247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2238 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008709  Ping_2238  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
78 aa  154  3e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.264356 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01175  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.97 
 
 
80 aa  100  9e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.67 
 
 
80 aa  97.4  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  59.21 
 
 
80 aa  95.1  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  55.84 
 
 
80 aa  90.5  6e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.67 
 
 
79 aa  90.1  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1277  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.33 
 
 
79 aa  88.2  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.11345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2729  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.33 
 
 
79 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285704  normal  0.425427 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2802  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.33 
 
 
79 aa  87  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.269499  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2899  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.33 
 
 
79 aa  87  8e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152416  hitchhiker  0.000215653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3327  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779429  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.33 
 
 
79 aa  86.3  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.53 
 
 
83 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1384  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.94 
 
 
79 aa  85.9  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1345  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.16 
 
 
79 aa  86.7  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230985  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1359  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.94 
 
 
79 aa  85.9  1e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00292788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3001  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.94 
 
 
79 aa  85.5  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121829  decreased coverage  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2434  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  55.56 
 
 
79 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691221  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2989  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.33 
 
 
82 aa  82  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.67 
 
 
78 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.33 
 
 
78 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0788452  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.68 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.68 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.75 
 
 
84 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.75 
 
 
84 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.25 
 
 
84 aa  70.5  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.15 
 
 
76 aa  69.7  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.74 
 
 
82 aa  70.1  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.33 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.25 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.61 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.33 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.15 
 
 
82 aa  69.3  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.31 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.31 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.31 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.31 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.24 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.31 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.75 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.75 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.75 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.75 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.75 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.75 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  50.75 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.75 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.75 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.59 
 
 
112 aa  67  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.74 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.66 
 
 
85 aa  64.3  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.78 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.78 
 
 
76 aa  63.5  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
120 aa  63.2  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.39 
 
 
85 aa  60.8  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.79 
 
 
90 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.51 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.67 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.51 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.37 
 
 
132 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.36 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.94 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
104 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1731  Exonuclease VII small subunit  42.19 
 
 
85 aa  55.1  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.735568  normal  0.0195932 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2872  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0380914  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0328  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
97 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 
80 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1510  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
97 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1704  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
97 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2536  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
97 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2394  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
97 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0362  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
97 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
104 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4031  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.72 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0705396  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.33 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45 
 
 
80 aa  54.3  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.21 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3921  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.21 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3932  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.21 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
86 aa  53.9  0.0000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4309  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.21 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000200233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4403  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.21 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0852123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4199  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.21 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5598800000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4289  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.21 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.18628  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06260  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.28 
 
 
86 aa  53.5  0.0000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0413231  normal  0.0182875 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12190  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.67 
 
 
83 aa  53.5  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  32.89 
 
 
77 aa  52.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.29 
 
 
155 aa  53.1  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 
76 aa  53.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0945  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.21 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582074  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.81 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0753  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.12 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000664309  hitchhiker  0.0000311057 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
103 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
102 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.98 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>