48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1872 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1872  exodeoxyribonuclease, small subunit  100 
 
 		 82 aa  165  2e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.969648  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2446  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.19 
 
 		 89 aa  87.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0164  exonuclease VII, small subunit  48.78 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2286  Exonuclease VII small subunit  56.94 
 
 		 88 aa  85.5  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.620752  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0251  Exonuclease VII small subunit  47.56 
 
 		 85 aa  81.3  0.000000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.129721  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2079  Exonuclease VII small subunit  54.05 
 
 		 94 aa  79.7  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2311  Exonuclease VII small subunit  55.41 
 
 		 82 aa  75.9  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0227883  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.71 
 
 		 80 aa  50.4  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.67 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.43 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0398  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.51 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0904  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.67 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215699  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0399  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.7 
 
 		 84 aa  45.1  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.171686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0124  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.327517 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  29.33 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  29.33 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0954  Exonuclease VII small subunit  37.93 
 
 		 90 aa  43.5  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.863468  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0528  Exonuclease VII small subunit  42.31 
 
 		 60 aa  43.5  0.0009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0941  Exonuclease VII small subunit  35 
 
 		 76 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628269  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.38 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.6177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3008  exonuclease VII, small subunit  39.29 
 
 		 61 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  28 
 
 		 79 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.25 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.43 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3492  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  28.17 
 
 		 82 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422868  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.99 
 
 		 76 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1281  hypothetical protein  33.33 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.428193 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1720  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.21 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.170328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.19 
 
 		 87 aa  41.6  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1614  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.57 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000644175  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.57 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00814066  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16330  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.51 
 
 		 95 aa  41.2  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22980  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.54 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.435723  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  29.76 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0495  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1537  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.62 
 
 		 75 aa  40.4  0.008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000164588  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1775  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.19 
 
 		 79 aa  40.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.26 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.19 
 
 		 105 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.59 
 
 		 76 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>