214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2202 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 
80 aa  161  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0124  exodeoxyribonuclease VII small subunit  55.41 
 
 
100 aa  84.3  5e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.327517 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1760  Exonuclease VII small subunit  52.78 
 
 
90 aa  77.8  0.00000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1720  exodeoxyribonuclease VII small subunit  62.3 
 
 
81 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.170328  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0954  Exonuclease VII small subunit  51.56 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.863468  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2446  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.08 
 
 
89 aa  63.2  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0251  Exonuclease VII small subunit  41.18 
 
 
85 aa  57  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.129721  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0164  exonuclease VII, small subunit  44.26 
 
 
102 aa  56.2  0.0000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.77 
 
 
70 aa  56.2  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4252  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.06 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449361  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0881  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.81 
 
 
80 aa  55.5  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0234  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.32 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.733912  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.28 
 
 
76 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2013  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.68 
 
 
117 aa  55.5  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.322776  hitchhiker  0.00272964 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0904  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
70 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215699  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.58 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.99 
 
 
76 aa  53.9  0.0000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 
76 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4031  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.06 
 
 
76 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0705396  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.24 
 
 
88 aa  52.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.89 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2877  exonuclease VII, small subunit  38.81 
 
 
95 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3281  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.71 
 
 
77 aa  52.8  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2286  Exonuclease VII small subunit  38.71 
 
 
88 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.620752  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
75 aa  53.1  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3921  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3932  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4309  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000200233  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4403  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0852123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4289  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.18628  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0945  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582074  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4199  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5598800000000002e-24 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2872  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0380914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1075  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.55 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00074506  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1036  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.29 
 
 
89 aa  50.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.121461 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2254  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 
83 aa  50.8  0.000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0590284  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.7 
 
 
84 aa  50.8  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0021  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.1 
 
 
105 aa  50.8  0.000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.804691  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.82 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2311  Exonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
82 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0227883  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1182  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 
93 aa  50.4  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0104864  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0753  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.25 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000664309  hitchhiker  0.0000311057 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.1 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0954  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.29 
 
 
81 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  52.17 
 
 
86 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.21 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.21 
 
 
76 aa  49.3  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.48 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2075  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.1 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0019732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1789  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.1 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0504412  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.94 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0941  Exonuclease VII small subunit  48.94 
 
 
76 aa  48.1  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.628269  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0642  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.45 
 
 
87 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.768801  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.3 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.77 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.74 
 
 
76 aa  47.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 
87 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.94 
 
 
86 aa  47.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.112701  normal  0.027381 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.51 
 
 
76 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.77 
 
 
85 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
87 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1872  exodeoxyribonuclease, small subunit  40 
 
 
82 aa  47.4  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.969648  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1537  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48 
 
 
75 aa  47  0.00008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000164588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.11 
 
 
75 aa  47.4  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4308  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.64 
 
 
88 aa  47  0.00009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.8627  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4825  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 
93 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129421  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2037  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  47.27 
 
 
78 aa  47  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.64 
 
 
88 aa  47  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.374802  normal  0.592453 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.84 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.18 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  36.84 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.29 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.25 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2131  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.09 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.62561  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.87 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.62 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.81 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3492  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.39 
 
 
82 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422868  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3174  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.57 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1499  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.1 
 
 
93 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1775  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.65 
 
 
79 aa  47  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.319268  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6392  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.62 
 
 
94 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.16226 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3371  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  31.43 
 
 
81 aa  46.6  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 
80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.65 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.9 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.29 
 
 
104 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0917  Exonuclease VII small subunit  44.64 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.87 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.49 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.6 
 
 
80 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>