65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_2311 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_2311  Exonuclease VII small subunit  100 
 
 		 82 aa  166  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0227883  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2079  Exonuclease VII small subunit  60.98 
 
 		 94 aa  105  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0164  exonuclease VII, small subunit  59.49 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2286  Exonuclease VII small subunit  55.84 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.620752  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2446  exodeoxyribonuclease VII small subunit  59.46 
 
 		 89 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0251  Exonuclease VII small subunit  53.25 
 
 		 85 aa  79.3  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.129721  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1872  exodeoxyribonuclease, small subunit  55.41 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.969648  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.92 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.71 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 		 70 aa  50.4  0.000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  35.71 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.74 
 
 		 76 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0954  Exonuclease VII small subunit  37.84 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.863468  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.59 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.82 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.13 
 
 		 86 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2075  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.91 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0019732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1789  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.91 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0504412  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.62 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0124  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.74 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.327517 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1075  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00074506  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1775  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.59 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319268  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0904  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.23 
 
 		 70 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215699  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0314  Exonuclease VII small subunit  41.67 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.311113 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.03 
 
 		 77 aa  43.9  0.0009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.81 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000028975  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.58 
 
 		 76 aa  43.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1752  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.23 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.31 
 
 		 75 aa  43.5  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1720  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.29 
 
 		 81 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.170328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.96 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.19 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.19 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  29.31 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.79 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2872  exodeoxyribonuclease VII small subunit  25.86 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0380914  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4390  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.47 
 
 		 89 aa  42  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.86848  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4031  exodeoxyribonuclease VII small subunit  25.68 
 
 		 76 aa  42  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0705396  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  36.36 
 
 		 80 aa  42  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2989  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  31.58 
 
 		 82 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.76 
 
 		 86 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1766  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.96 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000846618  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1760  Exonuclease VII small subunit  27.4 
 
 		 90 aa  41.2  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1222  Exonuclease VII small subunit  34 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1154  Exonuclease VII small subunit  34 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158629  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.07 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000644175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.07 
 
 		 76 aa  41.2  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1094  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34 
 
 		 93 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0363068  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3008  exonuclease VII, small subunit  44.9 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3327  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.22 
 
 		 75 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  28.07 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  28.92 
 
 		 84 aa  40.4  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0941  Exonuclease VII small subunit  30.3 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628269  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  27.59 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2899  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.48 
 
 		 79 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152416  hitchhiker  0.000215653 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2802  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.48 
 
 		 79 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.269499  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2729  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.48 
 
 		 79 aa  40  0.01  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285704  normal  0.425427 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.94 
 
 		 80 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>