256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3027 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 
75 aa  142  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  98.67 
 
 
75 aa  139  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  81.69 
 
 
76 aa  110  8.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  74.65 
 
 
77 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  70.67 
 
 
75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  72 
 
 
76 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1766  exodeoxyribonuclease VII small subunit  73.24 
 
 
76 aa  92.8  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000846618  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.72 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.65 
 
 
85 aa  74.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.05 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.3 
 
 
76 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0097  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.11 
 
 
101 aa  69.3  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  54.41 
 
 
76 aa  68.2  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1669  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.62 
 
 
74 aa  67.4  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000880334  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.38 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.38 
 
 
80 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.38 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1222  Exonuclease VII small subunit  46.58 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.93 
 
 
85 aa  65.5  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1154  Exonuclease VII small subunit  46.58 
 
 
93 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158629  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.59 
 
 
81 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.93 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.38 
 
 
80 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.38 
 
 
80 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.59 
 
 
81 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.89 
 
 
80 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.71 
 
 
112 aa  63.2  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
84 aa  62.8  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1094  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.38 
 
 
93 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0363068  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.42 
 
 
78 aa  62.4  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.91 
 
 
76 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1133  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.21 
 
 
90 aa  62  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44078  hitchhiker  0.0045107 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.47 
 
 
132 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.79 
 
 
86 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.09 
 
 
76 aa  60.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.45 
 
 
80 aa  60.5  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.73 
 
 
80 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.1 
 
 
83 aa  60.5  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.89 
 
 
90 aa  60.1  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  45.71 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.71 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.91 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.73 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5909  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.93 
 
 
101 aa  59.3  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.83 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
80 aa  58.9  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.71 
 
 
82 aa  57.8  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.24 
 
 
89 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000028975  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.45 
 
 
82 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.71 
 
 
82 aa  57.8  0.00000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.19 
 
 
88 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.71 
 
 
76 aa  57.4  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06500  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.62 
 
 
84 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.83766e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0328  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.75 
 
 
75 aa  57  0.00000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2394  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0362  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1510  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1704  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0832  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.94 
 
 
80 aa  57  0.00000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000144459  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2536  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
97 aa  57  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0917  Exonuclease VII small subunit  49.12 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.27 
 
 
104 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4822  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.45 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.237878  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.45 
 
 
82 aa  56.6  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.67 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.91 
 
 
87 aa  55.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.67 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.67 
 
 
84 aa  56.2  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3774  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00863673  normal  0.0479075 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  42.86 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.34 
 
 
86 aa  55.1  0.0000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3248  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 
97 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344342  normal  0.0166439 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2781  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.46 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.210066  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3650  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2213  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190434  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4488  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.91 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3877  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 
97 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.55 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.55 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.55 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.55 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.55 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3950  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.45 
 
 
105 aa  53.9  0.0000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 
87 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>