217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3027 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02683  predicted inner membrane protein  99.75 
 
 
397 aa  780    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.018578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0855  major facilitator superfamily MFS_1  99.75 
 
 
397 aa  780    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.191502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02644  hypothetical protein  99.75 
 
 
397 aa  780    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0181673  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0880  lysophospholipid transporter LplT  100 
 
 
397 aa  781    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16932  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4102  lysophospholipid transporter LplT  99.5 
 
 
397 aa  777    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120469  hitchhiker  0.000572662 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2983  lysophospholipid transporter LplT  99.75 
 
 
397 aa  780    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0384881  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3222  lysophospholipid transporter LplT  88.41 
 
 
400 aa  634    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000276168 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3027  lysophospholipid transporter LplT  100 
 
 
397 aa  781    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2982  lysophospholipid transporter LplT  99.5 
 
 
397 aa  778    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0020769  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3155  lysophospholipid transporter LplT  99.74 
 
 
387 aa  759    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00836608  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3156  lysophospholipid transporter LplT  88.66 
 
 
400 aa  630  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.138727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3337  lysophospholipid transporter LplT  88.66 
 
 
400 aa  630  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0044358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3237  lysophospholipid transporter LplT  88.92 
 
 
400 aa  631  1e-180  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000025684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3174  lysophospholipid transporter LplT  88.66 
 
 
400 aa  629  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3276  lysophospholipid transporter LplT  85.39 
 
 
397 aa  617  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.120069  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0751  lysophospholipid transporter LplT  75.57 
 
 
415 aa  596  1e-169  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3462  lysophospholipid transporter LplT  73.57 
 
 
407 aa  567  1e-161  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3829  lysophospholipid transporter LplT  77.53 
 
 
398 aa  566  1e-160  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3616  lysophospholipid transporter LplT  72.25 
 
 
407 aa  558  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0976  lysophospholipid transporter LplT  74.31 
 
 
406 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12769  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1028  lysophospholipid transporter LplT  74.31 
 
 
406 aa  550  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3245  lysophospholipid transporter LplT  74.31 
 
 
406 aa  550  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0158938  hitchhiker  0.00481427 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0767  lysophospholipid transporter LplT  74.42 
 
 
404 aa  550  1e-155  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2630  lysophospholipid transporter LplT  54.14 
 
 
403 aa  367  1e-100  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1811  major facilitator superfamily MFS_1  51.29 
 
 
406 aa  364  1e-99  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2310  lysophospholipid transporter LplT  43.23 
 
 
389 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766456 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1718  lysophospholipid transporter LplT  41.54 
 
 
405 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.964759 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2116  lysophospholipid transporter LplT  40.25 
 
 
424 aa  262  6.999999999999999e-69  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0816109  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0918  lysophospholipid transporter LplT  38.92 
 
 
439 aa  253  4.0000000000000004e-66  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1576  lysophospholipid transporter LplT  38.1 
 
 
435 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2006  lysophospholipid transporter LplT  38.1 
 
 
435 aa  248  1e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.920099  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2079  lysophospholipid transporter LplT  38.26 
 
 
451 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749328  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3233  lysophospholipid transporter LplT  38.1 
 
 
435 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2459  lysophospholipid transporter LplT  38.1 
 
 
435 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2515  lysophospholipid transporter LplT  38.26 
 
 
451 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1351  lysophospholipid transporter LplT  38.26 
 
 
451 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0425999  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2254  lysophospholipid transporter LplT  37.59 
 
 
416 aa  246  6.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0274694  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3825  lysophospholipid transporter LplT  42.11 
 
 
419 aa  244  9.999999999999999e-64  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339646  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2478  lysophospholipid transporter LplT  38.57 
 
 
435 aa  241  1e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00685032  hitchhiker  0.000365442 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5349  lysophospholipid transporter LplT  38.33 
 
 
435 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2465  lysophospholipid transporter LplT  41.18 
 
 
403 aa  240  4e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1237  lysophospholipid transporter LplT  38.33 
 
 
435 aa  239  5.999999999999999e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111638  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1659  lysophospholipid transporter LplT  38.1 
 
 
435 aa  238  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1360  lysophospholipid transporter LplT  39.05 
 
