150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0921 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3563  lysophospholipid transporter LplT  83.61 
 
 		 425 aa  666    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0921  lysophospholipid transporter LplT  100 
 
 		 417 aa  830    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0252  lysophospholipid transporter LplT  76.98 
 
 		 426 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.697841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0192  lysophospholipid transporter LplT  77.83 
 
 		 426 aa  610  1e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0193  lysophospholipid transporter LplT  77.94 
 
 		 425 aa  592  1e-168  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0175  lysophospholipid transporter LplT  77.94 
 
 		 425 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0130  lysophospholipid transporter LplT  76.87 
 
 		 426 aa  586  1e-166  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0310  lysophospholipid transporter LplT  75.76 
 
 		 433 aa  587  1e-166  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571757  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0228  lysophospholipid transporter LplT  72 
 
 		 434 aa  578  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0487  lysophospholipid transporter LplT  72.29 
 
 		 427 aa  579  1e-164  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4338  lysophospholipid transporter LplT  71.53 
 
 		 434 aa  574  1.0000000000000001e-163  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2116  lysophospholipid transporter LplT  56.43 
 
 		 424 aa  451  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0816109  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1984  lysophospholipid transporter LplT  56.13 
 
 		 421 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.943557  normal  0.503134 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2254  lysophospholipid transporter LplT  53.92 
 
 		 416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0274694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0918  lysophospholipid transporter LplT  52 
 
 		 439 aa  387  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1576  lysophospholipid transporter LplT  50.47 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2006  lysophospholipid transporter LplT  50.94 
 
 		 435 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.920099  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1399  lysophospholipid transporter LplT  51.08 
 
 		 439 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344137  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2079  lysophospholipid transporter LplT  50.47 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3233  lysophospholipid transporter LplT  50.47 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2459  lysophospholipid transporter LplT  50.47 
 
 		 435 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2515  lysophospholipid transporter LplT  50.47 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1351  lysophospholipid transporter LplT  50.47 
 
 		 451 aa  373  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0425999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1659  lysophospholipid transporter LplT  51.18 
 
 		 435 aa  369  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2478  lysophospholipid transporter LplT  50.71 
 
 		 435 aa  368  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00685032  hitchhiker  0.000365442 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0924  lysophospholipid transporter LplT  50.24 
 
 		 439 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1935  lysophospholipid transporter LplT  49.64 
 
 		 439 aa  363  3e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1309  lysophospholipid transporter LplT  51.08 
 
 		 459 aa  354  1e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00718572  normal  0.641684 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2310  lysophospholipid transporter LplT  47.76 
 
 		 389 aa  354  1e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766456 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1370  lysophospholipid transporter LplT  48.97 
 
 		 438 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1243  lysophospholipid transporter LplT  51.08 
 
 		 438 aa  352  5e-96  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.621114  normal  0.61438 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1718  lysophospholipid transporter LplT  49.25 
 
 		 405 aa  351  1e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.964759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1360  lysophospholipid transporter LplT  50.93 
 
 		 435 aa  348  1e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1237  lysophospholipid transporter LplT  49.77 
 
 		 435 aa  340  2e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111638  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2072  lysophospholipid transporter LplT  49.07 
 
 		 435 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6037  lysophospholipid transporter LplT  49.31 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00485648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2040  lysophospholipid transporter LplT  49.31 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2059  lysophospholipid transporter LplT  49.31 
 
 		 435 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690395  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5349  lysophospholipid transporter LplT  48.84 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1941  lysophospholipid transporter LplT  49.07 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1454  lysophospholipid transporter LplT  49.58 
 
 		 422 aa  288  1e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1618  lysophospholipid transporter LplT  42.82 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2519  lysophospholipid transporter LplT  42.45 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177728  hitchhiker  0.00000217459 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1398  lysophospholipid transporter LplT  42.58 
 
 		 432 aa  276  6e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295071 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1811  major facilitator superfamily MFS_1  42.21 
 
 		 406 aa  258  2e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2630  lysophospholipid transporter LplT  40.62 
 
