195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0124 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0124  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 
100 aa  194  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.327517 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1720  exodeoxyribonuclease VII small subunit  70.97 
 
 
81 aa  93.2  9e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.170328  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  55.41 
 
 
80 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0954  Exonuclease VII small subunit  53.57 
 
 
90 aa  70.5  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.863468  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1760  Exonuclease VII small subunit  40.32 
 
 
90 aa  60.5  0.000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0881  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.55 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0945  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.72 
 
 
76 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582074  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.19 
 
 
103 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4031  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.72 
 
 
76 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0705396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3921  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3932  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.32 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4403  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0852123  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4309  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000200233  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4199  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5598800000000002e-24 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4289  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
76 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.18628  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 
76 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.54 
 
 
77 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.85 
 
 
90 aa  56.2  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2223  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
94 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0234  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.34 
 
 
84 aa  55.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.733912  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2877  exonuclease VII, small subunit  40.98 
 
 
95 aa  55.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2872  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
76 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0380914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4252  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449361  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.82 
 
 
86 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1499  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.46 
 
 
93 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3281  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.34 
 
 
77 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1075  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.19 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00074506  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2131  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.98 
 
 
85 aa  52.4  0.000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.62561  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1036  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 
89 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.121461 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2035  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.03 
 
 
95 aa  52  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0954  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.1 
 
 
81 aa  52.4  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 
76 aa  51.6  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.27 
 
 
79 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.1 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.31 
 
 
94 aa  51.6  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2633  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.32 
 
 
86 aa  52  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.665476  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.27 
 
 
79 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.85 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2013  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.1 
 
 
117 aa  51.2  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322776  hitchhiker  0.00272964 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.64 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.68 
 
 
79 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2037  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.06 
 
 
78 aa  50.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.03 
 
 
84 aa  50.4  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0164  exonuclease VII, small subunit  34.92 
 
 
102 aa  50.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46 
 
 
70 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1745  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.1 
 
 
93 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0941  Exonuclease VII small subunit  46.81 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628269  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.66 
 
 
83 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2286  Exonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
88 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.620752  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3174  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 
86 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1775  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46 
 
 
79 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319268  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  33.87 
 
 
77 aa  49.3  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.59 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0020  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.38 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35 
 
 
80 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.71 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.71 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  41.07 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6783  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
102 aa  48.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277557  hitchhiker  0.0000961691 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.82 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.67 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.67 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.67 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.67 
 
 
80 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.24 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2829  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
102 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1537  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.32 
 
 
75 aa  47.8  0.00005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000164588  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1182  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
93 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0104864  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 
80 aa  47.4  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.48 
 
 
78 aa  47.8  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.34 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 
80 aa  47  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.21 
 
 
105 aa  47  0.00009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0328  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
97 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.39 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.82 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.83 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.35 
 
 
83 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1510  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
97 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1704  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
97 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2536  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
97 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2394  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
97 aa  47  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0362  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
97 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2240  exonuclease VII small subunit  30.16 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754101  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 
85 aa  46.2  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2075  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.43 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0019732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1789  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.43 
 
 
75 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0504412  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2446  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
89 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2311  Exonuclease VII small subunit  37.74 
 
 
82 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0227883  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  30.51 
 
 
82 aa  46.2  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.23 
 
 
87 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>