82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1121 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  100 
 
 
327 aa  678    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2074  hypothetical protein  50.46 
 
 
333 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1184  hypothetical protein  46.95 
 
 
329 aa  316  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.738501  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  46.75 
 
 
330 aa  311  6.999999999999999e-84  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  44.98 
 
 
333 aa  297  2e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0109  hypothetical protein  43.47 
 
 
327 aa  296  4e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07090  hypothetical protein  38.62 
 
 
330 aa  275  9e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1372  hypothetical protein  41.46 
 
 
325 aa  265  5.999999999999999e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2220  hypothetical protein  41.56 
 
 
326 aa  259  4e-68  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1151  hypothetical protein  41.9 
 
 
328 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0249  hypothetical protein  36.67 
 
 
327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0660  hypothetical protein  38.23 
 
 
333 aa  233  3e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00202264  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1656  hypothetical protein  37.12 
 
 
324 aa  231  2e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3435  hypothetical protein  33.81 
 
 
368 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2272  hypothetical protein  37.19 
 
 
304 aa  216  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  35.8 
 
 
716 aa  212  9e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1762  hypothetical protein  32.41 
 
 
323 aa  198  9e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.851546  normal  0.326658 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  33.83 
 
 
747 aa  180  2e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0578  hypothetical protein  31.15 
 
 
313 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  34.56 
 
 
727 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0203  hypothetical protein  32.63 
 
 
339 aa  161  1e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.509977 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1467  hypothetical protein  29.57 
 
 
292 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.05 
 
 
1343 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.7 
 
 
1036 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.55 
 
 
1424 aa  127  3e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  27.22 
 
 
1354 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1215  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  27.08 
 
 
975 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  25.9 
 
 
1500 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1406  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.79 
 
 
975 aa  110  3e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.25548  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.25 
 
 
1444 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.9 
 
 
1415 aa  109  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  25 
 
 
1503 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.37 
 
 
1434 aa  106  5e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.1 
 
 
1433 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.29 
 
 
1584 aa  103  3e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  25.93 
 
 
1021 aa  102  7e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  24.61 
 
 
1415 aa  102  9e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.3 
 
 
1415 aa  102  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.02 
 
 
1411 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  25.07 
 
 
1420 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1185  hypothetical protein  25.71 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.355273  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  24.18 
 
 
1436 aa  97.4  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.42 
 
 
1406 aa  96.7  5e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  25 
 
 
1416 aa  95.5  1e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  26.41 
 
 
1500 aa  94  3e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  24.85 
 
 
1428 aa  94  3e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  26.51 
 
 
1661 aa  94  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1387  chaperone protein DnaJ  25.07 
 
 
981 aa  93.6  5e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  25.22 
 
 
1578 aa  91.7  2e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.91 
 
 
1421 aa  91.3  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.82 
 
 
1563 aa  89  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0353  hypothetical protein  25.28 
 
 
371 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1763  hypothetical protein  24.93 
 
 
368 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.569772  normal  0.24898 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2219  hypothetical protein  23.82 
 
 
371 aa  84  0.000000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.98 
 
 
1426 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07100  hypothetical protein  23.93 
 
 
361 aa  81.3  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0110  hypothetical protein  25.14 
 
 
359 aa  79  0.00000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000391649 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3434  hypothetical protein  29.22 
 
 
379 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2075  hypothetical protein  24.86 
 
 
366 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  23.63 
 
 
1461 aa  77  0.0000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  27.05 
 
 
1647 aa  76.6  0.0000000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.69 
 
 
1414 aa  75.9  0.0000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.06 
 
 
1431 aa  75.5  0.000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1122  hypothetical protein  30.07 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  31.68 
 
 
383 aa  73.2  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1150  hypothetical protein  27.21 
 
 
370 aa  72.8  0.000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.62 
 
 
1422 aa  72.4  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2558  hypothetical protein  23.42 
 
 
366 aa  70.1  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000293353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1371  hypothetical protein  29.22 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1473  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  24.79 
 
 
1137 aa  69.3  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  24.23 
 
 
1442 aa  66.6  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.23 
 
 
1437 aa  65.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0631  hypothetical protein  21.73 
 
 
369 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0202  hypothetical protein  23.16 
 
 
381 aa  64.3  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0250  hypothetical protein  19.26 
 
 
365 aa  63.9  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0728462  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0579  hypothetical protein  25.44 
 
 
364 aa  63.5  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2596  CoA-substrate-specific enzyme activase  21.76 
 
 
1206 aa  62.8  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0629261 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2273  hypothetical protein  27.92 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1466  hypothetical protein  23.25 
 
 
364 aa  57.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2507  hypothetical protein  22.3 
 
 
283 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.881458  normal  0.633328 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.15 
 
 
1487 aa  49.3  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1655  hypothetical protein  35.09 
 
 
369 aa  47  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.621847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>