 		 403 aa  251  2e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3608  lysophospholipid transporter LplT  41.06 
 
 		 422 aa  242  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0751  lysophospholipid transporter LplT  37.02 
 
 		 415 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0976  lysophospholipid transporter LplT  37.59 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3245  lysophospholipid transporter LplT  37.59 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0158938  hitchhiker  0.00481427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1028  lysophospholipid transporter LplT  37.59 
 
 		 406 aa  218  1e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0767  lysophospholipid transporter LplT  37.28 
 
 		 404 aa  216  4e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3462  lysophospholipid transporter LplT  37.72 
 
 		 407 aa  216  7e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3829  lysophospholipid transporter LplT  37.64 
 
 		 398 aa  216  7e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3616  lysophospholipid transporter LplT  36.64 
 
 		 407 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2982  lysophospholipid transporter LplT  36.02 
 
 		 397 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0020769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2983  lysophospholipid transporter LplT  36.11 
 
 		 397 aa  205  2e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0384881  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4102  lysophospholipid transporter LplT  36.11 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120469  hitchhiker  0.000572662 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3155  lysophospholipid transporter LplT  35.86 
 
 		 387 aa  204  3e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00836608  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3027  lysophospholipid transporter LplT  35.86 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0880  lysophospholipid transporter LplT  35.86 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16932  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02683  predicted inner membrane protein  35.61 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.018578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0855  major facilitator superfamily MFS_1  35.61 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.191502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02644  hypothetical protein  35.61 
 
 		 397 aa  203  4e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0181673  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3222  lysophospholipid transporter LplT  37.12 
 
 		 400 aa  196  8.000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000276168 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3337  lysophospholipid transporter LplT  36.87 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3237  lysophospholipid transporter LplT  36.87 
 
 		 400 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000025684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3156  lysophospholipid transporter LplT  36.87 
 
 		 400 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.138727  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3174  lysophospholipid transporter LplT  36.87 
 
 		 400 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3276  lysophospholipid transporter LplT  36.52 
 
 		 397 aa  186  8e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.120069  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2465  lysophospholipid transporter LplT  33.99 
 
 		 403 aa  179  9e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3825  lysophospholipid transporter LplT  33.51 
 
 		 419 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0009  hypothetical protein  25.43 
 
 		 559 aa  71.6  0.00000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.854507  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4052  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28 
 
 		 1155 aa  69.7  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.378016 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0921  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  25.91 
 
 		 1170 aa  69.7  0.0000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0339  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.61 
 
 		 888 aa  64.7  0.000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169342 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1923  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.3 
 
 		 1150 aa  61.2  0.00000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  24.62 
 
 		 429 aa  59.7  0.00000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  25.34 
 
 		 1131 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1480  AMP-dependent synthetase and ligase  26.57 
 
 		 1049 aa  57.8  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.529566  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0302  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.76 
 
 		 1124 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  24.07 
 
 		 635 aa  56.6  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.33 
 
 		 632 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667029  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2768  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.06 
 
 		 645 aa  54.7  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0852  major facilitator transporter  25.54 
 
 		 442 aa  54.7  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.03 
 
 		 635 aa  54.3  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  21.53 
 
 		 644 aa  53.9  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.34 
 
 		 635 aa  53.9  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1340  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.12 
 
 		 644 aa  53.5  0.000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203495  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0197  major facilitator superfamily MFS_1  26.41 
 
 		 430 aa  52.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31792 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000570  lysophospholipid transporter LplT/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase/acyl-[acyl-carrier-protein] synthetase  30.91 
 
 		 617 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.66 
 
 		 644 aa  51.6  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1182  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.09 
 
 		 601 aa  51.2  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.61 
 
 		 644 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3179  major facilitator transporter  26.02 
 
 		 445 aa  51.2  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.61 
 
 		 644 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1790  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.07 
 
 		 644 aa  51.2  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1380  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.89 
 
 		 644 aa  51.6  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.856404  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1334  major facilitator transporter  21.77 
 
 		 440 aa  50.8  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0164505  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01437  hypothetical protein  19.74 
 
 		 624 aa  50.4  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>