179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1789 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2075  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 		 75 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0019732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1789  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 		 75 aa  144  6e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0504412  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0155  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.281027  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1752  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 		 67 aa  60.8  0.000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0851  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.339936  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.03 
 
 		 82 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.03 
 
 		 82 aa  57  0.00000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1602  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.9 
 
 		 67 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.941328  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.51 
 
 		 76 aa  53.5  0.0000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.7 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.7 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.59 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.48 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.48 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.84 
 
 		 84 aa  50.1  0.000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.87 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.74 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  31.88 
 
 		 84 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.87 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.87 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2202  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.1 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.9 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.26 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.26 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01175  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 80 aa  48.9  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.87 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  30.26 
 
 		 78 aa  48.1  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.76 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.26 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0642  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.62 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.768801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0164  exonuclease VII, small subunit  40.35 
 
 		 102 aa  48.1  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0832  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.79 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000144459  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.36 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  36.36 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.43 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.43 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.43 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.43 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0753  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.35 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000664309  hitchhiker  0.0000311057 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.43 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.71 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 80 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2440  Exonuclease VII small subunit  40.32 
 
 		 73 aa  47.8  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144221  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  31.58 
 
 		 78 aa  47.8  0.00006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0788452  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1537  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.15 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000164588  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1984  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  29.85 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.36 
 
 		 76 aa  47  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.26 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.96 
 
 		 80 aa  47  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.43 
 
 		 102 aa  47  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.47 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 80 aa  47  0.00009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.16 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0619  Exonuclease VII small subunit  38.33 
 
 		 65 aa  46.6  0.0001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  31.51 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2311  Exonuclease VII small subunit  32.91 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0227883  normal  0.184422 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1236  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.4 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.51 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1133  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.93 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44078  hitchhiker  0.0045107 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.79 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.76 
 
 		 103 aa  46.2  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1154  Exonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158629  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2829  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.09 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.19 
 
 		 87 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.48 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  26.56 
 
 		 88 aa  45.4  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0124  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.43 
 
 		 100 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.327517 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1222  Exonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6783  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.09 
 
 		 102 aa  45.8  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.277557  hitchhiker  0.0000961691 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.7 
 
 		 77 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.48 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1766  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.86 
 
 		 76 aa  45.4  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000846618  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.87 
 
 		 76 aa  45.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  29.58 
 
 		 85 aa  45.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1094  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0363068  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  26.56 
 
 		 88 aa  45.4  0.0003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4822  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.73 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.237878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.73 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.67 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3327  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.82 
 
 		 79 aa  45.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.93 
 
 		 83 aa  45.1  0.0004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.14 
 
 		 89 aa  44.7  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000028975  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0923  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.67 
 
 		 79 aa  44.7  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00562605  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  27.54 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.48 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155573  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 85 aa  44.7  0.0005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 		 82 aa  44.7  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.62 
 
 		 80 aa  44.3  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2428  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.99 
 
 		 94 aa  44.3  0.0006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2434  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  31.08 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.35 
 
 		 79 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>