 
435 aa  237  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400327  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0924  lysophospholipid transporter LplT  37.97 
 
 
439 aa  236  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358434  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2072  lysophospholipid transporter LplT  38.81 
 
 
435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6037  lysophospholipid transporter LplT  37.86 
 
 
435 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00485648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2040  lysophospholipid transporter LplT  37.86 
 
 
435 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2059  lysophospholipid transporter LplT  37.86 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690395  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1941  lysophospholipid transporter LplT  38.57 
 
 
435 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23021  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0487  lysophospholipid transporter LplT  37.53 
 
 
427 aa  234  3e-60  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1984  lysophospholipid transporter LplT  39.7 
 
 
421 aa  231  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.943557  normal  0.503134 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1935  lysophospholipid transporter LplT  37.94 
 
 
439 aa  228  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1370  lysophospholipid transporter LplT  39.34 
 
 
438 aa  228  2e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495863  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1399  lysophospholipid transporter LplT  36.88 
 
 
439 aa  226  4e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344137  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0192  lysophospholipid transporter LplT  37.75 
 
 
426 aa  222  7e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0228  lysophospholipid transporter LplT  37.05 
 
 
434 aa  221  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1243  lysophospholipid transporter LplT  38.86 
 
 
438 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.621114  normal  0.61438 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1309  lysophospholipid transporter LplT  39.1 
 
 
459 aa  220  3.9999999999999997e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00718572  normal  0.641684 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0193  lysophospholipid transporter LplT  37.78 
 
 
425 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0175  lysophospholipid transporter LplT  37.78 
 
 
425 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4338  lysophospholipid transporter LplT  38.13 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497133  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0252  lysophospholipid transporter LplT  36.76 
 
 
426 aa  213  2.9999999999999995e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.697841  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0130  lysophospholipid transporter LplT  37.28 
 
 
426 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1454  lysophospholipid transporter LplT  39.8 
 
 
422 aa  212  1e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812934  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0921  lysophospholipid transporter LplT  35.86 
 
 
417 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3608  lysophospholipid transporter LplT  38.52 
 
 
422 aa  211  2e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3563  lysophospholipid transporter LplT  36.52 
 
 
425 aa  209  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738442  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1618  lysophospholipid transporter LplT  37.47 
 
 
432 aa  203  4e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2519  lysophospholipid transporter LplT  37.23 
 
 
432 aa  203  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177728  hitchhiker  0.00000217459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0310  lysophospholipid transporter LplT  35.82 
 
 
433 aa  203  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571757  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1398  lysophospholipid transporter LplT  35.95 
 
 
432 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295071 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  28.82 
 
 
626 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 
626 aa  93.2  7e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1511  major facilitator transporter  28.42 
 
 
446 aa  91.7  2e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1480  AMP-dependent synthetase and ligase  28.53 
 
 
1049 aa  89.7  9e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.529566  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.78 
 
 
635 aa  89.4  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  28.57 
 
 
635 aa  88.2  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  27.71 
 
 
429 aa  88.6  2e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.68 
 
 
645 aa  88.2  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297196  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2768  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.16 
 
 
645 aa  86.3  0.000000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1359  lysophospholipid exporter/ 2-acylglycerolphosphoethanolamine acyltransferase  27.92 
 
 
645 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.526954 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1690  major facilitator transporter  27.89 
 
 
446 aa  85.1  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.86317 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  29.31 
 
 
1128 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01437  hypothetical protein  26.23 
 
 
624 aa  83.6  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.2 
 
 
632 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667029  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0339  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.57 
 
 
888 aa  83.6  0.000000000000006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169342 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.98 
 
 
635 aa  83.6  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  27.25 
 
 
1136 aa  83.2  0.000000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1136  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.9 
 
 
634 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492362  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004025  hypothetical protein  27.09 
 
 
624 aa  82.4  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0141461  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  27.4 
 
 
644 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0009  hypothetical protein  27.47 
 
 
559 aa  80.9  0.00000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.854507  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3595  major facilitator transporter  25.19 
 
 
438 aa  80.5  0.00000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  25.8 
 
 
604 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  25.8 
 
 
604 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  25.8 
 
 
644 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0309  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.47 
 
 
658 aa  80.5  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  25.8 
 
 
644 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  25.8 
 
 
644 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>