58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1122 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_1122  hypothetical protein  100 
 
 
366 aa  758    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2075  hypothetical protein  65.57 
 
 
366 aa  528  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1371  hypothetical protein  49.16 
 
 
360 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0631  hypothetical protein  49.16 
 
 
369 aa  358  8e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0353  hypothetical protein  46.69 
 
 
371 aa  350  2e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3434  hypothetical protein  47.8 
 
 
379 aa  345  7e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07100  hypothetical protein  45.33 
 
 
361 aa  336  5e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1655  hypothetical protein  45.33 
 
 
369 aa  323  4e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0110  hypothetical protein  43.73 
 
 
359 aa  322  9.000000000000001e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000391649 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1150  hypothetical protein  41.42 
 
 
370 aa  320  3e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1185  hypothetical protein  44.32 
 
 
358 aa  306  3e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.355273  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1763  hypothetical protein  42.7 
 
 
368 aa  305  6e-82  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.569772  normal  0.24898 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2558  hypothetical protein  41.48 
 
 
366 aa  301  1e-80  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000293353  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1466  hypothetical protein  40.88 
 
 
364 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2219  hypothetical protein  35.83 
 
 
371 aa  279  6e-74  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  39.18 
 
 
383 aa  277  2e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2273  hypothetical protein  38.63 
 
 
373 aa  276  3e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0250  hypothetical protein  34.79 
 
 
365 aa  263  4e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0728462  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  39.57 
 
 
727 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  38.08 
 
 
747 aa  252  6e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  34.62 
 
 
716 aa  230  3e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0579  hypothetical protein  30.3 
 
 
364 aa  207  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0202  hypothetical protein  27.96 
 
 
381 aa  158  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1184  hypothetical protein  25.56 
 
 
329 aa  88.6  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.738501  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0660  hypothetical protein  24.8 
 
 
333 aa  84  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00202264  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  26.43 
 
 
634 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2220  hypothetical protein  28.71 
 
 
326 aa  79.7  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2074  hypothetical protein  25.42 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07090  hypothetical protein  23.61 
 
 
330 aa  76.3  0.0000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1830  CoA enzyme activase  24.69 
 
 
453 aa  74.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1656  hypothetical protein  24.15 
 
 
324 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  30.07 
 
 
327 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0109  hypothetical protein  22.41 
 
 
327 aa  70.5  0.00000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  25.59 
 
 
1442 aa  69.3  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.33 
 
 
1422 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0249  hypothetical protein  22.72 
 
 
327 aa  69.3  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.07 
 
 
1437 aa  68.2  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  23.29 
 
 
330 aa  67  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.59 
 
 
1415 aa  66.6  0.0000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  25.12 
 
 
1415 aa  63.5  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3435  hypothetical protein  28.12 
 
 
368 aa  63.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1762  hypothetical protein  38.16 
 
 
323 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.851546  normal  0.326658 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  23.77 
 
 
1414 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1372  hypothetical protein  28.05 
 
 
325 aa  60.8  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.3 
 
 
1434 aa  58.9  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0578  hypothetical protein  22.7 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  28.21 
 
 
333 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1151  hypothetical protein  28.85 
 
 
328 aa  55.8  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1467  hypothetical protein  23.02 
 
 
292 aa  52.8  0.000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  24.39 
 
 
419 aa  52.8  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1214  hypothetical protein  25.68 
 
 
421 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1405  hypothetical protein  25.29 
 
 
420 aa  51.2  0.00003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147223  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2272  hypothetical protein  32.58 
 
 
304 aa  50.8  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.6 
 
 
1411 aa  49.7  0.00008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  24.72 
 
 
1354 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  25.94 
 
 
1433 aa  47.4  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  21.74 
 
 
1461 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  22.91 
 
 
1503 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>