157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_0904 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_0904  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
70 aa  135  2e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215699  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.78 
 
 
75 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1075  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.3 
 
 
81 aa  53.5  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00074506  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1752  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.09 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.31 
 
 
83 aa  52.4  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.09 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0954  Exonuclease VII small subunit  44.07 
 
 
90 aa  51.6  0.000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.863468  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.15 
 
 
76 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.28 
 
 
84 aa  51.6  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.64 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.64 
 
 
88 aa  51.6  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.88 
 
 
70 aa  50.8  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.83 
 
 
75 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.08 
 
 
75 aa  50.8  0.000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1976  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.18 
 
 
89 aa  50.8  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.700847  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1644  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.18 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413524 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.3 
 
 
76 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0251  Exonuclease VII small subunit  38.03 
 
 
85 aa  50.4  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.129721  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0164  exonuclease VII, small subunit  41.94 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5909  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.08 
 
 
101 aa  50.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3492  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.62 
 
 
82 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422868  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0851  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.29 
 
 
67 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.339936  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  50 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.78 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.4 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.67 
 
 
87 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.74 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4304  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.14 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.185821  normal  0.148391 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45 
 
 
83 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
86 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2446  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42 
 
 
89 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0155  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
67 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.281027  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
93 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.64 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.64 
 
 
88 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.32 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1760  Exonuclease VII small subunit  40.74 
 
 
90 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.4 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
122 aa  47.8  0.00005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.07 
 
 
83 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.64 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.64 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2286  Exonuclease VII small subunit  35.21 
 
 
88 aa  47.8  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.620752  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.15 
 
 
80 aa  47.4  0.00006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.28 
 
 
75 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.28 
 
 
75 aa  47.8  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0089  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.64 
 
 
76 aa  47.8  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0300263  normal  0.239711 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 
76 aa  47.4  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.62 
 
 
155 aa  47.4  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.15 
 
 
80 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.15 
 
 
80 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.15 
 
 
80 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.15 
 
 
80 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.15 
 
 
80 aa  47.4  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2037  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.21 
 
 
78 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.15 
 
 
84 aa  47  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.15 
 
 
84 aa  47  0.00009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.67 
 
 
86 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.64 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0832  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.04 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000144459  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1602  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.61 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.941328  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.59 
 
 
84 aa  46.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0020  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.74 
 
 
68 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.09 
 
 
112 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1236  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.66 
 
 
76 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.07 
 
 
105 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.4 
 
 
94 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1872  exodeoxyribonuclease, small subunit  41.67 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.969648  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.09 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.4 
 
 
85 aa  45.4  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3174  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.1 
 
 
77 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.3 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1055  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.83 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.4 
 
 
94 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.51 
 
 
76 aa  45.1  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.73 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.18 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2311  Exonuclease VII small subunit  36.23 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0227883  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0314  Exonuclease VII small subunit  43.64 
 
 
86 aa  44.3  0.0006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.311113 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.74 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1720  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.82 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.170328  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.98 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0634  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.33 
 
 
83 aa  43.5  0.0009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.714213  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
86 aa  43.5  0.0009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>