167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0130 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0228  lysophospholipid transporter LplT  75.81 
 
 
434 aa  648    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0487  lysophospholipid transporter LplT  76.65 
 
 
427 aa  655    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0192  lysophospholipid transporter LplT  91.08 
 
 
426 aa  757    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0252  lysophospholipid transporter LplT  79.58 
 
 
426 aa  647    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.697841  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0130  lysophospholipid transporter LplT  100 
 
 
426 aa  852    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3563  lysophospholipid transporter LplT  81.09 
 
 
425 aa  657    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738442  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4338  lysophospholipid transporter LplT  74.42 
 
 
434 aa  630  1e-179  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497133  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0193  lysophospholipid transporter LplT  79.01 
 
 
425 aa  623  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0175  lysophospholipid transporter LplT  79.01 
 
 
425 aa  623  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0310  lysophospholipid transporter LplT  77.03 
 
 
433 aa  618  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571757  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0921  lysophospholipid transporter LplT  76.87 
 
 
417 aa  613  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2116  lysophospholipid transporter LplT  57.31 
 
 
424 aa  459  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0816109  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1984  lysophospholipid transporter LplT  54.93 
 
 
421 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.943557  normal  0.503134 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0918  lysophospholipid transporter LplT  53.15 
 
 
439 aa  418  9.999999999999999e-116  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2254  lysophospholipid transporter LplT  54.07 
 
 
416 aa  410  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0274694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1576  lysophospholipid transporter LplT  51.76 
 
 
435 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2006  lysophospholipid transporter LplT  51.76 
 
 
435 aa  402  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.920099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2079  lysophospholipid transporter LplT  51.76 
 
 
451 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3233  lysophospholipid transporter LplT  51.76 
 
 
435 aa  402  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2459  lysophospholipid transporter LplT  51.76 
 
 
435 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2515  lysophospholipid transporter LplT  51.76 
 
 
451 aa  401  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1351  lysophospholipid transporter LplT  51.76 
 
 
451 aa  401  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0425999  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0924  lysophospholipid transporter LplT  51.52 
 
 
439 aa  403  1e-111  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358434  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1399  lysophospholipid transporter LplT  50.45 
 
 
439 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344137  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1935  lysophospholipid transporter LplT  50.45 
 
 
439 aa  391  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1659  lysophospholipid transporter LplT  52.59 
 
 
435 aa  390  1e-107  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2478  lysophospholipid transporter LplT  52.36 
 
 
435 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00685032  hitchhiker  0.000365442 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1309  lysophospholipid transporter LplT  51.13 
 
 
459 aa  386  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00718572  normal  0.641684 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1243  lysophospholipid transporter LplT  50.9 
 
 
438 aa  385  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.621114  normal  0.61438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1370  lysophospholipid transporter LplT  50.23 
 
 
438 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495863  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1237  lysophospholipid transporter LplT  52.15 
 
 
435 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111638  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5349  lysophospholipid transporter LplT  51.47 
 
 
435 aa  376  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2072  lysophospholipid transporter LplT  51.7 
 
 
435 aa  376  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1941  lysophospholipid transporter LplT  51.7 
 
 
435 aa  375  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23021  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6037  lysophospholipid transporter LplT  51.47 
 
 
435 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00485648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2040  lysophospholipid transporter LplT  51.47 
 
 
435 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2059  lysophospholipid transporter LplT  51.47 
 
 
435 aa  374  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690395  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1360  lysophospholipid transporter LplT  52.83 
 
 
435 aa  367  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400327  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2310  lysophospholipid transporter LplT  47.92 
 
 
389 aa  358  9e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766456 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1718  lysophospholipid transporter LplT  46.47 
 
 
405 aa  343  4e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.964759 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1398  lysophospholipid transporter LplT  43.71 
 
 
432 aa  301  1e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295071 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1618  lysophospholipid transporter LplT  44.58 
 
 
432 aa  300  5e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2519  lysophospholipid transporter LplT  44.34 
 
