103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1334 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_1334  FHA domain-containing protein  100 
 
 
520 aa  1036    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0511  FHA domain containing protein  54.05 
 
 
475 aa  107  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000108248  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0040  FHA domain-containing protein  39.51 
 
 
580 aa  64.3  0.000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3045  FHA domain-containing protein  32.69 
 
 
174 aa  57  0.0000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000453276  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_92878  predicted protein  33.33 
 
 
424 aa  55.1  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.1562  normal  0.0599879 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0382  hypothetical protein  37.18 
 
 
318 aa  53.9  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0186101  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0424  FHA domain-containing protein  36 
 
 
377 aa  53.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  39.06 
 
 
238 aa  53.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3427  hypothetical protein  32.56 
 
 
503 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281438  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  43.24 
 
 
134 aa  51.6  0.00003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1501  FHA domain-containing protein  33.82 
 
 
155 aa  51.6  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.821183  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5712  diguanylate cyclase  28.74 
 
 
316 aa  51.2  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.54195  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02630  cell cycle arrest in response to pheromone-related protein, putative  42.31 
 
 
777 aa  50.4  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0184252  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0092  FHA domain containing protein  47.46 
 
 
219 aa  50.1  0.00009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3863  FHA domain-containing protein  31.4 
 
 
503 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.312796  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  36.11 
 
 
268 aa  49.7  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3658  winged helix family two component response transcriptional regulator  32.18 
 
 
220 aa  50.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0026  FHA domain containing protein  31.65 
 
 
247 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00162268 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2818  FHA domain-containing protein  29.63 
 
 
178 aa  50.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0028  FHA domain containing protein  32.47 
 
 
180 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.821389  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1735  Forkhead-associated protein  30 
 
 
269 aa  50.1  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.164124  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3047  FHA domain-containing protein  37.04 
 
 
275 aa  49.3  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1859  forkhead-associated protein  34.29 
 
 
341 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000328262 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3837  FHA domain-containing protein  31.33 
 
 
853 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.928431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1548  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  31.19 
 
 
1004 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.506154 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3464  FHA domain containing protein  35.9 
 
 
694 aa  48.9  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0731719  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1427  FHA domain containing protein  39.73 
 
 
245 aa  48.9  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3436  FHA domain-containing protein  36.47 
 
 
244 aa  48.1  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012558 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2319  FHA domain containing protein  40.74 
 
 
210 aa  48.1  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2434  FHA domain-containing protein  34.48 
 
 
284 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0872027  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1480  winged helix family two component response transcriptional regulator  32.93 
 
 
221 aa  47.8  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.723328 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  34.78 
 
 
513 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2693  FHA domain containing protein  31.88 
 
 
161 aa  47.4  0.0006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1341  FHA domain containing protein  31.65 
 
 
374 aa  47.4  0.0006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287423 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  49.12 
 
 
878 aa  47  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3999  FHA domain containing protein  28.92 
 
 
860 aa  47  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1770  FHA domain-containing protein  41.51 
 
 
265 aa  47  0.0009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0926  forkhead-associated  38.24 
 
 
870 aa  46.6  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.078322  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0472  putative forkhead-associated protein  28.92 
 
 
860 aa  46.6  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31788  predicted protein  36.05 
 
 
178 aa  46.6  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000306919  normal  0.017578 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3276  serine/threonine kinase protein  28.36 
 
 
475 aa  46.2  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.162967  normal  0.186689 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  35.94 
 
 
242 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2426  FHA domain containing protein  25 
 
 
1346 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0389758 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  33.77 
 
 
606 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0019  FHA domain-containing protein  25.58 
 
 
335 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0800  FHA domain-containing protein  25.58 
 
 
335 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.55882  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5251  FHA domain containing protein  34.19 
 
 
168 aa  45.8  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.462718 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1054  FHA domain-containing protein  37.29 
 
 
405 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.779489  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2865  FHA domain-containing protein  25.58 
 
