88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0040 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0040  FHA domain-containing protein  100 
 
 
580 aa  1189    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1334  FHA domain-containing protein  21.65 
 
 
520 aa  84.3  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  36.78 
 
 
268 aa  60.1  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  40.51 
 
 
238 aa  57.4  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  37.11 
 
 
242 aa  55.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3629  Forkhead-associated protein  49.06 
 
 
222 aa  55.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  36.7 
 
 
241 aa  54.7  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3863  FHA domain-containing protein  34.02 
 
 
503 aa  54.3  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.312796  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3056  putative adenylate/guanylate cyclase  33.64 
 
 
310 aa  53.9  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  42.11 
 
 
1004 aa  53.9  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1501  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
155 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.821183  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0049  FHA domain-containing protein  38.71 
 
 
245 aa  52.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  hitchhiker  0.0038838  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2478  FHA domain containing protein  48.53 
 
 
142 aa  52.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3436  FHA domain-containing protein  31.31 
 
 
244 aa  52.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  40.38 
 
 
475 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0117  FHA domain-containing protein-like protein  38.71 
 
 
246 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332756  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0511  FHA domain containing protein  27.71 
 
 
475 aa  52  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0042  FHA domain-containing protein  32.14 
 
 
262 aa  52  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179739  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3427  hypothetical protein  39.71 
 
 
503 aa  51.2  0.00005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281438  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  38.71 
 
 
153 aa  51.2  0.00005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0103  FHA domain containing protein  42.37 
 
 
189 aa  50.8  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0428649  normal  0.0274724 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4708  FHA domain containing protein  32.47 
 
 
173 aa  50.8  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.974304 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2521  FHA domain-containing protein  31.71 
 
 
946 aa  50.8  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.295094 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  37.35 
 
 
242 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0237  ATP-binding region ATPase domain protein  41.54 
 
 
567 aa  50.4  0.00008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0047  FHA domain-containing protein  30.95 
 
 
253 aa  50.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.183651 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  41.27 
 
 
181 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1844  protein kinase  35.71 
 
 
485 aa  50.4  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3658  winged helix family two component response transcriptional regulator  62.5 
 
 
220 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  27.27 
 
 
890 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1259  peptidoglycan glycosyltransferase  32.89 
 
 
707 aa  49.7  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  33.33 
 
 
863 aa  48.5  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2459  ABC transporter related protein  38.18 
 
 
848 aa  48.5  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.584906  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3047  FHA domain-containing protein  28.81 
 
 
275 aa  48.9  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2967  winged helix family two component response transcriptional regulator  44.64 
 
 
218 aa  48.5  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0900  FHA domain-containing protein  38.6 
 
 
553 aa  48.1  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2434  FHA domain-containing protein  30.51 
 
 
284 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0872027  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1823  FHA domain-containing protein  29.27 
 
 
863 aa  48.1  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.997566  normal  0.104099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  34.18 
 
 
387 aa  47.8  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4172  FHA domain containing protein  32.89 
 
 
174 aa  47.4  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.815864 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0027  FHA domain containing protein  35.38 
 
 
420 aa  47.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.340956  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  32.73 
 
 
279 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4924  FHA domain-containing protein  36 
 
 
234 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.219389 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0424  FHA domain-containing protein  37.93 
 
 
377 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3867  forkhead-associated protein  46.51 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.500687  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92878  predicted protein  31.43 
 
 
424 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.1562  normal  0.0599879 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3130  putative serine protease  46.51 
 
 
404 aa  46.6  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0656366  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0856  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 
350 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.238934  hitchhiker  0.00191471 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  35.48 
 
 
253 aa  46.2  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4251  adenylate/guanylate cyclase  35.9 
 
 
329 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0807757  hitchhiker  0.000000663709 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  31.33 
 
 
851 aa  45.8  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3733  FHA domain containing protein  37.74 
 
 
172 aa  45.8  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  0.0527204 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4212  adenylate/guanylate cyclase  35.9 
 
 
329 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3837  FHA domain-containing protein  31.96 
 
 
853 aa  45.8  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.928431 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  37.93 
 
 
252 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14970  FHA domain-containing protein  39.68 
 
 
152 aa  45.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0364194  normal  0.592543 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3423  protein kinase  44.19 
 
 
402 aa  45.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0410909  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1480  winged helix family two component response transcriptional regulator  51.52 
 
 
221 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.723328 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0382  hypothetical protein  37.04 
 
 
318 aa  45.1  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0186101  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2125  FHA domain-containing protein  32.29 
 
 
282 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.473494  normal  0.523626 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0026  FHA domain-containing protein  34.29 
 
 
280 aa  45.4  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6477  FHA domain-containing protein  27.27 
 
 
246 aa  44.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0374778 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  36.84 
 
 
408 aa  45.1  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.43 
 
 
903 aa  45.1  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
428 aa  45.1  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1735  Forkhead-associated protein  32.2 
 
 
269 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.164124  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15338  predicted protein  28.42 
 
 
169 aa  45.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0117573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  38.46 
 
 
1167 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5407  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.18 
 
 
463 aa  44.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.453071 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0069  FHA domain containing protein  33.87 
 
 
250 aa  44.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2102  FHA domain containing protein  35.48 
 
 
174 aa  44.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27030  FHA domain-containing protein  35.29 
 
 
474 aa  44.3  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1030  serine/threonine kinase protein  30.51 
 
 
393 aa  44.7  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2321  FHA domain-containing protein  44.44 
 
 
97 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  54.55 
 
 
694 aa  44.3  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  28.92 
 
 
838 aa  44.3  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  37.7 
 
 
899 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2862  serine/threonine protein kinase with FHA domain protein  35.09 
 
 
461 aa  44.3  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0331912  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1667  FHA domain-containing protein  34.43 
 
 
346 aa  44.3  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.681171 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  39.66 
 
 
308 aa  44.3  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00420  FHA domain-containing protein  27.37 
 
 
406 aa  44.3  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.295501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8053  FHA repeat-domain-containing protein-like protein  38.33 
 
 
181 aa  43.9  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0730272  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2161  FHA domain-containing protein  42 
 
 
173 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000261776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2813  FHA domain-containing protein  32.79 
 
 
354 aa  43.9  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1462  FHA domain-containing protein  40 
 
 
173 aa  43.5  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.129326  normal  0.623454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2377  adenylate/guanylate cyclase  33.77 
 
 
395 aa  43.5  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  32.47 
 
 
856 aa  43.9  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0031  Forkhead-associated protein  28.46 
 
 
433 aa  43.9  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>