210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3462 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0751  lysophospholipid transporter LplT  81.34 
 
 		 415 aa  655    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3462  lysophospholipid transporter LplT  100 
 
 		 407 aa  800    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3616  lysophospholipid transporter LplT  94.84 
 
 		 407 aa  746    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0767  lysophospholipid transporter LplT  79.8 
 
 		 404 aa  593  1e-168  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1028  lysophospholipid transporter LplT  75.31 
 
 		 406 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3245  lysophospholipid transporter LplT  75.31 
 
 		 406 aa  556  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0158938  hitchhiker  0.00481427 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0976  lysophospholipid transporter LplT  75.31 
 
 		 406 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12769  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02683  predicted inner membrane protein  73.57 
 
 		 397 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.018578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0855  major facilitator superfamily MFS_1  73.57 
 
 		 397 aa  549  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.191502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0880  lysophospholipid transporter LplT  73.57 
 
 		 397 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2983  lysophospholipid transporter LplT  73.82 
 
 		 397 aa  550  1e-155  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0384881  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2982  lysophospholipid transporter LplT  73.82 
 
 		 397 aa  550  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0020769  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02644  hypothetical protein  73.57 
 
 		 397 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0181673  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3027  lysophospholipid transporter LplT  73.57 
 
 		 397 aa  549  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4102  lysophospholipid transporter LplT  73.57 
 
 		 397 aa  547  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120469  hitchhiker  0.000572662 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3155  lysophospholipid transporter LplT  74.81 
 
 		 387 aa  541  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00836608  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3829  lysophospholipid transporter LplT  74.88 
 
 		 398 aa  542  1e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3222  lysophospholipid transporter LplT  74.94 
 
 		 400 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000276168 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3156  lysophospholipid transporter LplT  74.94 
 
 		 400 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.138727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3337  lysophospholipid transporter LplT  74.94 
 
 		 400 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3237  lysophospholipid transporter LplT  74.94 
 
 		 400 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000025684 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3276  lysophospholipid transporter LplT  74.75 
 
 		 397 aa  528  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.120069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3174  lysophospholipid transporter LplT  74.44 
 
 		 400 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2630  lysophospholipid transporter LplT  53.98 
 
 		 403 aa  355  7.999999999999999e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1811  major facilitator superfamily MFS_1  45.89 
 
 		 406 aa  332  9e-90  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2310  lysophospholipid transporter LplT  42.55 
 
 		 389 aa  293  4e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766456 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1718  lysophospholipid transporter LplT  41.22 
 
 		 405 aa  272  6e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.964759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2254  lysophospholipid transporter LplT  37.28 
 
 		 416 aa  262  8e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0274694  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2116  lysophospholipid transporter LplT  39.04 
 
 		 424 aa  261  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0816109  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0918  lysophospholipid transporter LplT  38.98 
 
 		 439 aa  258  1e-67  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2006  lysophospholipid transporter LplT  37.3 
 
 		 435 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.920099  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3825  lysophospholipid transporter LplT  40.94 
 
 		 419 aa  246  6e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339646  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1576  lysophospholipid transporter LplT  36.6 
 
 		 435 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3233  lysophospholipid transporter LplT  36.6 
 
 		 435 aa  245  8e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2459  lysophospholipid transporter LplT  36.6 
 
 		 435 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2079  lysophospholipid transporter LplT  36.6 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749328  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2515  lysophospholipid transporter LplT  36.6 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1351  lysophospholipid transporter LplT  36.6 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0425999  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1659  lysophospholipid transporter LplT  36.56 
 
 		 435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2478  lysophospholipid transporter LplT  36.08 
 
 		 435 aa  243  6e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00685032  hitchhiker  0.000365442 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1237  lysophospholipid transporter LplT  38.68 
 
 		 435 aa  240  4e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111638  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1360  lysophospholipid transporter LplT  38.52 
 
 		 435 aa  239  5e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2465  lysophospholipid transporter LplT  41.03 
 
 		 403 aa  239  8e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2072  lysophospholipid transporter LplT  38.21 
 
