59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1281 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1281  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  135  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.428193 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3008  exonuclease VII, small subunit  45.45 
 
 		 61 aa  64.3  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1980  exonuclease VII, small subunit  40.35 
 
 		 61 aa  56.2  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.671148  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1894  exonuclease VII, small subunit  42.37 
 
 		 64 aa  54.7  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.24895 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0528  Exonuclease VII small subunit  37.5 
 
 		 60 aa  54.3  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.35 
 
 		 76 aa  52.8  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.74 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000644175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.74 
 
 		 76 aa  51.6  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.98 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.66 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.04 
 
 		 83 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.04 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.19 
 
 		 83 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.2 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.84 
 
 		 84 aa  46.2  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.74 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.85 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.85 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.74 
 
 		 94 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.85 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.31 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.23 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.73 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2446  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.85 
 
 		 89 aa  44.3  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.04 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  33.93 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1055  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.04 
 
 		 69 aa  43.9  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.19 
 
 		 86 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1182  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0104864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  28.36 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.58 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0020  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0753  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000664309  hitchhiker  0.0000311057 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3492  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 82 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422868  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1663  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  30 
 
 		 101 aa  42  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  31.03 
 
 		 86 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 83 aa  41.6  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0910  hypothetical protein  31.03 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.439043  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0941  Exonuclease VII small subunit  31.15 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628269  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.19 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1872  exodeoxyribonuclease, small subunit  33.33 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.969648  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.85 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  35.19 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.19 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0917  Exonuclease VII small subunit  29.03 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.19 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.19 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.19 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.19 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.19 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.19 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.19 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 95 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>