218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1370 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1370  lysophospholipid transporter LplT  100 
 
 		 438 aa  880    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495863  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1576  lysophospholipid transporter LplT  74.89 
 
 		 435 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2459  lysophospholipid transporter LplT  74.89 
 
 		 435 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1935  lysophospholipid transporter LplT  80.64 
 
 		 439 aa  667    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1351  lysophospholipid transporter LplT  74.89 
 
 		 451 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0425999  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2006  lysophospholipid transporter LplT  75.11 
 
 		 435 aa  644    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.920099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1243  lysophospholipid transporter LplT  92.47 
 
 		 438 aa  759    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.621114  normal  0.61438 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2515  lysophospholipid transporter LplT  74.89 
 
 		 451 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1399  lysophospholipid transporter LplT  80.64 
 
 		 439 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344137  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2079  lysophospholipid transporter LplT  74.89 
 
 		 451 aa  643    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749328  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1309  lysophospholipid transporter LplT  92.69 
 
 		 459 aa  759    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00718572  normal  0.641684 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3233  lysophospholipid transporter LplT  74.89 
 
 		 435 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2478  lysophospholipid transporter LplT  75.11 
 
 		 435 aa  623  1e-177  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00685032  hitchhiker  0.000365442 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1659  lysophospholipid transporter LplT  74.66 
 
 		 435 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1360  lysophospholipid transporter LplT  76.03 
 
 		 435 aa  610  1e-173  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5349  lysophospholipid transporter LplT  75.57 
 
 		 435 aa  609  1e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1237  lysophospholipid transporter LplT  75.34 
 
 		 435 aa  608  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111638  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1941  lysophospholipid transporter LplT  74.43 
 
 		 435 aa  604  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23021  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2059  lysophospholipid transporter LplT  75.11 
 
 		 435 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690395  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6037  lysophospholipid transporter LplT  75.11 
 
 		 435 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00485648  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2072  lysophospholipid transporter LplT  74.43 
 
 		 435 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2040  lysophospholipid transporter LplT  75.11 
 
 		 435 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0918  lysophospholipid transporter LplT  68.11 
 
 		 439 aa  579  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0924  lysophospholipid transporter LplT  67.65 
 
 		 439 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2116  lysophospholipid transporter LplT  60.41 
 
 		 424 aa  501  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0816109  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2254  lysophospholipid transporter LplT  58.22 
 
 		 416 aa  489  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0274694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1984  lysophospholipid transporter LplT  58.54 
 
 		 421 aa  456  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.943557  normal  0.503134 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1398  lysophospholipid transporter LplT  57.01 
 
 		 432 aa  451  1e-125  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1618  lysophospholipid transporter LplT  57.93 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2519  lysophospholipid transporter LplT  57.47 
 
 		 432 aa  441  1e-123  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177728  hitchhiker  0.00000217459 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0252  lysophospholipid transporter LplT  52.25 
 
 		 426 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.697841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0192  lysophospholipid transporter LplT  51.13 
 
 		 426 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4338  lysophospholipid transporter LplT  50.22 
 
 		 434 aa  403  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497133  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0228  lysophospholipid transporter LplT  50 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2310  lysophospholipid transporter LplT  50.47 
 
 		 389 aa  397  1e-109  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766456 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1718  lysophospholipid transporter LplT  49.17 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.964759 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0487  lysophospholipid transporter LplT  50.23 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0130  lysophospholipid transporter LplT  50.23 
 
 		 426 aa  391  1e-107  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0193  lysophospholipid transporter LplT  51.24 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0175  lysophospholipid transporter LplT  51.24 
 
 		 425 aa  387  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3563  lysophospholipid transporter LplT  50.11 
 
 		 425 aa  384  1e-105  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0921  lysophospholipid transporter LplT  48.97 
 
 		 417 aa  384  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0310  lysophospholipid transporter LplT  50.11 
 
 		 433 aa  367  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1454  lysophospholipid transporter LplT  51.53 
 
 		 422 aa  350  2e-95  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3608  lysophospholipid transporter LplT  45.83 
 
