174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_0954 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011883  Ddes_0954  Exonuclease VII small subunit  100 
 
 
90 aa  186  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.863468  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1720  exodeoxyribonuclease VII small subunit  61.02 
 
 
81 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.170328  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  51.56 
 
 
80 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0124  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.57 
 
 
100 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.327517 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1760  Exonuclease VII small subunit  51.79 
 
 
90 aa  65.5  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0941  Exonuclease VII small subunit  41.46 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628269  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0881  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.62 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.84 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1775  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.27 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319268  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.07 
 
 
103 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3950  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 
105 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2223  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.85 
 
 
94 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.76 
 
 
70 aa  54.7  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2035  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.84 
 
 
95 aa  53.5  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.78 
 
 
77 aa  53.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3650  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.18 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4488  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.18 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.34 
 
 
94 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3877  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.18 
 
 
97 aa  52.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.62 
 
 
80 aa  53.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.78 
 
 
76 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06500  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.86 
 
 
84 aa  52.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.83766e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.67 
 
 
84 aa  52.4  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3281  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.94 
 
 
77 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0328  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.67 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.67 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.54 
 
 
76 aa  52  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1510  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.67 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1704  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.67 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2536  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.67 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2394  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.67 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0362  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.67 
 
 
97 aa  51.6  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2037  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.3 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2213  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.9 
 
 
97 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.190434  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.67 
 
 
104 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0904  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.07 
 
 
70 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215699  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2872  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.43 
 
 
76 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0380914  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3774  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.9 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00863673  normal  0.0479075 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3248  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.9 
 
 
97 aa  50.8  0.000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344342  normal  0.0166439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2829  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.06 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6783  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.06 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277557  hitchhiker  0.0000961691 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0954  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.87 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0945  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30 
 
 
76 aa  50.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582074  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4309  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000200233  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3921  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3932  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4403  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0852123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4289  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.18628  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4199  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5598800000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3174  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
77 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.84 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4031  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30 
 
 
76 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0705396  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4252  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30 
 
 
76 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449361  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.29 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.62 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2311  Exonuclease VII small subunit  37.84 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0227883  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.33 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0164  exonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2013  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.87 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322776  hitchhiker  0.00272964 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.92 
 
 
93 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0753  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.75 
 
 
81 aa  47.4  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000664309  hitchhiker  0.0000311057 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1036  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 
89 aa  47.4  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.121461 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2633  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.75 
 
 
86 aa  47.4  0.00007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.665476  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  31.94 
 
 
79 aa  47.4  0.00007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 
83 aa  47  0.00009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.14 
 
 
88 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2240  exonuclease VII small subunit  33.87 
 
 
78 aa  47  0.00009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754101  normal  0.0392595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.14 
 
 
88 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.36 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.7 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.74 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.7 
 
 
79 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1075  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.93 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00074506  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35 
 
 
86 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  36.36 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4822  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
93 aa  46.2  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.237878  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2131  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.74 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.62561  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.99 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0314  Exonuclease VII small subunit  35.9 
 
 
86 aa  45.4  0.0002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.311113 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.73 
 
 
94 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.163523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.74 
 
 
76 aa  45.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.21 
 
 
105 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.29 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.53 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.43 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.29 
 
 
87 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.9 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.9 
 
 
76 aa  44.3  0.0005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4459  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.85 
 
 
83 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.340877  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2877  exonuclease VII, small subunit  33.93 
 
 
95 aa  44.3  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5909  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.11 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.5 
 
 
80 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>