208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8276 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8276  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
81 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.293612  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0937  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.86 
 
 
92 aa  83.2  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26440  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  68.75 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.102851  normal  0.416491 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  64.18 
 
 
95 aa  82.8  0.000000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  57.14 
 
 
104 aa  82  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1073  exodeoxyribonuclease VII small subunit  67.14 
 
 
77 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31510  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.21 
 
 
105 aa  79.3  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0551924  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1100  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  63.64 
 
 
86 aa  78.6  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4634  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  59.7 
 
 
70 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233214  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0877  exonuclease VII, small subunit  72.58 
 
 
70 aa  78.2  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3879  exodeoxyribonuclease VII small subunit  60.87 
 
 
89 aa  77.8  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3117  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  55.41 
 
 
70 aa  77  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.03656  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0822  exonuclease VII small subunit  70.97 
 
 
70 aa  76.6  0.00000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0725  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  64.41 
 
 
69 aa  76.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5540  Exonuclease VII small subunit  71.43 
 
 
66 aa  76.6  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.153566 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1876  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.34 
 
 
96 aa  76.3  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0847  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  66.67 
 
 
110 aa  75.1  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.550336 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  61.02 
 
 
78 aa  74.7  0.0000000000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1121  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  77.55 
 
 
78 aa  74.7  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.759442 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2076  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.73 
 
 
69 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624924  normal  0.162947 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1005  Exonuclease VII small subunit  65.62 
 
 
72 aa  73.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.15 
 
 
79 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0128  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56.25 
 
 
88 aa  71.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.310342  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0467  exodeoxyribonuclease VII small subunit  65.52 
 
 
81 aa  71.6  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2836  exodeoxyribonuclease VII small subunit  55.56 
 
 
76 aa  71.6  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0182244  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2551  exodeoxyribonuclease VII small subunit  60.94 
 
 
72 aa  71.2  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000943979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8484  Exonuclease VII small subunit-like protein  62.5 
 
 
97 aa  71.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4108  exodeoxyribonuclease VII small subunit  56.67 
 
 
70 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3069  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.21 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  56.67 
 
 
70 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0286083  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4339  exodeoxyribonuclease VII small subunit  56.67 
 
 
70 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0975539 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.57 
 
 
83 aa  69.7  0.00000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11129  exodeoxyribonuclease VII small subunit  62.07 
 
 
85 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1088  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  68.63 
 
 
77 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0317888  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4390  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  51.43 
 
 
89 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.86848  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 
87 aa  67.4  0.00000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20420  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.97 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672892  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1927  exonuclease VII small subunit  51.79 
 
 
100 aa  62.8  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.894899  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0430  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.23 
 
 
106 aa  60.5  0.000000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000201128 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.67 
 
 
86 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.18 
 
 
93 aa  60.1  0.000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.28 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.94 
 
 
83 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.61 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.06 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.21 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.62 
 
 
82 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.94 
 
 
83 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.74 
 
 
83 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.42 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.12 
 
 
94 aa  57  0.00000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.1 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.26 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.26 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
94 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.08 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.1 
 
 
76 aa  55.1  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.37 
 
 
83 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.66 
 
 
85 aa  53.9  0.0000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.94 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.38 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 
83 aa  53.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.88 
 
 
86 aa  51.6  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.83 
 
 
88 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.61 
 
 
85 aa  51.2  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 
97 aa  51.2  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.91 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.83 
 
 
88 aa  50.8  0.000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5909  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.14 
 
 
105 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.08 
 
 
109 aa  50.4  0.000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.19 
 
 
82 aa  50.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.61 
 
 
94 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.56 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1424  Exonuclease VII small subunit  48 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.506182  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.68 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.88 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.08 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.75 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0328  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.7 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.07 
 
 
79 aa  49.3  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.7 
 
 
104 aa  49.7  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.3 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.37 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.68 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1510  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.7 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  43.75 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1704  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.7 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2536  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.7 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2394  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.7 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0362  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.7 
 
 
97 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1706  exonuclease VII, small subunit  50 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>