165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0726 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_1027  benzoyl-CoA reductase, subunit A  90.16 
 
 
437 aa  812    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1536  benzoyl-CoA reductase, subunit A  92.45 
 
 
437 aa  830    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0726  benzoyl-CoA reductase, subunit A  100 
 
 
437 aa  884    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.810305  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2949  benzoyl-CoA reductase, subunit A  69.5 
 
 
438 aa  598  1e-170  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16070  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  44.55 
 
 
260 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3879  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  45.59 
 
 
269 aa  169  7e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2771  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  39.15 
 
 
267 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2057  CoA enzyme activase  44.33 
 
 
256 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1148  CoA-substrate-specific enzyme activase  42.36 
 
 
268 aa  161  2e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1706  CoA-substrate-specific enzyme activase  43 
 
 
262 aa  158  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3452  CoA-substrate-specific enzyme activase  43.14 
 
 
261 aa  154  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1005  CoA enzyme activase  40 
 
 
255 aa  152  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.350991  hitchhiker  0.000148209 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0200  CoA-substrate-specific enzyme activase  40 
 
 
539 aa  152  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000427749  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0885  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  41.95 
 
 
259 aa  151  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71068  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1099  CoA-substrate-specific enzyme activase  42.63 
 
 
264 aa  150  4e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2399  CoA-substrate-specific enzyme activase  43.43 
 
 
272 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2776  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  40.29 
 
 
272 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1745  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.31 
 
 
261 aa  144  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1417  CoA enzyme activase  43.9 
 
 
260 aa  142  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000376879  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1928  CoA-substrate-specific enzyme activase  42.03 
 
 
258 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0874  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator (2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase component A)  33.65 
 
 
259 aa  139  7e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1133  putative CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  37.16 
 
 
259 aa  139  8.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000196227  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1898  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  39.2 
 
 
539 aa  139  1e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3160  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  41.79 
 
 
267 aa  138  2e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1773  CoA-substrate-specific enzyme activase  38.32 
 
 
263 aa  138  2e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.912116  normal  0.454124 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1693  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.41 
 
 
250 aa  137  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4881  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  39.9 
 
 
255 aa  136  8e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal  0.786718 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4562  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  39.42 
 
 
255 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3729  CoA-substrate-specific enzyme activase  39.42 
 
 
255 aa  134  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.367049  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4770  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  39.42 
 
 
255 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0829  CoA-substrate-specific enzyme activase  38.19 
 
 
254 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428387 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04203  predicted ATPase, activator of (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  39.42 
 
 
255 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0419339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1468  CoA-substrate-specific enzyme activase  44.51 
 
 
256 aa  133  5e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25420  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  40.61 
 
 
248 aa  134  5e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000315208  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04166  hypothetical protein  39.42 
 
 
255 aa  133  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1310  CoA-substrate-specific enzyme activase  39.46 
 
 
253 aa  133  6e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0705  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  39.39 
 
 
269 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3661  CoA-substrate-specific enzyme activase  39.42 
 
 
255 aa  133  7.999999999999999e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0497003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5848  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  38.94 
 
 
255 aa  132  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0411  CoA enzyme activase  40.76 
 
 
258 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0089  CoA enzyme activase  41.12 
 
 
259 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0546  CoA-substrate-specific enzyme activase  43.29 
 
 
263 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0987  CoA-substrate-specific enzyme activase  39.89 
 
 
269 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.429759 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1279  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  43.83 
 
 
255 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2868  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.38 
 
 
272 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0580  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.12 
 
 
367 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4936  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  37.98 
 
 
255 aa  127  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1412  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.38 
 
 
272 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2039  CoA-substrate-specific enzyme activase  39.25 
 
 
256 aa  126  7e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2520  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  42.13 
 
 
253 aa  126  9e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.491002  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0387  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  35.71 
 
 
249 aa  125  1e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000890821  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2772  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.92 
 
 
260 aa  125  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11310  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  38.07 
 
 
247 aa  125  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.45767 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2557  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  36.36 
 
 
320 aa  122  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000851772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0118  CoA-substrate-specific enzyme activase  39 
 
 
267 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00112536  hitchhiker  0.00758509 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0893  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.76 
 
 
273 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0786  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  38.28 
 
 
274 aa  119  9e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.260383  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0864  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  37.75 
 
 
249 aa  119  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224978  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2945  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  40 
 
 
248 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0090  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.06 
 
 
253 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0201  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.74 
 
 
347 aa  115  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.655613 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2076  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.51 
 
 
329 aa  113  6e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.460545  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0428  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  33.15 
 
 
256 aa  112  9e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.215923  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0632  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  32.02 
 
 
331 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2687  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.28 
 
 
251 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343965  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2727  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  35.41 
 
 
260 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0272  CoA enzyme activase  40.34 
 
 
268 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.727827  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1743  CoA enzyme activase  36.02 
 
 
339 aa  109  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.386364  normal  0.436212 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3161  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.47 
 
 
275 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0040907  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1123  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.33 
 
 
327 aa  108  2e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1277  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  37.5 
 
 
259 aa  106  9e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4398  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.61 
 
 
266 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000662171  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0619  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.52 
 
 
359 aa  105  2e-21  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1977  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.33 
 
 
339 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0727  benzoyl-CoA reductase, subunit D  30.5 
 
 
277 aa  104  3e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0544  CoA enzyme activase  33.82 
 
 
263 aa  104  4e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3433  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.24 
 
 
344 aa  103  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0544  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  32.97 
 
 
283 aa  102  2e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_485  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase  32.52 
 
 
283 aa  102  2e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1149  CoA enzyme activase  34.15 
 
 
320 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1370  CoA enzyme activase  32.85 
 
 
319 aa  102  2e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2948  benzoyl-CoA reductase, subunit D  31.34 
 
 
282 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  28.63 
 
 
1461 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1035  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.64 
 
 
327 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0354  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.14 
 
 
329 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3911  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.7 
 
 
264 aa  100  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1026  benzoyl-CoA reductase, subunit D  30 
 
 
285 aa  100  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.614624  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.49 
 
 
1036 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0251  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.84 
 
 
320 aa  99.8  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.013721  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0111  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.16 
 
 
324 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233838 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1465  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.88 
 
 
330 aa  99  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  34.16 
 
 
1500 aa  98.6  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0253  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.35 
 
 
244 aa  98.6  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0662  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.38 
 
 
319 aa  97.8  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00950425  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0392  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.29 
 
 
256 aa  98.2  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2398  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.34 
 
 
266 aa  97.8  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2023  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.82 
 
 
251 aa  96.7  7e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124243  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1326  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.29 
 
 
242 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0887236  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0484  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.63 
 
 
256 aa  96.7  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1349  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.22 
 
 
242 aa  96.7  7e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00045569 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>