  2e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.350991  hitchhiker  0.000148209 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1773  CoA-substrate-specific enzyme activase  44.98 
 
 
263 aa  207  9e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.912116  normal  0.454124 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1148  CoA-substrate-specific enzyme activase  45.97 
 
 
268 aa  207  2e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2039  CoA-substrate-specific enzyme activase  46.85 
 
 
256 aa  202  3e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0829  CoA-substrate-specific enzyme activase  43.82 
 
 
254 aa  199  1.9999999999999998e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428387 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1898  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  41.83 
 
 
539 aa  199  3e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2057  CoA enzyme activase  44.58 
 
 
256 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1468  CoA-substrate-specific enzyme activase  46.47 
 
 
256 aa  196  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2520  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  47.04 
 
 
253 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.491002  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0786  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  47.22 
 
 
274 aa  192  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.260383  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3879  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  41.47 
 
 
269 aa  191  9e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0546  CoA-substrate-specific enzyme activase  44.31 
 
 
263 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0604  CoA-substrate-specific enzyme activase  41.67 
 
 
246 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1279  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  46.69 
 
 
255 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1326  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  41.37 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0887236  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0893  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  40.16 
 
 
273 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0089  CoA enzyme activase  43.63 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1277  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  42.75 
 
 
259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1347  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  40.94 
 
 
246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1349  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  40.32 
 
 
242 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00045569 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1358  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  38.8 
 
 
244 aa  182  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.512731  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1928  CoA-substrate-specific enzyme activase  42.86 
 
 
258 aa  182  6e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0272  CoA enzyme activase  42.19 
 
 
268 aa  181  7e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.727827  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0874  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator (2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase component A)  40.64 
 
 
259 aa  181  1e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0705  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  43.62 
 
 
269 aa  178  8e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3160  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  41.41 
 
 
267 aa  177  1e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11310  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  44.4 
 
 
247 aa  177  1e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.45767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0987  CoA-substrate-specific enzyme activase  42.62 
 
 
269 aa  177  2e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.429759 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1099  CoA-substrate-specific enzyme activase  41.15 
 
 
264 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3161  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  43.92 
 
 
275 aa  176  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0040907  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0520  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  39.92 
 
 
283 aa  175  7e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.211756  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1693  CoA-substrate-specific enzyme activase  38.34 
 
 
250 aa  174  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0544  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  39.53 
 
 
283 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_485  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase  39.53 
 
 
283 aa  172  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2772  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  40.57 
 
 
260 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25420  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  45.38 
 
 
248 aa  172  3.9999999999999995e-42  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000315208  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0118  CoA-substrate-specific enzyme activase  43.01 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00112536  hitchhiker  0.00758509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2771  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  38.04 
 
 
267 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0387  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  41.04 
 
 
249 aa  172  5.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000890821  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2399  CoA-substrate-specific enzyme activase  43.04 
 
 
272 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0864  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  39.92 
 
 
249 aa  169  3e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224978  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5848  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  42.34 
 
 
255 aa  169  5e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04203  predicted ATPase, activator of (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  41.94 
 
 
255 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0419339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04166  hypothetical protein  41.94 
 
 
255 aa  168  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3661  CoA-substrate-specific enzyme activase  41.94 
 
 
255 aa  166  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0497003  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4562  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  42.34 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3729  CoA-substrate-specific enzyme activase  42.34 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.367049  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4770  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  42.34 
 
 
255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0428  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  40 
 
 
256 aa  166  4e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.215923  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4881  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  42.34 
 
 
255 aa  165  6.9999999999999995e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal  0.786718 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4936  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  42.34 
 
 
255 aa  165  8e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3911  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.2 
 
 
264 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0090  CoA-substrate-specific enzyme activase  40.32 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1743  CoA enzyme activase  41.73 
 
 
339 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.386364  normal  0.436212 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2868  CoA-substrate-specific enzyme activase  40.87 
 
 
272 aa  159  6e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2945  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  41.04 
 
 
248 aa  158  9e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2776  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  39.13 
 
 
272 aa  158  9e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2023  CoA-substrate-specific enzyme activase  38.37 
 
 
251 aa  157  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124243  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1133  putative CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  37.9 
 
 
259 aa  157  1e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000196227  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0628  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  40.31 
 
 
336 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1412  CoA-substrate-specific enzyme activase  40.48 
 
 
272 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  37.4 
 
 
1354 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1977  CoA-substrate-specific enzyme activase  39.53 
 
 
339 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0619  CoA-substrate-specific enzyme activase  39.06 
 
 
359 aa  155  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0662  CoA-substrate-specific enzyme activase  38.28 
 
 
319 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00950425  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  38.8 
 
 
1036 aa  154  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0201  CoA-substrate-specific enzyme activase  39.76 
 
 
347 aa  151  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.655613 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0111  CoA-substrate-specific enzyme activase  39 
 
 
324 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233838 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2557  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  38.34 
 
 
320 aa  149  4e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000851772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1370  CoA enzyme activase  39.3 
 
 
319 aa  148  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0632  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  38.58 
 
 
331 aa  148  9e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2218  CoA-substrate-specific enzyme activase  39.37 
 
 
323 aa  148  9e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1149  CoA enzyme activase  38.19 
 
 
320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.47 
 
 
1021 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  39.3 
 
 
1500 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1035  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.33 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1465  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.35 
 
 
330 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2687  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.6 
 
 
251 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343965  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4398  CoA-substrate-specific enzyme activase  36.64 
 
 
266 aa  145  6e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000662171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0354  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.02 
 
 
329 aa  144  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1685  CoA-substrate-specific enzyme activase  47.03 
 
 
255 aa  144  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.820549 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1123  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  37.05 
 
 
327 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07110  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  38.19 
 
 
331 aa  142  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0580  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.69 
 
 
367 aa  142  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0452  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.68 
 
 
251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3104  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  37.25 
 
 
256 aa  139  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3433  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.66 
 
 
344 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0251  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.43 
 
 
320 aa  139  4.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.013721  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  36.05 
 
 
1415 aa  139  6e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.05 
 
 
1415 aa  138  7e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3624  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.43 
 
 
275 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000071885  normal  0.336364 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>