164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0310 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0228  lysophospholipid transporter LplT  75.75 
 
 
434 aa  643    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0192  lysophospholipid transporter LplT  77.96 
 
 
426 aa  642    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0252  lysophospholipid transporter LplT  79.21 
 
 
426 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.697841  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0175  lysophospholipid transporter LplT  81.76 
 
 
425 aa  649    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4338  lysophospholipid transporter LplT  77.83 
 
 
434 aa  655    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497133  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0193  lysophospholipid transporter LplT  81.76 
 
 
425 aa  649    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0310  lysophospholipid transporter LplT  100 
 
 
433 aa  861    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571757  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0130  lysophospholipid transporter LplT  77.03 
 
 
426 aa  621  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3563  lysophospholipid transporter LplT  76.33 
 
 
425 aa  622  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738442  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0487  lysophospholipid transporter LplT  73.55 
 
 
427 aa  615  1e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0921  lysophospholipid transporter LplT  75.76 
 
 
417 aa  615  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2116  lysophospholipid transporter LplT  59.62 
 
 
424 aa  466  9.999999999999999e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0816109  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1984  lysophospholipid transporter LplT  56.6 
 
 
421 aa  425  1e-118  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.943557  normal  0.503134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2254  lysophospholipid transporter LplT  53.7 
 
 
416 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0274694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1576  lysophospholipid transporter LplT  51.38 
 
 
435 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3233  lysophospholipid transporter LplT  51.38 
 
 
435 aa  388  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2459  lysophospholipid transporter LplT  51.38 
 
 
435 aa  388  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0918  lysophospholipid transporter LplT  51.15 
 
 
439 aa  391  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2006  lysophospholipid transporter LplT  50.69 
 
 
435 aa  387  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.920099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2079  lysophospholipid transporter LplT  51.38 
 
 
451 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749328  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2515  lysophospholipid transporter LplT  51.38 
 
 
451 aa  388  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1351  lysophospholipid transporter LplT  51.38 
 
 
451 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0425999  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1399  lysophospholipid transporter LplT  51.03 
 
 
439 aa  375  1e-103  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344137  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2478  lysophospholipid transporter LplT  51.15 
 
 
435 aa  372  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00685032  hitchhiker  0.000365442 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1935  lysophospholipid transporter LplT  51.72 
 
 
439 aa  375  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0924  lysophospholipid transporter LplT  49.54 
 
 
439 aa  372  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358434  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1659  lysophospholipid transporter LplT  51.38 
 
 
435 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1718  lysophospholipid transporter LplT  50.12 
 
 
405 aa  363  2e-99  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.964759 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2310  lysophospholipid transporter LplT  49.75 
 
 
389 aa  359  6e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766456 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1360  lysophospholipid transporter LplT  51.15 
 
 
435 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400327  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5349  lysophospholipid transporter LplT  51.15 
 
 
435 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1237  lysophospholipid transporter LplT  51.38 
 
 
435 aa  356  5e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111638  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1370  lysophospholipid transporter LplT  51.03 
 
 
438 aa  355  5.999999999999999e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495863  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1243  lysophospholipid transporter LplT  51.04 
 
 
438 aa  355  1e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.621114  normal  0.61438 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2072  lysophospholipid transporter LplT  51.15 
 
 
435 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1941  lysophospholipid transporter LplT  51.15 
 
 
435 aa  354  2e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23021  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1309  lysophospholipid transporter LplT  51.04 
 
 
459 aa  354  2e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00718572  normal  0.641684 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6037  lysophospholipid transporter LplT  51.15 
 
 
435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00485648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2040  lysophospholipid transporter LplT  51.15 
 
 
435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2059  lysophospholipid transporter LplT  51.15 
 
 
435 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690395  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1618  lysophospholipid transporter LplT  45.85 
 
 
432 aa  305  8.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2519  lysophospholipid transporter LplT  45.62 
 
 
432 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177728  hitchhiker  0.00000217459 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1398  lysophospholipid transporter LplT  44.82 
 
 
432 aa  302  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295071 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1454  lysophospholipid transporter LplT  48.52 
 
 
422 aa  278  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812934  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2630  lysophospholipid transporter LplT  41.95 
 
