55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2273 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2273  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  766    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0353  hypothetical protein  45.96 
 
 
371 aa  332  6e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2219  hypothetical protein  39.39 
 
 
371 aa  295  1e-78  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1122  hypothetical protein  38.63 
 
 
366 aa  276  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1371  hypothetical protein  38.29 
 
 
360 aa  271  2e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2075  hypothetical protein  38.06 
 
 
366 aa  268  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.849304  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1185  hypothetical protein  38.78 
 
 
358 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.355273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07100  hypothetical protein  40.33 
 
 
361 aa  267  2.9999999999999995e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0110  hypothetical protein  39.11 
 
 
359 aa  265  1e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000391649 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0631  hypothetical protein  33.6 
 
 
369 aa  259  6e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1763  hypothetical protein  36.91 
 
 
368 aa  251  2e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.569772  normal  0.24898 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1655  hypothetical protein  37.12 
 
 
369 aa  244  9.999999999999999e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.621847 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3434  hypothetical protein  35.25 
 
 
379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1150  hypothetical protein  35.28 
 
 
370 aa  241  1e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1466  hypothetical protein  39.78 
 
 
364 aa  239  5.999999999999999e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0661  hypothetical protein  34.44 
 
 
383 aa  237  2e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.030634  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2558  hypothetical protein  35.18 
 
 
366 aa  237  3e-61  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000293353  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1976  hypothetical protein  32.69 
 
 
747 aa  229  4e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0250  hypothetical protein  34.71 
 
 
365 aa  228  9e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0728462  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0629  hypothetical protein  31.32 
 
 
716 aa  217  2e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.285219  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1742  hypothetical protein  29.97 
 
 
727 aa  200  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.550626 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0579  hypothetical protein  29.83 
 
 
364 aa  194  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0202  hypothetical protein  29.79 
 
 
381 aa  174  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.531807 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1830  CoA enzyme activase  22.16 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0278863 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2074  hypothetical protein  43.59 
 
 
333 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2220  hypothetical protein  26.42 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0109  hypothetical protein  23.46 
 
 
327 aa  67  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123514 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1184  hypothetical protein  23.14 
 
 
329 aa  65.1  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.738501  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07090  hypothetical protein  23.34 
 
 
330 aa  63.2  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0660  hypothetical protein  22.34 
 
 
333 aa  61.6  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00202264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1121  hypothetical protein  27.92 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0249  hypothetical protein  25 
 
 
327 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1151  hypothetical protein  37.66 
 
 
328 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1372  hypothetical protein  25.79 
 
 
325 aa  57.4  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2559  hypothetical protein  39.68 
 
 
333 aa  57.4  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.23992  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0627  CoA-substrate-specific enzyme activase  20.87 
 
 
1434 aa  56.6  0.0000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1762  hypothetical protein  26.75 
 
 
323 aa  56.2  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.851546  normal  0.326658 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0352  hypothetical protein  27.83 
 
 
330 aa  56.2  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0578  hypothetical protein  39.19 
 
 
313 aa  56.2  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1656  hypothetical protein  34.18 
 
 
324 aa  55.8  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.428768 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2272  hypothetical protein  42.11 
 
 
304 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2597  putative activator of 2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  26.82 
 
 
634 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0729978 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1797  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  20.1 
 
 
1416 aa  54.3  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1467  hypothetical protein  35.48 
 
 
292 aa  49.7  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1388  hypothetical protein  24.15 
 
 
419 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3435  hypothetical protein  32.79 
 
 
368 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0203  hypothetical protein  33.85 
 
 
339 aa  48.1  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.509977 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0189  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  25.3 
 
 
1414 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.52072 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2697  CoA-substrate-specific enzyme activase  22.4 
 
 
1411 aa  47.4  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.776938  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1610  CoA-substrate-specific enzyme activase  19.38 
 
 
1487 aa  46.6  0.0008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1747  2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase D-component  38.67 
 
 
339 aa  45.1  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0317  CoA-substrate-specific enzyme activase  20.61 
 
 
1424 aa  43.1  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07240  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  21.59 
 
 
1578 aa  43.1  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28100  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  25.5 
 
 
1461 aa  42.7  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.899466 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1695  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  20 
 
 
1500 aa  42.7  0.009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.990172  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>