130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0851 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0851  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 		 67 aa  124  5e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.339936  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0155  exodeoxyribonuclease VII small subunit  97.01 
 
 		 67 aa  120  5e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.281027  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1752  exodeoxyribonuclease VII small subunit  95.52 
 
 		 67 aa  120  9e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.156195 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1602  exodeoxyribonuclease VII small subunit  73.13 
 
 		 67 aa  92.4  2e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.941328  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.88 
 
 		 76 aa  62  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2075  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0019732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1789  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 		 75 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0504412  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.39 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5909  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.48 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.919185 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1537  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000164588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.68 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3027  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.62 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.27 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.66 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.62 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000890426  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.45 
 
 		 76 aa  51.2  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.31 
 
 		 76 aa  51.6  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1984  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.7 
 
 		 87 aa  50.8  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.66 
 
 		 85 aa  50.8  0.000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0904  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.29 
 
 		 70 aa  49.7  0.00001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000215699  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.98 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.1 
 
 		 86 aa  49.3  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.85 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1050  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.07 
 
 		 70 aa  48.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.67 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2177  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.31 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000361923  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.43 
 
 		 86 aa  48.1  0.00004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.14 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1094  exodeoxyribonuclease VII small subunit  29.51 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0363068  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.59 
 
 		 83 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1222  Exonuclease VII small subunit  28.57 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1024  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.21 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1154  Exonuclease VII small subunit  28.57 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.158629  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  39.29 
 
 		 77 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1236  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.07 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.43 
 
 		 81 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.07 
 
 		 80 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.43 
 
 		 81 aa  47  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.7 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.07 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  34.85 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2238  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.07 
 
 		 78 aa  46.2  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.264356 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.7 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1133  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  28.33 
 
 		 90 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.44078  hitchhiker  0.0045107 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.7 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.93 
 
 		 86 aa  46.2  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.76 
 
 		 80 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1003  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.76 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000898352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.07 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1669  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.36 
 
 		 74 aa  46.2  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000880334  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.82 
 
 		 80 aa  45.4  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.15 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.15 
 
 		 88 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.94 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.76 
 
 		 80 aa  45.8  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2066  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.86 
 
 		 78 aa  45.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000986441  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0917  Exonuclease VII small subunit  35.71 
 
 		 66 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.074479 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1075  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.67 
 
 		 81 aa  45.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00074506  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.85 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01175  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.85 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.07 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.04 
 
 		 80 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.29 
 
 		 79 aa  45.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1057  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.1 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.900986  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1182  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0104864  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.06 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.14 
 
 		 76 aa  43.9  0.0006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2037  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.29 
 
 		 78 aa  43.9  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0753  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 81 aa  43.9  0.0007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000664309  hitchhiker  0.0000311057 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06500  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.13 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  2.83766e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1766  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.73 
 
 		 76 aa  43.5  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000846618  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.71 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0124  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.87 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.327517 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.2 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.19 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.2 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.2 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.54 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0164  exonuclease VII, small subunit  38.46 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.870914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3492  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.88 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000422868  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.04 
 
 		 78 aa  42.7  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.2 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0832  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.84 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000144459  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.2 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.19 
 
 		 82 aa  42  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.2 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.2 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.19 
 
 		 82 aa  42  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.2 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.2 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.2 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  32.2 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.68 
 
 		 79 aa  42  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2587  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.66 
 
 		 83 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00858119  normal  0.452628 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>