46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1214 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1405  hypothetical protein  99.05 
 
 		 420 aa  852    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1214  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  860    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  52.35 
 
 		 419 aa  444  1e-123  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  50 
 
 		 1411 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  47.77 
 
 		 1433 aa  389  1e-107  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  45.91 
 
 		 1415 aa  378  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  44.78 
 
 		 1431 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  45.64 
 
 		 1426 aa  374  1e-102  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  45.52 
 
 		 1420 aa  365  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  42.51 
 
 		 1563 aa  357  2.9999999999999997e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  43.64 
 
 		 1428 aa  356  3.9999999999999996e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  41.87 
 
 		 1424 aa  348  1e-94  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  42.01 
 
 		 1500 aa  342  7e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  43.7 
 
 		 1416 aa  341  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  42.12 
 
 		 1661 aa  340  2e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  42.89 
 
 		 1421 aa  339  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  41.09 
 
 		 1406 aa  338  9e-92  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  42.12 
 
 		 1578 aa  335  9e-91  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  43.9 
 
 		 1584 aa  332  7.000000000000001e-90  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  40.48 
 
 		 1647 aa  325  7e-88  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  41.44 
 
 		 1436 aa  321  9.999999999999999e-87  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  36.54 
 
 		 1444 aa  298  1e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  32.16 
 
 		 1503 aa  255  8e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.08 
 
 		 1434 aa  211  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  29.38 
 
 		 1461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  22.07 
 
 		 634 aa  107  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1830  CoA enzyme activase  21.13 
 
 		 453 aa  80.5  0.00000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  25.33 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0250  hypothetical protein  24.01 
 
 		 365 aa  69.7  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0728462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0110  hypothetical protein  22.31 
 
 		 359 aa  65.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000391649 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  25.45 
 
 		 1487 aa  55.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  20.94 
 
 		 1415 aa  55.8  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  19.84 
 
 		 1415 aa  55.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1150  hypothetical protein  21.13 
 
 		 370 aa  52.4  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1122  hypothetical protein  25.68 
 
 		 366 aa  52.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  22.35 
 
 		 747 aa  51.6  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07100  hypothetical protein  22.53 
 
 		 361 aa  50.1  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1472  hypothetical protein  19.03 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  21.35 
 
 		 1422 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1537  hypothetical protein  25.35 
 
 		 396 aa  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  23.18 
 
 		 727 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  23.71 
 
 		 716 aa  47.4  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1185  hypothetical protein  21.62 
 
 		 358 aa  47  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.355273  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0579  hypothetical protein  22.19 
 
 		 364 aa  47  0.0007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2075  hypothetical protein  21.68 
 
 		 366 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  20.55 
 
 		 1442 aa  44.3  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>