71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2446 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_2446  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 		 89 aa  177  2.9999999999999997e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0251  Exonuclease VII small subunit  75 
 
 		 85 aa  130  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.129721  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2286  Exonuclease VII small subunit  72.29 
 
 		 88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.620752  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0164  exonuclease VII, small subunit  64.77 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2079  Exonuclease VII small subunit  64.38 
 
 		 94 aa  93.6  7e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1872  exodeoxyribonuclease, small subunit  51.19 
 
 		 82 aa  87.4  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.969648  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2311  Exonuclease VII small subunit  59.46 
 
 		 82 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0227883  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.08 
 
 		 80 aa  63.2  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0314  Exonuclease VII small subunit  41.89 
 
 		 86 aa  57  0.00000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.311113 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0904  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215699  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3008  exonuclease VII, small subunit  46.94 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.31 
 
 		 85 aa  47.8  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1760  Exonuclease VII small subunit  31.34 
 
 		 90 aa  47.4  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0124  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 100 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.327517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.85 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.59 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0528  Exonuclease VII small subunit  44.9 
 
 		 60 aa  44.7  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.85 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1281  hypothetical protein  35.85 
 
 		 67 aa  44.3  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.428193 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.62 
 
 		 80 aa  44.7  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  31.82 
 
 		 87 aa  44.3  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.43 
 
 		 112 aa  44.3  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.66 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  29.73 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 80 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.37 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0954  Exonuclease VII small subunit  36.54 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.863468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.66 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.73 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.76 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.7 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.4 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.14 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.33 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.85 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.1 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.78 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.85 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1720  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.19 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.170328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.85 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.04 
 
 		 105 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1775  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.35 
 
 		 79 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319268  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.96 
 
 		 75 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1644  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 		 82 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413524 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.78 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1731  Exonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 85 aa  41.6  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.735568  normal  0.0195932 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.33 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.33 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.65 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.33 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.96 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  28.12 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1976  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.700847  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.96 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2513  exonuclease VII small subunit  30.36 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.34 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.15 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2037  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.55 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  27.78 
 
 		 88 aa  40.8  0.007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.19 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000644175  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3174  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.09 
 
 		 77 aa  40.4  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.19 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  31.25 
 
 		 93 aa  40.4  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  28.75 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  27.78 
 
 		 88 aa  40.4  0.008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1752  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.38 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.19 
 
 		 75 aa  40  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0851  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.38 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.339936  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.08 
 
 		 76 aa  40  0.009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>