259 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2168 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2168  lysine exporter protein LysE/YggA  100 
 
 		 206 aa  384  1e-106  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297592  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2504  efflux protein, LysE family  39.58 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1690  LysE family protein, putative  38.83 
 
 		 204 aa  105  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1365  lysine exporter protein LysE/YggA  34.83 
 
 		 207 aa  102  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2164  lysine exporter protein LysE/YggA  36.76 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0034  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.42 
 
 		 195 aa  97.8  9e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4317  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.381114  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2435  lysine exporter protein LysE/YggA  39.39 
 
 		 193 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3162  lysine exporter protein LysE/YggA  33.69 
 
 		 201 aa  92.4  4e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1806  lysine exporter protein LysE/YggA  32.18 
 
 		 199 aa  92.4  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3236  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 		 195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.748057 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4085  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4281  lysine exporter protein LysE/YggA  35.86 
 
 		 195 aa  92  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.690743 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1213  transporter, LysE family  28.86 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1731  lysine exporter protein LysE/YggA  34.85 
 
 		 195 aa  89.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0944  amino acid transporter LysE  32.84 
 
 		 203 aa  89.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2677  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2498  lysine exporter protein LysE/YggA  35.38 
 
 		 199 aa  89  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0255081  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1362  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 		 196 aa  88.6  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.400331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10300  putative efflux protein  32.84 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0350881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2947  hypothetical protein  32.68 
 
 		 205 aa  87  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.347316  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34800  amino acid transporter LysE  32.68 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000662816  hitchhiker  0.00481563 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3627  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 196 aa  86.3  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0538229  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3087  amino acid transporter LysE  27.59 
 
 		 197 aa  85.5  5e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0525749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2755  lysine exporter protein LysE/YggA  29.76 
 
 		 197 aa  85.1  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.541681  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1384  lysine exporter protein LysE/YggA  37.04 
 
 		 197 aa  85.1  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  31.5 
 
 		 202 aa  83.6  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00096233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3438  lysine exporter protein LysE/YggA  36.68 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.496079 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3234  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1493  lysine exporter protein (LysE/YggA)  27.23 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0246544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2325  lysine exporter protein LysE/YggA  35.82 
 
 		 215 aa  82  0.000000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2454  lysine exporter protein LysE/YggA  30 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000409233  normal  0.559989 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1354  lysine exporter protein LysE/YggA  26.87 
 
 		 201 aa  81.3  0.000000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2002  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 		 197 aa  81.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3706  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2742  lysine exporter protein LysE/YggA  26.73 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.13725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1527  lysine exporter protein LysE/YggA  26.47 
 
 		 197 aa  80.9  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0050843  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2949  lysine exporter protein LysE/YggA  32.35 
 
 		 208 aa  80.5  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3913  lysine exporter protein LysE/YggA  31.77 
 
 		 204 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4184  lysine exporter protein LysE/YggA  32.83 
 
 		 201 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.161304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2567  lysine exporter protein LysE/YggA  26.73 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2634  lysine exporter protein LysE/YggA  26.73 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0643719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2824  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  25.98 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00830664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1429  lysine exporter protein LysE/YggA  25.98 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2232  lysine exporter protein LysE/YggA  27.36 
 
 		 197 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.888389  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1531  lysine exporter protein LysE/YggA  25.98 
 
 		 197 aa  79  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2478  hypothetical protein  32.52 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.609748 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3452  transporter, LysE family  30.73 
 
 		 202 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4107  lysine exporter protein LysE/YggA  31.84 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.319328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2451  lysine exporter protein LysE/YggA  31.34 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1560  lysine exporter protein LysE/YggA  25.49 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.505926  normal  0.722057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3405  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361786 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2357  lysine exporter protein LysE/YggA  33.17 
 
 		 209 aa  77.8  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1716  amino acid transporter LysE  25.74 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2541  lysine exporter protein LysE/YggA  31.68 
 
 		 209 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00836946 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3854  lysine exporter protein LysE/YggA  30.73 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0976  lysine exporter protein LysE/YggA  33 
 
 		 225 aa  76.3  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244507  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0061  LysE family translocator protein  32.37 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0052  LysE family protein  32.37 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0053  LysE family protein  32.37 
 
 		 280 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0063  LysE family translocator protein  32.37 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0501  lysine exporter protein LysE/YggA  28.79 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1207  LysE family translocator protein  32.37 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1490  LysE family translocator protein  32.37 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0074  LysE family translocator protein  32.37 
 
 		 205 aa  75.9  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0636233  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1396  lysine exporter protein LysE/YggA  27.36 
 
 		 206 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.76085 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1684  lysine exporter protein LysE/YggA  29.61 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00116285  unclonable  0.0000017661 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0720  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.67 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1490  lysine exporter protein LysE/YggA  31.19 
 
 		 198 aa  74.7  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1315  hypothetical protein  31.31 
 
 		 204 aa  74.7  0.0000000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0235  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  27.52 
 
 		 216 aa  74.7  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0472066 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5024  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 205 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.884494  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3069  lysine exporter protein LysE/YggA  34.95 
 
 		 194 aa  70.5  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.220206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3165  lysine exporter protein LysE/YggA  30.43 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2278  amino acid transporter LysE  24.74 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0428766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2238  amino acid transporter LysE  24.74 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00601347  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3122  lysine exporter protein LysE/YggA  30.84 
 
 		 204 aa  70.1  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2447  amino acid transporter LysE  24.74 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.9492  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4470  lysine exporter protein LysE/YggA  31.25 
 
 		 205 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3096  lysine exporter protein LysE/YggA  31.94 
 
 		 212 aa  70.5  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2462  transporter, LysE family  24.74 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2929  transporter, LysE family  25.26 
 
 		 194 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241119 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2529  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  26.7 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1471  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.99 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5281  lysine exporter protein LysE/YggA  29.95 
 
 		 205 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.704689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3667  lysine exporter protein LysE/YggA  29.23 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.127666  normal  0.0314589 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2196  amino acid transporter LysE  25.63 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.184149  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2797  RhtB family transporter  29.41 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.376861  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1041  transmembrane transporter protein, LysE type translocator  29 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1559  LysE family protein  32.37 
 
 		 640 aa  67  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2541  transporter, LysE family  24.76 
 
 		 194 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2253  lysine exporter protein LysE/YggA  23.47 
 
 		 194 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0233273  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5106  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5753  lysine exporter protein LysE/YggA  30.77 
 
 		 205 aa  65.9  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.123143 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2731  neutral amino-acid efflux protein  32.21 
 
 		 195 aa  65.5  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0764776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3848  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.15 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2508  amino acid transporter LysE  26.09 
 
 		 204 aa  64.3  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.315866  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4575  lysine exporter protein LysE/YggA  30.35 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0540942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3759  hypothetical protein  31.29 
 
 		 174 aa  63.5  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.444425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6083  amino acid transporter LysE  28.57 
 
 		 201 aa  63.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>