67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2558 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_2558  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  755    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000293353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1150  hypothetical protein  58.36 
 
 
370 aa  434  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0110  hypothetical protein  55.18 
 
 
359 aa  398  1e-109  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000391649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2075  hypothetical protein  42.86 
 
 
366 aa  311  9e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1122  hypothetical protein  41.48 
 
 
366 aa  301  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0353  hypothetical protein  43.37 
 
 
371 aa  299  4e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  41.8 
 
 
383 aa  295  1e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1763  hypothetical protein  37.13 
 
 
368 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.569772  normal  0.24898 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0631  hypothetical protein  40.66 
 
 
369 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07100  hypothetical protein  41.1 
 
 
361 aa  280  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1371  hypothetical protein  40.11 
 
 
360 aa  278  8e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0250  hypothetical protein  38.71 
 
 
365 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0728462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1185  hypothetical protein  40.95 
 
 
358 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.355273  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1655  hypothetical protein  38.21 
 
 
369 aa  262  8e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3434  hypothetical protein  38.52 
 
 
379 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2273  hypothetical protein  35.18 
 
 
373 aa  237  3e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2219  hypothetical protein  34.15 
 
 
371 aa  236  3e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1466  hypothetical protein  35.26 
 
 
364 aa  219  7e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  35.07 
 
 
747 aa  218  1e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  34.32 
 
 
716 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  33.61 
 
 
727 aa  199  6e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0579  hypothetical protein  31.11 
 
 
364 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0202  hypothetical protein  29.72 
 
 
381 aa  179  4.999999999999999e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07090  hypothetical protein  22.73 
 
 
330 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  25.75 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1184  hypothetical protein  24.43 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.738501  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  23.42 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3435  hypothetical protein  23.24 
 
 
368 aa  70.1  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2220  hypothetical protein  23.6 
 
 
326 aa  69.3  0.00000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2074  hypothetical protein  23.36 
 
 
333 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  22.32 
 
 
330 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0249  hypothetical protein  24.26 
 
 
327 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  22.02 
 
 
1461 aa  67  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0109  hypothetical protein  23.08 
 
 
327 aa  66.6  0.0000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123514 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1656  hypothetical protein  23.04 
 
 
324 aa  65.1  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1151  hypothetical protein  40 
 
 
328 aa  63.9  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1537  hypothetical protein  22.76 
 
 
396 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.86 
 
 
1411 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1762  hypothetical protein  29.45 
 
 
323 aa  61.2  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.851546  normal  0.326658 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.03 
 
 
1422 aa  60.5  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1372  hypothetical protein  22.38 
 
 
325 aa  60.1  0.00000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  21.58 
 
 
1415 aa  58.9  0.0000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2272  hypothetical protein  23.58 
 
 
304 aa  59.3  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  21.58 
 
 
1415 aa  56.6  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  25 
 
 
1414 aa  56.2  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  25.87 
 
 
1442 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.48 
 
 
1437 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.13 
 
 
1406 aa  53.1  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.92 
 
 
1424 aa  53.1  0.000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0578  hypothetical protein  20.38 
 
 
313 aa  52.8  0.000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.31 
 
 
1415 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1830  CoA enzyme activase  32.58 
 
 
453 aa  50.8  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  20.39 
 
 
1416 aa  50.1  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  23.62 
 
 
1433 aa  49.3  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  23.28 
 
 
1420 aa  48.1  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0660  hypothetical protein  36.07 
 
 
333 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00202264  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0203  hypothetical protein  36.92 
 
 
339 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.509977 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  23.84 
 
 
1354 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.94 
 
 
1421 aa  47  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  19.46 
 
 
1426 aa  46.6  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  23.75 
 
 
634 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.85 
 
 
1431 aa  45.1  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  22.02 
 
 
1578 aa  45.1  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.82 
 
 
1444 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1467  hypothetical protein  29.41 
 
 
292 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.66 
 
 
1584 aa  43.1  0.007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1747  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase D-component  32.88 
 
 
339 aa  42.7  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>