165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2557 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2557  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  100 
 
 
320 aa  654    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000851772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1123  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  65.5 
 
 
327 aa  442  1e-123  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2076  CoA-substrate-specific enzyme activase  65.5 
 
 
329 aa  443  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.460545  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1149  CoA enzyme activase  66.77 
 
 
320 aa  438  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1370  CoA enzyme activase  66.98 
 
 
319 aa  438  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1035  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  65.18 
 
 
327 aa  432  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0111  CoA-substrate-specific enzyme activase  62.78 
 
 
324 aa  422  1e-117  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233838 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0354  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  64.42 
 
 
329 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3433  CoA-substrate-specific enzyme activase  62.11 
 
 
344 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07110  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  59.75 
 
 
331 aa  403  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0662  CoA-substrate-specific enzyme activase  60.76 
 
 
319 aa  398  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00950425  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0632  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  60.32 
 
 
331 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1465  CoA-substrate-specific enzyme activase  59.29 
 
 
330 aa  390  1e-107  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2218  CoA-substrate-specific enzyme activase  57.68 
 
 
323 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1977  CoA-substrate-specific enzyme activase  56.55 
 
 
339 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1743  CoA enzyme activase  56.51 
 
 
339 aa  365  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.386364  normal  0.436212 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0628  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  55.56 
 
 
336 aa  360  2e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0214776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0251  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  55.06 
 
 
320 aa  354  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.013721  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0580  CoA-substrate-specific enzyme activase  46.97 
 
 
367 aa  328  9e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0201  CoA-substrate-specific enzyme activase  48.75 
 
 
347 aa  317  2e-85  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.655613 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_485  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase  50.55 
 
 
283 aa  285  8e-76  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0544  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  50.55 
 
 
283 aa  284  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0520  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  48.9 
 
 
283 aa  278  8e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.211756  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  49.07 
 
 
1354 aa  268  7e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  43.53 
 
 
1036 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  42.72 
 
 
1500 aa  238  1e-61  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  46.1 
 
 
1343 aa  230  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  39.38 
 
 
1021 aa  224  1e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  38.82 
 
 
1415 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  38.82 
 
 
1415 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  31.71 
 
 
1461 aa  178  1e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.59 
 
 
1444 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1406  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.12 
 
 
975 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.25548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1215  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  32.7 
 
 
975 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.38 
 
 
1426 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.65 
 
 
1420 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3452  CoA-substrate-specific enzyme activase  38.93 
 
 
261 aa  161  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  31.11 
 
 
1436 aa  160  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1473  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.19 
 
 
1137 aa  160  2e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  30.06 
 
 
1428 aa  159  4e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.11 
 
 
1431 aa  159  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.58 
 
 
1433 aa  156  5.0000000000000005e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.7 
 
 
1411 aa  156  6e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.71 
 
 
1415 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.81 
 
 
1434 aa  153  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.11 
 
 
1406 aa  149  4e-35  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1310  CoA-substrate-specific enzyme activase  38.34 
 
 
253 aa  149  5e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  32.12 
 
 
1578 aa  146  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1387  chaperone protein DnaJ  31.01 
 
 
981 aa  145  7.0000000000000006e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16070  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.82 
 
 
260 aa  144  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  29.62 
 
 
1503 aa  142  9e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.98 
 
 
1424 aa  142  9e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  35.06 
 
 
1442 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.83 
 
 
1437 aa  141  9.999999999999999e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.5 
 
 
1421 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  29.21 
 
 
1416 aa  141  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  33.85 
 
 
1647 aa  140  3e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.74 
 
 
1422 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1706  CoA-substrate-specific enzyme activase  36.68 
 
 
262 aa  138  1e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  30.4 
 
 
1500 aa  137  2e-31  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0118  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.93 
 
 
267 aa  135  6.0000000000000005e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00112536  hitchhiker  0.00758509 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.19 
 
 
1584 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  29.36 
 
 
1661 aa  135  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.06 
 
 
1414 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2596  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.7 
 
 
1206 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0629261 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0200  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.98 
 
 
539 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000427749  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1898  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.75 
 
 
539 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0885  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  37.5 
 
 
259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71068  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.45 
 
 
1563 aa  129  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1773  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.48 
 
 
263 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.912116  normal  0.454124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3160  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.57 
 
 
267 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2061  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.05 
 
 
412 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2057  CoA enzyme activase  35.63 
 
 
256 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0551  NADPH-dependent F420 reductase  30.4 
 
 
420 aa  126  6e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.134665 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1906  CoA enzyme activase  32.69 
 
 
414 aa  125  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.213547  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1005  CoA enzyme activase  36.61 
 
 
255 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.350991  hitchhiker  0.000148209 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2307  CoA enzyme activase  30.19 
 
 
413 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0786  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.96 
 
 
274 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.260383  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1148  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.04 
 
 
268 aa  124  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2023  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.52 
 
 
251 aa  124  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124243  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0251  methanogenesis marker protein 15  30.74 
 
 
413 aa  123  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.447207  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1745  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.58 
 
 
261 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0726  benzoyl-CoA reductase, subunit A  36.36 
 
 
437 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.810305  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1536  benzoyl-CoA reductase, subunit A  35.83 
 
 
437 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3161  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.58 
 
 
275 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0040907  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2949  benzoyl-CoA reductase, subunit A  36.36 
 
 
438 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.77 
 
 
417 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2039  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.25 
 
 
256 aa  120  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0893  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.27 
 
 
273 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1417  CoA enzyme activase  35.66 
 
 
260 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000376879  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1027  benzoyl-CoA reductase, subunit A  34.76 
 
 
437 aa  119  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0705  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.06 
 
 
269 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2771  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.57 
 
 
267 aa  119  7.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2945  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  38.38 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0089  CoA enzyme activase  33.85 
 
 
259 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0496  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.13 
 
 
408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04203  predicted ATPase, activator of (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  30.27 
 
 
255 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0419339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04166  hypothetical protein  30.27 
 
 
255 aa  116  5e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0411  CoA enzyme activase  37.31 
 
 
258 aa  116  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1099  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.33 
 
 
264 aa  116  6e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>