 		 422 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0751  lysophospholipid transporter LplT  40.79 
 
 		 415 aa  290  3e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2630  lysophospholipid transporter LplT  41.65 
 
 		 403 aa  276  4e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0767  lysophospholipid transporter LplT  40.09 
 
 		 404 aa  270  4e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1028  lysophospholipid transporter LplT  40.24 
 
 		 406 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3245  lysophospholipid transporter LplT  40.24 
 
 		 406 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0158938  hitchhiker  0.00481427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0976  lysophospholipid transporter LplT  40.24 
 
 		 406 aa  263  4.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12769  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3616  lysophospholipid transporter LplT  39.02 
 
 		 407 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3462  lysophospholipid transporter LplT  38.55 
 
 		 407 aa  259  6e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4102  lysophospholipid transporter LplT  38.39 
 
 		 397 aa  257  2e-67  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120469  hitchhiker  0.000572662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02683  predicted inner membrane protein  38.63 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.018578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0855  major facilitator superfamily MFS_1  38.63 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.191502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02644  hypothetical protein  38.63 
 
 		 397 aa  257  3e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0181673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0880  lysophospholipid transporter LplT  38.63 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3027  lysophospholipid transporter LplT  38.63 
 
 		 397 aa  256  4e-67  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3155  lysophospholipid transporter LplT  38.63 
 
 		 387 aa  256  5e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00836608  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2982  lysophospholipid transporter LplT  38.39 
 
 		 397 aa  256  7e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0020769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2983  lysophospholipid transporter LplT  38.39 
 
 		 397 aa  255  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0384881  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3829  lysophospholipid transporter LplT  40.26 
 
 		 398 aa  252  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1811  major facilitator superfamily MFS_1  37.94 
 
 		 406 aa  237  3e-61  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3276  lysophospholipid transporter LplT  39.57 
 
 		 397 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.120069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3222  lysophospholipid transporter LplT  38.63 
 
 		 400 aa  233  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000276168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3237  lysophospholipid transporter LplT  38.63 
 
 		 400 aa  233  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000025684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3156  lysophospholipid transporter LplT  38.63 
 
 		 400 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.138727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3337  lysophospholipid transporter LplT  38.63 
 
 		 400 aa  233  8.000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044358 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3174  lysophospholipid transporter LplT  38.63 
 
 		 400 aa  231  2e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2465  lysophospholipid transporter LplT  32.62 
 
 		 403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3825  lysophospholipid transporter LplT  31.67 
 
 		 419 aa  163  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  24.88 
 
 		 604 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  24.88 
 
 		 604 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  24.71 
 
 		 644 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  24.71 
 
 		 644 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  24.71 
 
 		 644 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  24.88 
 
 		 644 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4052  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  25.68 
 
 		 1155 aa  79.7  0.0000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.378016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  27.81 
 
 		 1114 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0187  acyltransferase family protein  26.19 
 
 		 618 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.19 
 
 		 645 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  26.7 
 
 		 626 aa  75.1  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000570  lysophospholipid transporter LplT/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase/acyl-[acyl-carrier-protein] synthetase  24.27 
 
 		 617 aa  74.3  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01437  hypothetical protein  24.62 
 
 		 624 aa  73.2  0.000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0009  hypothetical protein  25.12 
 
 		 559 aa  72.8  0.00000000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.854507  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  27.15 
 
 		 1131 aa  72  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0159  major facilitator transporter  23.64 
 
 		 560 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591852  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.44 
 
 		 644 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.44 
 
 		 644 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.44 
 
 		 644 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1380  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.14 
 
 		 644 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.856404  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004025  hypothetical protein  24.88 
 
 		 624 aa  70.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0141461  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1790  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.58 
 
 		 644 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.3 
 
 		 1128 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.5 
 
 		 626 aa  70.1  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1340  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.33 
 
 		 644 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203495  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  25.3 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  23.64 
 
 		 644 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05313  hypothetical protein  23.86 
 
 		 618 aa  68.9  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>