47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_0314 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010655  Amuc_0314  Exonuclease VII small subunit  100 
 
 
86 aa  175  2e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.311113 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2446  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.89 
 
 
89 aa  57  0.00000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.78 
 
 
72 aa  53.1  0.000001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1663  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
101 aa  48.9  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1199  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.4 
 
 
88 aa  48.9  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0164  exonuclease VII, small subunit  35 
 
 
102 aa  48.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.1 
 
 
84 aa  47.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.51 
 
 
76 aa  46.2  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2037  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.03 
 
 
78 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0954  Exonuclease VII small subunit  35.9 
 
 
90 aa  46.2  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.863468  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2286  Exonuclease VII small subunit  36.99 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.620752  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.35 
 
 
79 aa  45.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.74 
 
 
93 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2781  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.51 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.210066  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.68 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.74 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.74 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0904  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.64 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215699  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.62 
 
 
76 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.68 
 
 
80 aa  43.9  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.24 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
80 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2311  Exonuclease VII small subunit  41.67 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0227883  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 
70 aa  43.1  0.001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.62 
 
 
76 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.82 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3008  exonuclease VII, small subunit  40.74 
 
 
61 aa  42.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.89 
 
 
86 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.71 
 
 
88 aa  42  0.003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.21 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.67 
 
 
132 aa  41.6  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1894  exonuclease VII, small subunit  37.04 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.24895 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0251  Exonuclease VII small subunit  36.62 
 
 
85 aa  42  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.129721  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.71 
 
 
88 aa  41.6  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.51 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.1 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.85 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.1 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
84 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
122 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.04 
 
 
94 aa  40.4  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.04 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2079  Exonuclease VII small subunit  37.1 
 
 
94 aa  40  0.01  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>