167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0528 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0528  Exonuclease VII small subunit  100 
 
 		 60 aa  116  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1980  exonuclease VII, small subunit  70 
 
 		 61 aa  86.3  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.671148  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3008  exonuclease VII, small subunit  61.67 
 
 		 61 aa  73.2  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1894  exonuclease VII, small subunit  62.71 
 
 		 64 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.24895 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.94 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.3 
 
 		 83 aa  55.5  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0917  Exonuclease VII small subunit  46.43 
 
 		 66 aa  55.1  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.76 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.76 
 
 		 94 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1281  hypothetical protein  37.5 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.428193 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.07 
 
 		 86 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.64 
 
 		 76 aa  53.5  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.68 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.35 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 		 83 aa  52  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 		 83 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000644175  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.1 
 
 		 83 aa  51.6  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.74 
 
 		 87 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.98 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 		 83 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 88 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.18 
 
 		 93 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.11 
 
 		 97 aa  50.4  0.000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.59 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.23 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.37 
 
 		 105 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.74 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.62 
 
 		 85 aa  47.4  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0328  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.59 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.59 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.59 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.74 
 
 		 84 aa  47  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1510  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.59 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1704  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.59 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.6 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2536  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.59 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2394  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.59 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0362  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.59 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.74 
 
 		 113 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.31 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2037  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.86 
 
 		 78 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2836  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.38 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0182244  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0832  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000144459  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0020  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 		 68 aa  45.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.74 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.64 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.11 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  40.35 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0128  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.31 
 
 		 88 aa  44.7  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3950  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 105 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.62 
 
 		 78 aa  45.1  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2551  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.38 
 
 		 72 aa  45.1  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000943979 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.37 
 
 		 85 aa  44.7  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2446  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.9 
 
 		 89 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.35 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0877  exonuclease VII, small subunit  39.22 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4822  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 93 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.237878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42 
 
 		 86 aa  44.3  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.51 
 
 		 85 aa  44.3  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3327  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.31 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1872  exodeoxyribonuclease, small subunit  42.31 
 
 		 82 aa  43.5  0.0009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.969648  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.22 
 
 		 76 aa  42.7  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2223  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 		 94 aa  43.5  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0467  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.67 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1461  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  44 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.93 
 
 		 86 aa  43.1  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4488  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.04 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3877  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1424  Exonuclease VII small subunit  36 
 
 		 77 aa  43.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.506182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1499  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.74 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.18 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.04 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3650  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.1 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>