233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1083 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 
76 aa  147  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  77.63 
 
 
76 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000644175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  77.63 
 
 
76 aa  115  1.9999999999999998e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.88 
 
 
80 aa  60.8  0.000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  47.3 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.65 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.78 
 
 
84 aa  59.3  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  49.12 
 
 
80 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.27 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.85 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.89 
 
 
86 aa  57  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.37 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.44 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.03 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.18 
 
 
84 aa  54.7  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.84 
 
 
84 aa  53.9  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.15 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.15 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0528  Exonuclease VII small subunit  43.64 
 
 
60 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.15 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.15 
 
 
84 aa  53.5  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1281  hypothetical protein  40.35 
 
 
67 aa  52.8  0.000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.428193 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0832  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.16 
 
 
80 aa  53.5  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000144459  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.68 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12190  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.07 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.07 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
75 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.32 
 
 
83 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
77 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.71 
 
 
82 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.11 
 
 
97 aa  52  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.13 
 
 
113 aa  52  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1075  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.34 
 
 
81 aa  52  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00074506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.76 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.03 
 
 
75 aa  51.2  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.3 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.68 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.32 
 
 
80 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.68 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3069  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.84 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
85 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.29 
 
 
93 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.02 
 
 
79 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.78 
 
 
83 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.78 
 
 
83 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.02 
 
 
79 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.78 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1731  Exonuclease VII small subunit  43.08 
 
 
85 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.735568  normal  0.0195932 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0753  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000664309  hitchhiker  0.0000311057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.1 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0497  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 
71 aa  49.3  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.94 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.94 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.82 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
122 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.32 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.89 
 
 
94 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.1 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 
81 aa  48.9  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.82 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.82 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1980  exonuclease VII, small subunit  45.45 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.671148  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.1 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.06 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.78 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.71 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.88 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.89 
 
 
94 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.64 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1183  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.1 
 
 
71 aa  48.5  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2989  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.55 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.71 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1182  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 
93 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0104864  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.92 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.85 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.51 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.51 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 
89 aa  48.1  0.00004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000028975  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0917  Exonuclease VII small subunit  39.62 
 
 
66 aa  48.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.1 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.81 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.85 
 
 
86 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0128  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.34 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.57 
 
 
155 aa  47.8  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3008  exonuclease VII, small subunit  41.38 
 
 
61 aa  47.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0923  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.03 
 
 
79 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00562605  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.47 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.82 
 
 
109 aa  47.8  0.00005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.55 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.92 
 
 
80 aa  47.8  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0822  exonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
70 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0239086 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>