205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1329 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  58.91 
 
 		 1500 aa  1786    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  41.13 
 
 		 1503 aa  1140    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  56.28 
 
 		 1411 aa  1653    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  55.16 
 
 		 1424 aa  1586    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  60.35 
 
 		 1431 aa  1823    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1406  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  52.76 
 
 		 975 aa  1028    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.25548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1215  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  52.55 
 
 		 975 aa  1029    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  65.7 
 
 		 1428 aa  1988    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  55.83 
 
 		 1436 aa  1648    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  44.91 
 
 		 1444 aa  1305    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  40.07 
 
 		 1434 aa  1065    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  55.34 
 
 		 1584 aa  1653    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1387  chaperone protein DnaJ  51.83 
 
 		 981 aa  1046    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  100 
 
 		 1433 aa  2957    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  51.89 
 
 		 1563 aa  1514    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  69.6 
 
 		 1426 aa  2090    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  64.51 
 
 		 1420 aa  1938    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  50.28 
 
 		 1647 aa  1081    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  59.25 
 
 		 1661 aa  1258    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  62.88 
 
 		 1415 aa  1885    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  58.4 
 
 		 1578 aa  1249    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  57.05 
 
 		 1406 aa  1660    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  57.65 
 
 		 1421 aa  1654    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  35.58 
 
 		 1461 aa  876    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  52.61 
 
 		 1416 aa  1524    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1473  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.81 
 
 		 1137 aa  430  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2596  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.6 
 
 		 1206 aa  419  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0629261 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.02 
 
 		 1036 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1405  hypothetical protein  47.63 
 
 		 420 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1214  hypothetical protein  47.77 
 
 		 421 aa  389  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  44.58 
 
 		 419 aa  376  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.54 
 
 		 1415 aa  357  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.99 
 
 		 1415 aa  350  2e-94  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  25.62 
 
 		 1354 aa  341  5.9999999999999996e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.23 
 
 		 1343 aa  333  1e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.3 
 
 		 1021 aa  312  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  26.39 
 
 		 1500 aa  299  3e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  23.83 
 
 		 1442 aa  273  1e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.2 
 
 		 1422 aa  243  2e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  24.49 
 
 		 1414 aa  243  2.9999999999999997e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.05 
 
 		 1487 aa  241  8e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.48 
 
 		 1437 aa  240  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1370  CoA enzyme activase  32.91 
 
 		 319 aa  178  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1035  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.23 
 
 		 327 aa  170  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2218  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.92 
 
 		 323 aa  170  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1465  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.4 
 
 		 330 aa  170  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1149  CoA enzyme activase  32.59 
 
 		 320 aa  167  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0251  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.81 
 
 		 320 aa  167  2.0000000000000002e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.013721  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0201  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.28 
 
 		 347 aa  166  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.655613 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1123  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.75 
 
 		 327 aa  166  3e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2076  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.7 
 
 		 329 aa  163  2e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.460545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0354  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.56 
 
 		 329 aa  161  7e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1977  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.63 
 
 		 339 aa  161  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3433  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.14 
 
 		 344 aa  159  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0632  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  32 
 
 		 331 aa  158  8e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1743  CoA enzyme activase  31 
 
 		 339 aa  157  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.386364  normal  0.436212 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07110  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.64 
 
 		 331 aa  157  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2557  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  31.58 
 
 		 320 aa  156  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000851772  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0628  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.34 
 
 		 336 aa  154  8.999999999999999e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0580  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.31 
 
 		 367 aa  154  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0111  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.63 
 
 		 324 aa  151  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000233838 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0520  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.32 
 
 		 283 aa  151  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.211756  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0662  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.79 
 
 		 319 aa  149  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00950425  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_485  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase  32.83 
 
 		 283 aa  146  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0544  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  32.83 
 
 		 283 aa  146  3e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  22.67 
 
 		 716 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1310  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.43 
 
 		 253 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  23.83 
 
 		 634 aa  115  6e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2771  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.68 
 
 		 267 aa  115  7.000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1412  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.89 
 
 		 272 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  28.7 
 
 		 330 aa  113  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1745  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.45 
 
 		 261 aa  113  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2868  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.89 
 
 		 272 aa  111  9.000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  30.7 
 
 		 333 aa  107  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0200  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.97 
 
 		 539 aa  105  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000427749  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  22.95 
 
 		 727 aa  105  5e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3161  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.66 
 
 		 275 aa  105  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0040907  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1706  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.55 
 
 		 262 aa  105  7e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  26.1 
 
 		 327 aa  104  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1417  CoA enzyme activase  31.8 
 
 		 260 aa  101  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000376879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2039  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.33 
 
 		 256 aa  98.6  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0249  hypothetical protein  27.51 
 
 		 327 aa  96.7  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0893  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.38 
 
 		 273 aa  96.7  3e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0864  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.62 
 
 		 249 aa  95.9  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224978  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0272  CoA enzyme activase  29.81 
 
 		 268 aa  95.9  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.727827  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0496  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.59 
 
 		 408 aa  95.9  5e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2399  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.67 
 
 		 272 aa  95.5  6e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1898  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.03 
 
 		 539 aa  95.1  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0109  hypothetical protein  27.67 
 
 		 327 aa  94.7  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16070  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.07 
 
 		 260 aa  94  2e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0387  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  29.23 
 
 		 249 aa  93.6  3e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000890821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1005  CoA enzyme activase  29.69 
 
 		 255 aa  93.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.350991  hitchhiker  0.000148209 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0885  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.73 
 
 		 259 aa  93.6  3e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71068  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0090  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.18 
 
 		 253 aa  93.6  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0660  hypothetical protein  26.43 
 
 		 333 aa  93.6  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00202264  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2776  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.15 
 
 		 272 aa  92.4  6e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0089  CoA enzyme activase  28.08 
 
 		 259 aa  91.7  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1928  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.76 
 
 		 258 aa  91.3  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1468  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.74 
 
 		 256 aa  90.1  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1184  hypothetical protein  27.58 
 
 		 329 aa  90.5  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.738501  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>