 
332 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2218  FHA domain-containing protein  25.58 
 
 
332 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.399125  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0618  FHA domain-containing protein  25.58 
 
 
332 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.657455  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0633  FHA domain-containing protein  25.58 
 
 
332 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.723883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2489  FHA domain-containing protein  25.58 
 
 
332 aa  45.8  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.286925  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1781  FHA domain-containing protein  34.38 
 
 
241 aa  45.8  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206586  normal  0.033181 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2769  FHA domain-containing protein  26.8 
 
 
526 aa  45.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2061  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
242 aa  45.8  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.407781  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  34.18 
 
 
153 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2377  adenylate/guanylate cyclase  31.82 
 
 
395 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2114  FHA domain containing protein  42.19 
 
 
121 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.508953  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  34.21 
 
 
279 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  31.46 
 
 
308 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  39.62 
 
 
566 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0494  FHA domain-containing protein  26.25 
 
 
236 aa  45.1  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0075919  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1434  FHA domain-containing protein  31.25 
 
 
152 aa  45.1  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2395  FHA domain-containing protein  25.77 
 
 
505 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2044  FHA domain containing protein  40.62 
 
 
121 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4189  adenylate/guanylate cyclase  32.18 
 
 
336 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0924354 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3733  FHA domain containing protein  26.28 
 
 
172 aa  45.4  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.399873  normal  0.0527204 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0951  FHA-domain containing protein  33.73 
 
 
269 aa  45.1  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03340  FHA domain-containing protein  29.55 
 
 
408 aa  45.4  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0411441  normal  0.659189 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3611  FHA domain containing protein  40.38 
 
 
279 aa  45.4  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331547  hitchhiker  0.0013234 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1030  serine/threonine kinase protein  33.33 
 
 
393 aa  44.7  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.872879 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0735  FHA domain-containing protein  44 
 
 
103 aa  44.7  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000144952 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2060  FHA domain-containing protein  36.67 
 
 
154 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52887  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.21 
 
 
903 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0139  FHA domain-containing protein  32.86 
 
 
179 aa  44.7  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0141963  hitchhiker  0.00495704 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  42.11 
 
 
863 aa  44.7  0.004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0874  FHA domain containing protein  36.07 
 
 
167 aa  44.7  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1456  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.84 
 
 
623 aa  44.7  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.80149  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 
523 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0043  FHA domain-containing protein  31.75 
 
 
161 aa  44.3  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140722  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0048  FHA domain-containing protein  31.75 
 
 
161 aa  44.3  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  37.7 
 
 
546 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6306  FHA domain containing protein  29.33 
 
 
307 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.948459  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0513  FHA domain-containing protein  24.42 
 
 
335 aa  44.3  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0477326  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1672  forkhead-associated protein  36.99 
 
 
894 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0159  FHA domain containing protein  30.49 
 
 
172 aa  44.3  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2336  FHA domain containing protein  29.87 
 
 
181 aa  43.9  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00703004  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0878  Forkhead-associated protein  31.76 
 
 
161 aa  44.3  0.006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2551  FHA domain-containing protein  28.09 
 
 
418 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1399  FHA domain containing protein  29.21 
 
 
380 aa  43.9  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00835094  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4356  KR domain protein  30.49 
 
 
3400 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1302  FHA domain containing protein  26.74 
 
 
161 aa  43.9  0.007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.768573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0998  FHA domain-containing protein  30.56 
 
 
337 aa  43.9  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3726  forkhead-associated  32.14 
 
 
318 aa  43.9  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  34.21 
 
 
899 aa  43.9  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2805  serine/threonine kinase protein  38.81 
 
 
1157 aa  43.5  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_15338  predicted protein  31.18 
 
 
169 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0117573  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0116  putative two component transcriptional regulator, winged helix family  28.74 
 
 
219 aa  43.9  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.856024  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2478  FHA domain containing protein  44.07 
 
 
142 aa  43.5  0.008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>