150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_1222 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_1222  Exonuclease VII small subunit  100 
 
 
93 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1154  Exonuclease VII small subunit  100 
 
 
93 aa  176  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158629  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1094  exodeoxyribonuclease VII small subunit  96.77 
 
 
93 aa  152  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0363068  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1133  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  79.12 
 
 
90 aa  132  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44078  hitchhiker  0.0045107 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.58 
 
 
75 aa  66.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.21 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.58 
 
 
75 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.47 
 
 
76 aa  63.5  0.0000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0097  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
101 aa  62.8  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.04 
 
 
84 aa  62  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.24 
 
 
77 aa  62  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 
81 aa  60.8  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.62 
 
 
76 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5909  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  49.28 
 
 
101 aa  58.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
82 aa  57.8  0.00000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.11 
 
 
85 aa  57.8  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.76 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.14 
 
 
87 aa  55.8  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1075  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.25 
 
 
81 aa  55.5  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00074506  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.55 
 
 
89 aa  54.3  0.0000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000028975  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.3 
 
 
76 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.03 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.03 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  38.03 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.03 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.03 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.71 
 
 
82 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.3 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.03 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.03 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.71 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.03 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.03 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06500  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.78 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.83766e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.58 
 
 
82 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.58 
 
 
82 aa  51.6  0.000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.53 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.44 
 
 
80 aa  51.6  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0832  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.98 
 
 
80 aa  50.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000144459  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
70 aa  50.8  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1171  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.03 
 
 
113 aa  50.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.462861  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.66 
 
 
80 aa  50.4  0.000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.14 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.84 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1182  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.71 
 
 
93 aa  50.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0104864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.76 
 
 
90 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.92 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.14 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.68 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.68 
 
 
112 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3492  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  31.08 
 
 
82 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422868  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1752  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.57 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.35 
 
 
79 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.51 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.34 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.68 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.68 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3317  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.33 
 
 
80 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0753  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.78 
 
 
81 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000664309  hitchhiker  0.0000311057 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.62 
 
 
75 aa  48.1  0.00004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1169  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  51.85 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0851  exodeoxyribonuclease VII small subunit  28.57 
 
 
67 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.339936  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1104  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.68 
 
 
85 aa  47.4  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 
80 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 
80 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 
80 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 
80 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.23 
 
 
84 aa  47.4  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.46 
 
 
80 aa  47  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.92 
 
 
76 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  31.43 
 
 
78 aa  46.2  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0788452  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0155  exodeoxyribonuclease VII small subunit  26.98 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.281027  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2075  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0019732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1789  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
75 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0504412  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.9 
 
 
86 aa  45.8  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2729  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285704  normal  0.425427 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2802  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.269499  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.53 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.51 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2899  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 
79 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152416  hitchhiker  0.000215653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1277  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.11345  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.03 
 
 
132 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01175  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
80 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0417  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.19 
 
 
90 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0234  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.51 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.733912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.78 
 
 
80 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2989  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  30.3 
 
 
82 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1537  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.86 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000164588  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.11 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2434  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.62 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691221  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.75 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  40.62 
 
 
80 aa  45.1  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2321  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.85 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2781  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.29 
 
 
80 aa  44.7  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.210066  normal  0.56065 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.78 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0881  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.23 
 
 
80 aa  44.3  0.0005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0263  exodeoxyribonuclease VII small subunit  29.73 
 
 
94 aa  44.3  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3001  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  30.43 
 
 
79 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121829  decreased coverage  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.19 
 
 
103 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>