271 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1171 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
113 aa  228  2e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  79.01 
 
 
85 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  69.62 
 
 
84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  69.62 
 
 
84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  69.62 
 
 
84 aa  115  1.9999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  70.83 
 
 
93 aa  105  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  61.45 
 
 
94 aa  105  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  69.01 
 
 
94 aa  104  4e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  69.44 
 
 
88 aa  103  7e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  61.25 
 
 
86 aa  103  7e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  69.44 
 
 
88 aa  103  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  64.56 
 
 
83 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  63.64 
 
 
88 aa  102  2e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.2 
 
 
86 aa  101  3e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  65.79 
 
 
83 aa  101  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  64.47 
 
 
83 aa  100  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  64.47 
 
 
83 aa  100  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  64.47 
 
 
83 aa  99.8  1e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  68.06 
 
 
97 aa  99.4  1e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  61.25 
 
 
83 aa  98.6  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  67.57 
 
 
83 aa  96.7  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.32 
 
 
82 aa  94.4  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  60 
 
 
87 aa  94.7  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  63.51 
 
 
83 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  63.51 
 
 
83 aa  94  6e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  59.74 
 
 
84 aa  93.6  9e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  60 
 
 
80 aa  92.4  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  62.67 
 
 
83 aa  91.3  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  57.14 
 
 
81 aa  86.7  9e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.33 
 
 
80 aa  83.2  0.000000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.94 
 
 
105 aa  82  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  59.72 
 
 
84 aa  80.9  0.000000000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.67 
 
 
79 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.35 
 
 
122 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.75 
 
 
80 aa  77.4  0.00000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.33 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.33 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.05 
 
 
83 aa  74.7  0.0000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.86 
 
 
88 aa  70.5  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.72 
 
 
80 aa  67.4  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.78 
 
 
76 aa  63.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.75 
 
 
109 aa  62.4  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20420  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.57 
 
 
149 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672892  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.07 
 
 
85 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.47 
 
 
112 aa  59.3  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2131  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.37 
 
 
85 aa  58.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.62561  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  50.94 
 
 
77 aa  58.5  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
86 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
84 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.9 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5909  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.31 
 
 
101 aa  57.4  0.00000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.07 
 
 
95 aa  57.4  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.9 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26440  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.9 
 
 
91 aa  57  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102851  normal  0.416491 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.98 
 
 
81 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.1 
 
 
81 aa  56.6  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.1 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 
90 aa  56.2  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.85 
 
 
89 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3117  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.88 
 
 
70 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.03656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.03 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.03 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.03 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  46.03 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.03 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.03 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.03 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.03 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.03 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0020  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.83 
 
 
68 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
78 aa  54.7  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2836  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.33 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0182244  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.35 
 
 
88 aa  53.5  0.0000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.19 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1424  Exonuclease VII small subunit  42.31 
 
 
77 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.506182  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.54 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.19 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.54 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1706  exonuclease VII, small subunit  44.23 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1894  exonuclease VII, small subunit  41.38 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.24895 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2781  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.62 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.210066  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.19 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
79 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31510  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
105 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0551924  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.84 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.06 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000644175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.06 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.24 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.24 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.15 
 
 
70 aa  52.4  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1876  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.09 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.24 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.24 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0937  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.91 
 
 
92 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.24 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4309  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
76 aa  52  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000200233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
76 aa  52  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3921  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
76 aa  52  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3932  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
76 aa  52  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>