157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3608 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3608  lysophospholipid transporter LplT  100 
 
 		 422 aa  807    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0135352 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1454  lysophospholipid transporter LplT  57.32 
 
 		 422 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.812934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0918  lysophospholipid transporter LplT  44.32 
 
 		 439 aa  323  3e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2116  lysophospholipid transporter LplT  43.95 
 
 		 424 aa  318  7.999999999999999e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0816109  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2254  lysophospholipid transporter LplT  42.62 
 
 		 416 aa  312  5.999999999999999e-84  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0274694  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2310  lysophospholipid transporter LplT  42.26 
 
 		 389 aa  307  3e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766456 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1659  lysophospholipid transporter LplT  45.81 
 
 		 435 aa  306  5.0000000000000004e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0220849 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2478  lysophospholipid transporter LplT  45.81 
 
 		 435 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00685032  hitchhiker  0.000365442 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2006  lysophospholipid transporter LplT  43.95 
 
 		 435 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.920099  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0924  lysophospholipid transporter LplT  43.23 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.358434  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1576  lysophospholipid transporter LplT  43.72 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3233  lysophospholipid transporter LplT  43.72 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2459  lysophospholipid transporter LplT  43.72 
 
 		 435 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.686285  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2079  lysophospholipid transporter LplT  43.72 
 
 		 451 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.749328  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2515  lysophospholipid transporter LplT  43.72 
 
 		 451 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.931365  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1351  lysophospholipid transporter LplT  43.72 
 
 		 451 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0425999  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1370  lysophospholipid transporter LplT  45.83 
 
 		 438 aa  296  4e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0495863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1984  lysophospholipid transporter LplT  43.99 
 
 		 421 aa  290  3e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.943557  normal  0.503134 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1309  lysophospholipid transporter LplT  44.27 
 
 		 459 aa  290  3e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00718572  normal  0.641684 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1718  lysophospholipid transporter LplT  41.67 
 
 		 405 aa  288  1e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.964759 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1243  lysophospholipid transporter LplT  44.04 
 
 		 438 aa  288  1e-76  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.621114  normal  0.61438 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1399  lysophospholipid transporter LplT  44.88 
 
 		 439 aa  286  5.999999999999999e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.344137  normal  0.653386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2072  lysophospholipid transporter LplT  43.95 
 
 		 435 aa  285  8e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1237  lysophospholipid transporter LplT  45.12 
 
 		 435 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.111638  normal  0.26899 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5349  lysophospholipid transporter LplT  43.72 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.229908 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6037  lysophospholipid transporter LplT  43.95 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00485648  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2040  lysophospholipid transporter LplT  43.95 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2059  lysophospholipid transporter LplT  43.95 
 
 		 435 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.690395  normal  0.425286 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1935  lysophospholipid transporter LplT  44.29 
 
 		 439 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134651  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1360  lysophospholipid transporter LplT  43.72 
 
 		 435 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.400327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1941  lysophospholipid transporter LplT  43.72 
 
 		 435 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.23021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4338  lysophospholipid transporter LplT  42.62 
 
 		 434 aa  276  6e-73  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.497133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0487  lysophospholipid transporter LplT  41.04 
 
 		 427 aa  276  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1398  lysophospholipid transporter LplT  43.36 
 
 		 432 aa  268  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295071 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0921  lysophospholipid transporter LplT  40.81 
 
 		 417 aa  265  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0192  lysophospholipid transporter LplT  41.06 
 
 		 426 aa  256  4e-67  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.578876  normal  0.814713 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0228  lysophospholipid transporter LplT  39.58 
 
 		 434 aa  256  7e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.582163  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3563  lysophospholipid transporter LplT  40.49 
 
 		 425 aa  255  9e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.738442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0252  lysophospholipid transporter LplT  40.8 
 
 		 426 aa  255  1.0000000000000001e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.697841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0175  lysophospholipid transporter LplT  41.81 
 
 		 425 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0193  lysophospholipid transporter LplT  41.81 
 
 		 425 aa  253  5.000000000000001e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0751  lysophospholipid transporter LplT  38.31 
 
 		 415 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0310  lysophospholipid transporter LplT  41.25 
 
