98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0941 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0941  Exonuclease VII small subunit  100 
 
 		 76 aa  149  1e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628269  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0954  Exonuclease VII small subunit  47.37 
 
 		 90 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.863468  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.27 
 
 		 83 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1760  Exonuclease VII small subunit  40.79 
 
 		 90 aa  53.1  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.94 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0124  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.81 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.327517 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0753  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.27 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000664309  hitchhiker  0.0000311057 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1182  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.28 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0104864  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1775  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.7 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319268  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.94 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.1 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  36.62 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.62 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.62 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.62 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.62 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.62 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.62 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.62 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.62 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.8 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1075  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.28 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00074506  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.73 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1720  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.81 
 
 		 81 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.170328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2480  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.23 
 
 		 83 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0945  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.14 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582074  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2797  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.6 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1136  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.22 
 
 		 84 aa  44.3  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.51 
 
 		 112 aa  44.7  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.62 
 
 		 122 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2872  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.14 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0380914  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4309  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.14 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000200233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4403  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.14 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0852123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4289  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.14 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.18628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4031  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.14 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0705396  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3932  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.14 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0832  exodeoxyribonuclease VII small subunit  29.33 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000144459  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4199  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.14 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5598800000000002e-24 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3921  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.14 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134688  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.14 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4252  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.14 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449361  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.85 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0164  exonuclease VII, small subunit  31.15 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.84 
 
 		 79 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.13 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1872  exodeoxyribonuclease, small subunit  35 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.969648  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0488  Exonuclease VII small subunit  40 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0904  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215699  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.84 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0779  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.23 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.13 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.36 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.36 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1236  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.17 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.15 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.14 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2079  Exonuclease VII small subunit  28.79 
 
 		 94 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.68 
 
 		 93 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.38 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1055  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.72 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0431  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 84 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.468215  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1876  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.25 
 
 		 96 aa  42  0.003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0542  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 84 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06500  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.35 
 
 		 84 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.83766e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0981  exodeoxyribonuclease 7 small subunit (exodeoxyribonuclease VII small subunit) (exonuclease VII smallsubunit)  44.83 
 
 		 64 aa  42  0.003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.23 
 
 		 82 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0438  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 84 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1281  hypothetical protein  31.15 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.428193 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3174  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.33 
 
 		 77 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1976  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.11 
 
 		 89 aa  41.2  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.700847  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2066  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.3 
 
 		 78 aa  41.6  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000986441  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1183  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1894  exonuclease VII, small subunit  36.96 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.24895 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1644  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.11 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413524 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.78 
 
 		 86 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.55 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  31.94 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.54 
 
 		 78 aa  40.8  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.99 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1023  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.78 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1603  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2311  Exonuclease VII small subunit  30.3 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0227883  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.35 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.94 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38 
 
 		 86 aa  40  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0733  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.38 
 
 		 88 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20420  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.46 
 
 		 149 aa  40  0.01  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.672892  normal  0.487259 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38 
 
 		 88 aa  40  0.01  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>