210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0128 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_0128  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
88 aa  173  6e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8484  Exonuclease VII small subunit-like protein  64.29 
 
 
97 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3069  exodeoxyribonuclease VII small subunit  64.79 
 
 
82 aa  92.8  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0467  exodeoxyribonuclease VII small subunit  78.18 
 
 
81 aa  84.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2836  exodeoxyribonuclease VII small subunit  70.69 
 
 
76 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0182244  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2551  exodeoxyribonuclease VII small subunit  63.77 
 
 
72 aa  77.8  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000943979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  55.22 
 
 
89 aa  75.5  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.3 
 
 
104 aa  74.7  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1005  Exonuclease VII small subunit  55.22 
 
 
72 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1073  exodeoxyribonuclease VII small subunit  60.32 
 
 
77 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31510  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  64.29 
 
 
105 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0551924  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1876  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  64.81 
 
 
96 aa  74.3  0.0000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0877  exonuclease VII, small subunit  58.46 
 
 
70 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0822  exonuclease VII small subunit  54.41 
 
 
70 aa  73.9  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4108  exodeoxyribonuclease VII small subunit  59.38 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  59.38 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0286083  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4339  exodeoxyribonuclease VII small subunit  59.38 
 
 
70 aa  73.6  0.0000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0975539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0847  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  60 
 
 
110 aa  71.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.25 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.25 
 
 
86 aa  69.7  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2076  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  63.16 
 
 
69 aa  69.3  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624924  normal  0.162947 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26440  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  63.64 
 
 
91 aa  68.6  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102851  normal  0.416491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0725  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.96 
 
 
69 aa  68.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1088  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.57 
 
 
77 aa  67.8  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0317888  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4390  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.1 
 
 
89 aa  67.4  0.00000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.86848  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3117  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.14 
 
 
70 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.03656  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.94 
 
 
95 aa  67  0.00000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5540  Exonuclease VII small subunit  57.63 
 
 
66 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.69 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0937  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.86 
 
 
92 aa  65.9  0.0000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1121  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  63.83 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4634  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.14 
 
 
70 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233214  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.44 
 
 
79 aa  63.5  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11129  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.94 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20420  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.9 
 
 
149 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672892  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.51 
 
 
155 aa  54.7  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.51 
 
 
105 aa  54.7  0.0000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0430  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
106 aa  53.5  0.0000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000201128 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.28 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.19 
 
 
82 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.28 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.39 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.25 
 
 
83 aa  52  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.4 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.89 
 
 
87 aa  51.6  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.28 
 
 
83 aa  51.2  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.4 
 
 
93 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.43 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.43 
 
 
83 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.14 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.43 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
83 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.73 
 
 
89 aa  50.8  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000028975  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.25 
 
 
109 aa  50.8  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.11 
 
 
76 aa  50.4  0.000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.4 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.66 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.23 
 
 
88 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.38 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
102 aa  48.9  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.23 
 
 
88 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.31 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.47 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3774  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.94 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00863673  normal  0.0479075 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.91 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3248  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.94 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344342  normal  0.0166439 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.06 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1980  exonuclease VII, small subunit  46.15 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.671148  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.51 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.34 
 
 
76 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2238  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.62 
 
 
78 aa  47.8  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.264356 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.1 
 
 
80 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1927  exonuclease VII small subunit  45.28 
 
 
100 aa  47.4  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.894899  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2989  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.26 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.54 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.71 
 
 
83 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.71 
 
 
83 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.15 
 
 
76 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
103 aa  47  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 
122 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.62 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4488  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.94 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.37 
 
 
87 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3650  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.94 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3877  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.94 
 
 
97 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4822  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.42 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.237878  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2223  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.11 
 
 
94 aa  45.8  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.94 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.23 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.62 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.51 
 
 
97 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.85 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.62 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0328  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.62 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.98 
 
 
83 aa  45.4  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0917  Exonuclease VII small subunit  48 
 
 
66 aa  45.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  40.28 
 
 
80 aa  45.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2536  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.62 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2394  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.62 
 
 
97 aa  45.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>