200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1945 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_04840  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  58.33 
 
 
1661 aa  1201    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  35.55 
 
 
1461 aa  850    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  57.66 
 
 
1500 aa  1729    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  55.7 
 
 
1578 aa  1632    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0967  CoA enzyme activase  40.03 
 
 
1503 aa  1092    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2682  CoA-substrate-specific enzyme activase  55.1 
 
 
1563 aa  1615    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0435  CoA-substrate-specific enzyme activase  55.37 
 
 
1406 aa  1616    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.932842  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0149  CoA-substrate-specific enzyme activase  53.8 
 
 
1584 aa  1593    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1406  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  51.93 
 
 
975 aa  1019    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.25548  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1215  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  51.38 
 
 
975 aa  1014    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1945  putative activator of (R) -2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  63.99 
 
 
1428 aa  1911    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.174198  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2543  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  55.19 
 
 
1436 aa  1621    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1710  CoA-substrate-specific enzyme activase  56.85 
 
 
1421 aa  1635    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.838446  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1387  chaperone protein DnaJ  50.61 
 
 
981 aa  1014    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1329  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  69.6 
 
 
1433 aa  2090    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  38.68 
 
 
1434 aa  1009    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2933  CoA-substrate-specific enzyme activase  60.18 
 
 
1415 aa  1773    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1945  CoA-substrate-specific enzyme activase  100 
 
 
1426 aa  2950    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.676499  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1288  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  63.66 
 
 
1420 aa  1874    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.173462  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1931  activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  55.07 
 
 
1647 aa  655    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  51.62 
 
 
1424 aa  1468    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1188  CoA-substrate-specific enzyme activase  43.4 
 
 
1444 aa  1241    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  51.6 
 
 
1416 aa  1477    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  54.29 
 
 
1411 aa  1589    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2837  CoA-substrate-specific enzyme activase  58.91 
 
 
1431 aa  1774    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0533668  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2596  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.65 
 
 
1206 aa  410  1.0000000000000001e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0629261 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1473  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.53 
 
 
1137 aa  406  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.75 
 
 
1036 aa  388  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1325  CoA enzyme activase  27.7 
 
 
1354 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.222648  decreased coverage  0.00889318 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1405  hypothetical protein  45.64 
 
 
420 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.147223  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1214  hypothetical protein  45.64 
 
 
421 aa  374  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.113079  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  43.84 
 
 
419 aa  357  5.999999999999999e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3897  CoA-substrate-specific enzyme activase  26.21 
 
 
1343 aa  355  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0453  CoA-substrate-specific enzyme activase  27.92 
 
 
1415 aa  340  8e-92  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0438  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.6 
 
 
1415 aa  333  2e-89  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  26.45 
 
 
1021 aa  325  4e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  26.74 
 
 
1500 aa  317  9.999999999999999e-85  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.34888  normal  0.458746 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  24.14 
 
 
1487 aa  256  2.0000000000000002e-66  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3814  CoA enzyme activase  22.81 
 
 
1442 aa  243  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3958  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.9 
 
 
1437 aa  215  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3871  CoA-substrate-specific enzyme activase  23.44 
 
 
1422 aa  214  1e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  22.59 
 
 
1414 aa  204  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1465  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.35 
 
 
330 aa  182  5.999999999999999e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1370  CoA enzyme activase  33.55 
 
 
319 aa  175  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1149  CoA enzyme activase  33.97 
 
 
320 aa  172  4e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0354  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.82 
 
 
329 aa  172  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2557  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  32.38 
 
 
320 aa  169  2.9999999999999998e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000851772  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07110  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.06 
 
 
331 aa  167  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0201  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.99 
 
 
347 aa  166  2.0000000000000002e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.655613 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0251  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.33 
 
 
320 aa  164  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.013721  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1123  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.75 
 
 
327 aa  162  6e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0111  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.63 
 
 
324 aa  161  1e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000233838 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2076  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.27 
 
 
329 aa  161  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.460545  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2218  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.94 
 
 
323 aa  159  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3433  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.99 
 
 
344 aa  159  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1743  CoA enzyme activase  32.83 
 
 
339 aa  157  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.386364  normal  0.436212 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1977  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.74 
 
 
339 aa  156  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1035  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.43 
 
 
327 aa  155  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0544  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  33.83 
 
 
283 aa  153  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_485  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase  33.83 
 
 
283 aa  154  2e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0520  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.21 
 
 
283 aa  152  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.211756  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0632  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  30.86 
 
 
331 aa  149  5e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0628  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.25 
 
 
336 aa  148  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0214776  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0580  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.71 
 
 
367 aa  147  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0662  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.57 
 
 
319 aa  146  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00950425  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1745  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.7 
 
 
261 aa  119  5e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3435  hypothetical protein  26.94 
 
 
368 aa  118  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2771  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.33 
 
 
267 aa  117  1.0000000000000001e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2868  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.8 
 
 
272 aa  117  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0864  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.46 
 
 
249 aa  117  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224978  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  22.01 
 
 
747 aa  115  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1412  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.42 
 
 
272 aa  115  8.000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0893  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.22 
 
 
273 aa  112  5e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1310  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.84 
 
 
253 aa  111  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1706  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.19 
 
 
262 aa  108  9e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  25.53 
 
 
330 aa  108  1e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  23.7 
 
 
634 aa  105  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2272  hypothetical protein  28.39 
 
 
304 aa  106  4e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0109  hypothetical protein  26.18 
 
 
327 aa  105  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123514 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0200  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.39 
 
 
539 aa  104  9e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000427749  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1830  CoA enzyme activase  22.93 
 
 
453 aa  103  3e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1693  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.89 
 
 
250 aa  102  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3161  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.48 
 
 
275 aa  102  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0040907  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  26.11 
 
 
333 aa  100  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0387  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  29.84 
 
 
249 aa  100  3e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000890821  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1898  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.7 
 
 
539 aa  99  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  19.73 
 
 
716 aa  99  6e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16070  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.57 
 
 
260 aa  97.8  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0885  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.06 
 
 
259 aa  97.4  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71068  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2945  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  29.01 
 
 
248 aa  96.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0829  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.7 
 
 
254 aa  95.5  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428387 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2023  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.53 
 
 
251 aa  95.1  9e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124243  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2057  CoA enzyme activase  30.57 
 
 
256 aa  93.6  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  23.03 
 
 
727 aa  93.2  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1417  CoA enzyme activase  29.12 
 
 
260 aa  92.4  6e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000376879  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0090  CoA-substrate-specific enzyme activase  28.85 
 
 
253 aa  92  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1184  hypothetical protein  27.83 
 
 
329 aa  91.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.738501  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1005  CoA enzyme activase  28.57 
 
 
255 aa  90.9  2e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.350991  hitchhiker  0.000148209 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0619  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.91 
 
 
359 aa  90.5  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0496  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  27.48 
 
 
408 aa  90.5  2e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>