65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0619 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_0619  Exonuclease VII small subunit  100 
 
 		 65 aa  115  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2440  Exonuclease VII small subunit  64.15 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.144221  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 80 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 80 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 80 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 80 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 80 aa  50.8  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.33 
 
 		 80 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.74 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  34.62 
 
 		 78 aa  49.3  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0788452  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.16 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3001  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.48 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121829  decreased coverage  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  30.16 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.48 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  31.48 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.16 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.16 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.16 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.16 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.16 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  30.16 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.16 
 
 		 80 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2075  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.33 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0019732  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1789  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.33 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0504412  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.09 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0753  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44 
 
 		 81 aa  46.2  0.0002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000664309  hitchhiker  0.0000311057 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.83 
 
 		 77 aa  45.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  29.63 
 
 		 86 aa  44.7  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  27.78 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  27.78 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.66 
 
 		 76 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.87 
 
 		 79 aa  43.9  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.87 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2802  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.87 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.269499  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.48 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2729  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.87 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285704  normal  0.425427 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2899  exodeoxyribonuclease VII small subunit  33.87 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152416  hitchhiker  0.000215653 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  27.78 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3327  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.48 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  27.78 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1277  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.48 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.11345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1384  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.87 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  30.16 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2922  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.21 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1359  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.87 
 
 		 79 aa  42.4  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00292788  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  30.65 
 
 		 81 aa  41.6  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.65 
 
 		 81 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2434  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  32.26 
 
 		 79 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691221  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.84 
 
 		 86 aa  41.6  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.65 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1766  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 		 76 aa  41.2  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00000846618  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2405  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.21 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000772835  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0497  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 		 71 aa  41.2  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.79 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.26 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  32.79 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1345  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  31.48 
 
 		 79 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230985  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.65 
 
 		 80 aa  40.8  0.007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01175  exodeoxyribonuclease VII small subunit  30.19 
 
 		 80 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  29.63 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2989  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  33.33 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2790  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.59 
 
 		 79 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.282192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  29.82 
 
 		 80 aa  40.4  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2877  exonuclease VII, small subunit  31.48 
 
 		 95 aa  40  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2195  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  26.56 
 
 		 87 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>