282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2277 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 
76 aa  149  1e-35  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  98.68 
 
 
76 aa  148  3e-35  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.3 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.12 
 
 
85 aa  73.6  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  55.38 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.75 
 
 
83 aa  70.9  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
80 aa  70.5  0.000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.75 
 
 
80 aa  70.1  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  54.69 
 
 
80 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  56.9 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.65 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  54.69 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.23 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.23 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.23 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.23 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.23 
 
 
85 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.21 
 
 
81 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.72 
 
 
132 aa  67  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.21 
 
 
81 aa  66.6  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.22 
 
 
80 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.45 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.33 
 
 
78 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1984  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  54.72 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  51.61 
 
 
76 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.48 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.48 
 
 
82 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.48 
 
 
84 aa  65.1  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.7 
 
 
80 aa  64.7  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.97 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.97 
 
 
82 aa  64.3  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1277  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.44 
 
 
79 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.11345  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2729  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.44 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285704  normal  0.425427 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2802  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.44 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.269499  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2899  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.44 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152416  hitchhiker  0.000215653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.57 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2238  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.78 
 
 
78 aa  63.5  0.0000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.264356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.88 
 
 
87 aa  63.5  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.88 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.97 
 
 
84 aa  63.5  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2434  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.69 
 
 
79 aa  63.2  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691221  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1384  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.88 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.85 
 
 
86 aa  62.4  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1359  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.88 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00292788  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3001  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.88 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121829  decreased coverage  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1345  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.88 
 
 
79 aa  62.8  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230985  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.15 
 
 
86 aa  62  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  51.79 
 
 
82 aa  62  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3327  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.44 
 
 
79 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779429  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 
80 aa  61.6  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.73 
 
 
78 aa  61.2  0.000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0788452  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.22 
 
 
86 aa  61.6  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.77 
 
 
80 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.77 
 
 
80 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.77 
 
 
80 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.77 
 
 
80 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.77 
 
 
80 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.77 
 
 
80 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.77 
 
 
80 aa  61.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.77 
 
 
80 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  46.77 
 
 
80 aa  61.2  0.000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.09 
 
 
75 aa  60.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.09 
 
 
75 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.62 
 
 
83 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.62 
 
 
83 aa  60.5  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.68 
 
 
122 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
82 aa  60.1  0.00000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.64 
 
 
84 aa  60.1  0.00000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
80 aa  59.3  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.76 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01175  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.79 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.79 
 
 
78 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.44 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.76 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.94 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.43 
 
 
97 aa  58.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.94 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.94 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.94 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.94 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2989  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.62 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.16 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.94 
 
 
80 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  38.03 
 
 
80 aa  57.8  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.16 
 
 
83 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.03 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
80 aa  57.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.16 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.06 
 
 
77 aa  57.4  0.00000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1669  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.15 
 
 
74 aa  57.4  0.00000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000880334  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.9 
 
 
113 aa  57  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.3 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.83 
 
 
89 aa  57  0.00000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000028975  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
70 aa  57  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.94 
 
 
75 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.76 
 
 
81 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>