 		 435 aa  237  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5349  lysophospholipid transporter LplT  37.74 
 
 		 435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1941  lysophospholipid transporter LplT  38.21 
 
 		 435 aa  236  6e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23021  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1984  lysophospholipid transporter LplT  40.1 
 
 		 421 aa  236  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.943557  normal  0.503134 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2059  lysophospholipid transporter LplT  37.97 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690395  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6037  lysophospholipid transporter LplT  37.97 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00485648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2040  lysophospholipid transporter LplT  37.97 
 
 		 435 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0924  lysophospholipid transporter LplT  36.32 
 
 		 439 aa  231  1e-59  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0487  lysophospholipid transporter LplT  37.4 
 
 		 427 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1309  lysophospholipid transporter LplT  37.85 
 
 		 459 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00718572  normal  0.641684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0921  lysophospholipid transporter LplT  37.35 
 
 		 417 aa  226  4e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1243  lysophospholipid transporter LplT  37.62 
 
 		 438 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.621114  normal  0.61438 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1370  lysophospholipid transporter LplT  36.68 
 
 		 438 aa  225  1e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0192  lysophospholipid transporter LplT  37.06 
 
 		 426 aa  222  8e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0228  lysophospholipid transporter LplT  38.2 
 
 		 434 aa  219  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0252  lysophospholipid transporter LplT  36.65 
 
 		 426 aa  219  6e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.697841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0193  lysophospholipid transporter LplT  38.56 
 
 		 425 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0175  lysophospholipid transporter LplT  38.56 
 
 		 425 aa  219  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1399  lysophospholipid transporter LplT  39.33 
 
 		 439 aa  218  1e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344137  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4338  lysophospholipid transporter LplT  36.9 
 
 		 434 aa  218  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1935  lysophospholipid transporter LplT  37.41 
 
 		 439 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0130  lysophospholipid transporter LplT  37.31 
 
 		 426 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1618  lysophospholipid transporter LplT  36.94 
 
 		 432 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2519  lysophospholipid transporter LplT  36.71 
 
 		 432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177728  hitchhiker  0.00000217459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1454  lysophospholipid transporter LplT  39.5 
 
 		 422 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3563  lysophospholipid transporter LplT  37.38 
 
 		 425 aa  211  2e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3608  lysophospholipid transporter LplT  38.48 
 
 		 422 aa  210  4e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1398  lysophospholipid transporter LplT  36 
 
 		 432 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0310  lysophospholipid transporter LplT  35.66 
 
 		 433 aa  204  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  28.31 
 
 		 626 aa  93.2  8e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0339  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.38 
 
 		 888 aa  87.4  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3595  major facilitator transporter  27.27 
 
 		 438 aa  85.9  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.61 
 
 		 635 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.18 
 
 		 645 aa  85.5  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1480  AMP-dependent synthetase and ligase  28.81 
 
 		 1049 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.529566  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.76 
 
 		 635 aa  82  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  27.41 
 
 		 635 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  25.42 
 
 		 644 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  25.86 
 
 		 644 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  25.86 
 
 		 644 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  25.86 
 
 		 644 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  25.86 
 
 		 604 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  25.86 
 
 		 604 aa  80.1  0.00000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  27.64 
 
 		 1128 aa  79  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  27.37 
 
 		 644 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.98 
 
 		 1136 aa  77.4  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004025  hypothetical protein  27.01 
 
 		 624 aa  77.4  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0141461  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1153  major facilitator transporter  22.37 
 
 		 431 aa  75.9  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1136  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.76 
 
 		 634 aa  75.5  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.85 
 
 		 644 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.85 
 
 		 644 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.85 
 
 		 644 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1690  major facilitator transporter  26.11 
 
 		 446 aa  74.7  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.86317 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1380  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.06 
 
 		 644 aa  74.7  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.856404  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1511  major facilitator transporter  26.04 
 
 		 446 aa  74.3  0.000000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2768  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.29 
 
 		 645 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1359  lysophospholipid exporter/ 2-acylglycerolphosphoethanolamine acyltransferase  26.28 
 
 		 645 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.526954 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>