 
432 aa  295  7e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177728  hitchhiker  0.00000217459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1454  lysophospholipid transporter LplT  50 
 
 
422 aa  287  2e-76  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812934  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1811  major facilitator superfamily MFS_1  41.44 
 
 
406 aa  259  9e-68  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2630  lysophospholipid transporter LplT  40.1 
 
 
403 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0751  lysophospholipid transporter LplT  37.2 
 
 
415 aa  244  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3608  lysophospholipid transporter LplT  40.8 
 
 
422 aa  242  7e-63  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3462  lysophospholipid transporter LplT  37.81 
 
 
407 aa  224  2e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3829  lysophospholipid transporter LplT  39.04 
 
 
398 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3616  lysophospholipid transporter LplT  37.56 
 
 
407 aa  222  8e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0976  lysophospholipid transporter LplT  39.16 
 
 
406 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3245  lysophospholipid transporter LplT  39.16 
 
 
406 aa  219  6e-56  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0158938  hitchhiker  0.00481427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1028  lysophospholipid transporter LplT  39.16 
 
 
406 aa  219  6e-56  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2982  lysophospholipid transporter LplT  37.78 
 
 
397 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0020769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2983  lysophospholipid transporter LplT  37.78 
 
 
397 aa  218  2e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0384881  normal  0.021461 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02683  predicted inner membrane protein  37.53 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.018578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0855  major facilitator superfamily MFS_1  37.53 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.191502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4102  lysophospholipid transporter LplT  37.78 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120469  hitchhiker  0.000572662 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3027  lysophospholipid transporter LplT  37.53 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02644  hypothetical protein  37.53 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0181673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0880  lysophospholipid transporter LplT  37.53 
 
 
397 aa  217  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16932  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3155  lysophospholipid transporter LplT  37.53 
 
 
387 aa  216  4e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00836608  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0767  lysophospholipid transporter LplT  36.73 
 
 
404 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3276  lysophospholipid transporter LplT  38.61 
 
 
397 aa  201  1.9999999999999998e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.120069  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3222  lysophospholipid transporter LplT  38.24 
 
 
400 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000276168 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3237  lysophospholipid transporter LplT  37.99 
 
 
400 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000025684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3337  lysophospholipid transporter LplT  37.99 
 
 
400 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044358 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3156  lysophospholipid transporter LplT  37.99 
 
 
400 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.138727  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3174  lysophospholipid transporter LplT  37.99 
 
 
400 aa  194  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3825  lysophospholipid transporter LplT  32.41 
 
 
419 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339646  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2465  lysophospholipid transporter LplT  34.63 
 
 
403 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0009  hypothetical protein  25.19 
 
 
559 aa  80.1  0.00000000000006  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.854507  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.56 
 
 
635 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.45 
 
 
635 aa  71.6  0.00000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.3 
 
 
632 aa  70.9  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667029  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  25.81 
 
 
635 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  24.37 
 
 
604 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  24.37 
 
 
604 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  24.37 
 
 
644 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  24.37 
 
 
644 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  24.37 
 
 
644 aa  67.4  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2768  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.17 
 
 
645 aa  66.6  0.0000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0852  major facilitator transporter  33.52 
 
 
442 aa  64.3  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0169  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.43 
 
 
625 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  22.44 
 
 
644 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1359  lysophospholipid exporter/ 2-acylglycerolphosphoethanolamine acyltransferase  23.64 
 
 
645 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.526954 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4052  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  24.2 
 
 
1155 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.378016 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0921  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  22.87 
 
 
1170 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  24.11 
 
 
644 aa  62  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1790  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.69 
 
 
644 aa  61.2  0.00000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236917  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.53 
 
 
626 aa  60.8  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.61 
 
 
1128 aa  60.8  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.19 
 
 
644 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.19 
 
 
644 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.19 
 
 
644 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  29.19 
 
 
429 aa  59.3  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1340  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.19 
 
 
644 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203495  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1380  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.19 
 
 
644 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.856404  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1923  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.16 
 
 
1150 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>