 		 433 aa  245  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.571757  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2519  lysophospholipid transporter LplT  43.47 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0177728  hitchhiker  0.00000217459 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0130  lysophospholipid transporter LplT  40.55 
 
 		 426 aa  244  3e-63  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1618  lysophospholipid transporter LplT  43.47 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2630  lysophospholipid transporter LplT  39.56 
 
 		 403 aa  237  3e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3462  lysophospholipid transporter LplT  38.48 
 
 		 407 aa  231  3e-59  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3616  lysophospholipid transporter LplT  38.39 
 
 		 407 aa  229  5e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0976  lysophospholipid transporter LplT  39.04 
 
 		 406 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.12769  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3245  lysophospholipid transporter LplT  39.04 
 
 		 406 aa  229  7e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0158938  hitchhiker  0.00481427 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1028  lysophospholipid transporter LplT  39.04 
 
 		 406 aa  229  7e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02683  predicted inner membrane protein  38.27 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.018578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0855  major facilitator superfamily MFS_1  38.27 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.191502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2982  lysophospholipid transporter LplT  38.27 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0020769  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02644  hypothetical protein  38.27 
 
 		 397 aa  227  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0181673  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3829  lysophospholipid transporter LplT  37.94 
 
 		 398 aa  226  4e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.105644  normal  0.48267 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2983  lysophospholipid transporter LplT  38.27 
 
 		 397 aa  226  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0384881  normal  0.021461 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3027  lysophospholipid transporter LplT  38.27 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000492814  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3155  lysophospholipid transporter LplT  38.27 
 
 		 387 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00836608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0880  lysophospholipid transporter LplT  38.27 
 
 		 397 aa  226  5.0000000000000005e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.16932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4102  lysophospholipid transporter LplT  38.02 
 
 		 397 aa  224  2e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0120469  hitchhiker  0.000572662 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0767  lysophospholipid transporter LplT  36.86 
 
 		 404 aa  223  4.9999999999999996e-57  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.655662  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1811  major facilitator superfamily MFS_1  37.62 
 
 		 406 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3222  lysophospholipid transporter LplT  37.87 
 
 		 400 aa  199  7e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000276168 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3276  lysophospholipid transporter LplT  36.61 
 
 		 397 aa  198  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.120069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3156  lysophospholipid transporter LplT  37.87 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.138727  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3337  lysophospholipid transporter LplT  37.87 
 
 		 400 aa  197  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044358 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3237  lysophospholipid transporter LplT  37.62 
 
 		 400 aa  197  4.0000000000000005e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000025684 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3174  lysophospholipid transporter LplT  37.62 
 
 		 400 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2465  lysophospholipid transporter LplT  35.45 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.582194  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3825  lysophospholipid transporter LplT  29.72 
 
 		 419 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.339646  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.16 
 
 		 1136 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2776  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  30.58 
 
 		 1129 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  30.52 
 
 		 1131 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.15 
 
 		 1128 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4052  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  27.07 
 
 		 1155 aa  75.9  0.000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.378016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.61 
 
 		 1114 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0921  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  23.68 
 
 		 1170 aa  67.8  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3365  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.57 
 
 		 1146 aa  66.2  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0009  hypothetical protein  23.85 
 
 		 559 aa  63.2  0.000000008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.854507  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1480  AMP-dependent synthetase and ligase  27.07 
 
 		 1049 aa  62.4  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.529566  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0955  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  24.18 
 
 		 1170 aa  62  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000517979  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1016  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  24.18 
 
 		 1170 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  25.73 
 
 		 644 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  25.73 
 
 		 604 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  25.73 
 
 		 604 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  25.73 
 
 		 644 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  25.79 
 
 		 644 aa  59.7  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0187  acyltransferase family protein  24.92 
 
 		 618 aa  59.7  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1714  major facilitator transporter  35.33 
 
 		 538 aa  59.3  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2369  AMP-dependent synthetase and ligase  29.07 
 
 		 1185 aa  58.9  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  25.39 
 
 		 429 aa  58.5  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  25.27 
 
 		 644 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2756  major facilitator transporter  24.29 
 
 		 420 aa  57.8  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.366084  normal  0.663227 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  26.19 
 
 		 644 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.19 
 
 		 644 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.19 
 
 		 644 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.19 
 
 		 644 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1923  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  24.83 
 
 		 1150 aa  57.4  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>