181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1236 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_1236  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 		 76 aa  148  3e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.45 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.45 
 
 		 82 aa  57  0.00000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.64 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.21 
 
 		 85 aa  54.7  0.0000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12190  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 83 aa  54.3  0.0000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.07 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.22 
 
 		 76 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  44 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0923  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00562605  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.1 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0753  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.82 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000664309  hitchhiker  0.0000311057 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1183  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44 
 
 		 71 aa  52.4  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.74 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.1 
 
 		 76 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 		 70 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.28 
 
 		 83 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.46 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 		 81 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.07 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.07 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 		 120 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.14 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0832  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000144459  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 		 80 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1182  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42 
 
 		 93 aa  50.8  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0104864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1766  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.17 
 
 		 76 aa  50.1  0.000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000846618  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0788452  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.82 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3327  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.54 
 
 		 79 aa  49.7  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.62 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.68 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1752  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.14 
 
 		 67 aa  48.9  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.62 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 84 aa  48.9  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.09 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.09 
 
 		 76 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.54 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.54 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1277  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 79 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.11345  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.67 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01175  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.67 
 
 		 80 aa  48.9  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.25 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.89 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.29 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.85 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2989  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.29 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 84 aa  47.8  0.00005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1603  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.44 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2434  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.07 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1359  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00292788  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.85 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.29 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1345  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230985  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1384  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0497  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38 
 
 		 71 aa  47.8  0.00006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  36.54 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1537  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 		 75 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000164588  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2729  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285704  normal  0.425427 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2802  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.269499  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2899  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.18 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152416  hitchhiker  0.000215653 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0851  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 		 67 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.339936  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1731  Exonuclease VII small subunit  33.85 
 
 		 85 aa  47  0.00008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.735568  normal  0.0195932 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  30.3 
 
 		 80 aa  47.4  0.00008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2075  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.4 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0019732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1789  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.4 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0504412  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.29 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1984  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  31.37 
 
 		 87 aa  46.2  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.89 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.43 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0020  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  29.31 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06500  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.98 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.83766e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>