243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3059 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 
79 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0881  exodeoxyribonuclease VII small subunit  59.68 
 
 
80 aa  82  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2131  exodeoxyribonuclease VII small subunit  60 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.62561  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  55.74 
 
 
103 aa  73.6  0.0000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2223  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
94 aa  73.2  0.000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.62 
 
 
94 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4822  exodeoxyribonuclease VII small subunit  55.38 
 
 
93 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.237878  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3248  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.7 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344342  normal  0.0166439 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3774  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.7 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00863673  normal  0.0479075 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4488  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.7 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3650  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.7 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3877  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.7 
 
 
97 aa  70.9  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0328  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.17 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.17 
 
 
104 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0362  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.17 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1510  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.17 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1704  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.17 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2536  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.17 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2394  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.17 
 
 
97 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.17 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2035  exodeoxyribonuclease VII small subunit  55.93 
 
 
95 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2213  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.3 
 
 
97 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190434  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0234  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.76 
 
 
84 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.733912  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.3 
 
 
102 aa  68.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3950  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.95 
 
 
105 aa  67.8  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1424  Exonuclease VII small subunit  47.37 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.506182  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.29 
 
 
84 aa  66.2  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2829  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.33 
 
 
102 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6783  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.33 
 
 
102 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277557  hitchhiker  0.0000961691 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1706  exonuclease VII, small subunit  48.28 
 
 
77 aa  65.9  0.0000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3371  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.03 
 
 
81 aa  61.2  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.58 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1499  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.91 
 
 
93 aa  59.3  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2633  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.26 
 
 
86 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.665476  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  45.16 
 
 
77 aa  58.9  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.42 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.36 
 
 
122 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.59 
 
 
81 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.58 
 
 
88 aa  57.8  0.00000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  43.24 
 
 
80 aa  58.2  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06260  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.94 
 
 
86 aa  57.8  0.00000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0413231  normal  0.0182875 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2877  exonuclease VII, small subunit  45.76 
 
 
95 aa  57.4  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.28 
 
 
88 aa  57.4  0.00000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0124  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.32 
 
 
100 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.327517 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.16 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1745  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.07 
 
 
93 aa  57  0.00000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2013  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.33 
 
 
117 aa  57  0.00000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322776  hitchhiker  0.00272964 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.06 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2037  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.45 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.38 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.67 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.27 
 
 
87 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.16 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1720  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45 
 
 
81 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.170328  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.58 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.27 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.27 
 
 
79 aa  53.5  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.54 
 
 
113 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.69 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
78 aa  52.8  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0642  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 
87 aa  53.5  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.768801  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1775  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.37 
 
 
79 aa  53.1  0.000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319268  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.69 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.75 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0097  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.85 
 
 
101 aa  53.1  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45 
 
 
94 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.29 
 
 
83 aa  52.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.69 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3281  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.68 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.26 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0998  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.88 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50.91 
 
 
85 aa  52.8  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0569  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.27 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.72936  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.94 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.68 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.67 
 
 
83 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
83 aa  52  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.27 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.199562 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.36 
 
 
90 aa  52.4  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2240  exonuclease VII small subunit  39.29 
 
 
78 aa  52.4  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754101  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1731  Exonuclease VII small subunit  39.71 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.735568  normal  0.0195932 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 
80 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 
83 aa  51.6  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
83 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.68 
 
 
88 aa  52  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 
83 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.27 
 
 
86 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 
80 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.27 
 
 
86 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0417  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
90 aa  51.2  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2781  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.62 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.210066  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.91 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.55 
 
 
85 aa  51.6  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>