 
403 aa  261  2e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1811  major facilitator superfamily MFS_1  40.43 
 
 
406 aa  255  9e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0751  lysophospholipid transporter LplT  37.26 
 
 
415 aa  243  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3608  lysophospholipid transporter LplT  40.35 
 
 
422 aa  234  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0976  lysophospholipid transporter LplT  38.6 
 
 
406 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3245  lysophospholipid transporter LplT  38.6 
 
 
406 aa  223  6e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0158938  hitchhiker  0.00481427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1028  lysophospholipid transporter LplT  38.6 
 
 
406 aa  223  6e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0767  lysophospholipid transporter LplT  35.55 
 
 
404 aa  220  3e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3616  lysophospholipid transporter LplT  35.97 
 
 
407 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3829  lysophospholipid transporter LplT  37.96 
 
 
398 aa  212  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2982  lysophospholipid transporter LplT  35.99 
 
 
397 aa  209  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0020769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2983  lysophospholipid transporter LplT  36.06 
 
 
397 aa  208  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0384881  normal  0.021461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02683  predicted inner membrane protein  35.82 
 
 
397 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.018578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0855  major facilitator superfamily MFS_1  35.82 
 
 
397 aa  207  3e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.191502  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3462  lysophospholipid transporter LplT  34.67 
 
 
407 aa  207  3e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02644  hypothetical protein  35.82 
 
 
397 aa  207  3e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0181673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4102  lysophospholipid transporter LplT  36.06 
 
 
397 aa  207  4e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120469  hitchhiker  0.000572662 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3155  lysophospholipid transporter LplT  35.82 
 
 
387 aa  207  4e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00836608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0880  lysophospholipid transporter LplT  35.82 
 
 
397 aa  207  4e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16932  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3027  lysophospholipid transporter LplT  35.82 
 
 
397 aa  207  4e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3276  lysophospholipid transporter LplT  38.21 
 
 
397 aa  197  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.120069  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3222  lysophospholipid transporter LplT  36.25 
 
 
400 aa  189  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000276168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3156  lysophospholipid transporter LplT  36 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.138727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3337  lysophospholipid transporter LplT  36 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3237  lysophospholipid transporter LplT  36 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000025684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3174  lysophospholipid transporter LplT  36 
 
 
400 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2465  lysophospholipid transporter LplT  34.56 
 
 
403 aa  178  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3825  lysophospholipid transporter LplT  33.99 
 
 
419 aa  176  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339646  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4052  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  25.75 
 
 
1155 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.378016 
 
 
-
 
NC_002620  TC0009  hypothetical protein  25.88 
 
 
559 aa  73.6  0.000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.854507  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  27.61 
 
 
1128 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0921  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  23.2 
 
 
1170 aa  66.6  0.0000000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0339  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.39 
 
 
888 aa  64.7  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169342 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.49 
 
 
635 aa  63.9  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1480  AMP-dependent synthetase and ligase  26.8 
 
 
1049 aa  63.5  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.529566  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.83 
 
 
635 aa  60.8  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0302  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  34.04 
 
 
1124 aa  60.8  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.11 
 
 
1131 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  23.54 
 
 
635 aa  59.7  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.54 
 
 
626 aa  59.7  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  29.75 
 
 
429 aa  59.7  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  22.41 
 
 
644 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3595  major facilitator transporter  30.82 
 
 
438 aa  58.2  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3695  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.22 
 
 
629 aa  56.2  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  25.42 
 
 
1136 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.01 
 
 
644 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.39 
 
 
632 aa  55.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667029  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.01 
 
 
644 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.01 
 
 
644 aa  55.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3365  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  23.5 
 
 
1146 aa  55.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0852  major facilitator transporter  32.68 
 
 
442 aa  55.8  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1923  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  25.19 
 
 
1150 aa  54.7  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2768  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.47 
 
 
645 aa  54.3  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1359  lysophospholipid exporter/ 2-acylglycerolphosphoethanolamine acyltransferase  22.47 
 
 
645 aa  53.9  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.526954 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1380  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.92 
 
 
644 aa  53.9  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.856404  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1340  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.92 
 
 
644 aa  53.5  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>