243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_2802 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_2729  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 
79 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285704  normal  0.425427 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2802  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 
79 aa  155  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.269499  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2899  exodeoxyribonuclease VII small subunit  100 
 
 
79 aa  155  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152416  hitchhiker  0.000215653 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1277  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  97.47 
 
 
79 aa  153  8e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.11345  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1384  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  96.2 
 
 
79 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1359  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  96.2 
 
 
79 aa  152  1e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00292788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1345  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  94.94 
 
 
79 aa  150  4e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230985  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3001  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  94.94 
 
 
79 aa  149  1e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121829  decreased coverage  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3327  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  83.54 
 
 
79 aa  133  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779429  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  82.28 
 
 
79 aa  131  3e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2434  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  81.01 
 
 
79 aa  120  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691221  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  77.22 
 
 
79 aa  120  8e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  78.48 
 
 
78 aa  116  9e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0788452  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  77.22 
 
 
78 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2989  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  69.62 
 
 
82 aa  114  6.9999999999999995e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  62.5 
 
 
83 aa  90.9  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01175  exodeoxyribonuclease VII small subunit  54.55 
 
 
80 aa  89  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.25 
 
 
80 aa  88.2  3e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  58.33 
 
 
80 aa  87.8  4e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2238  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  58.33 
 
 
78 aa  87  8e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.264356 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0414  exodeoxyribonuclease VII small subunit  54.05 
 
 
80 aa  86.7  9e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.04357  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3279  exodeoxyribonuclease VII small subunit  55 
 
 
82 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1032  exodeoxyribonuclease VII small subunit  55 
 
 
82 aa  84.7  4e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.52 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.52 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.52 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.52 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.52 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.52 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.52 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  53.52 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.52 
 
 
80 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3251  exodeoxyribonuclease VII small subunit  54.93 
 
 
84 aa  77.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  56 
 
 
82 aa  77.4  0.00000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.5 
 
 
80 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3110  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.52 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.33 
 
 
82 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.5 
 
 
80 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  49.33 
 
 
82 aa  75.5  0.0000000000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.5 
 
 
80 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3072  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.52 
 
 
84 aa  75.9  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.5 
 
 
80 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.5 
 
 
80 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  52.11 
 
 
80 aa  75.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0903  exodeoxyribonuclease VII small subunit  53.73 
 
 
86 aa  74.7  0.0000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
82 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3220  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.44 
 
 
112 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.13 
 
 
87 aa  74.3  0.0000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3083  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.75 
 
 
82 aa  73.6  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0819  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  50 
 
 
76 aa  71.2  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.1 
 
 
80 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.57 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.3 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.3 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  51.35 
 
 
132 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.84 
 
 
80 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.57 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.57 
 
 
80 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.45 
 
 
80 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  45.95 
 
 
80 aa  67.4  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.59 
 
 
81 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.59 
 
 
81 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  59.65 
 
 
120 aa  65.5  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1984  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.15 
 
 
87 aa  65.5  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50 
 
 
76 aa  64.7  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.44 
 
 
76 aa  63.9  0.0000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.89 
 
 
85 aa  62.4  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.51 
 
 
80 aa  62  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1416  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 
84 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.335751  normal  0.272045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.89 
 
 
80 aa  60.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.38 
 
 
122 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.75 
 
 
85 aa  58.5  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1698  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.42 
 
 
90 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.120092 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  45.59 
 
 
80 aa  57.4  0.00000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06260  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.19 
 
 
86 aa  57  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0413231  normal  0.0182875 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4083  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3921  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.134688  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3932  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4309  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000200233  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.3 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4403  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0852123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4289  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.18628  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4031  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0705396  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3427  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.78 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0923  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.71 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00562605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0945  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
76 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582074  hitchhiker  0.000128888 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  42.25 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4199  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
76 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5598800000000002e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4252  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
76 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449361  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01898  exodeoxyribonuclease VII small subunit  47.76 
 
 
86 aa  55.5  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.90032  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1903  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
78 aa  55.8  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.541864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1936  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.48 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.29 
 
 
88 aa  55.8  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.19 
 
 
86 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0753  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.53 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000664309  hitchhiker  0.0000311057 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1664  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.59 
 
 
81 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.329844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2872  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
76 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0380914  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12190  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  46.67 
 
 
83 aa  55.8  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2036  exonuclease VII, small subunit  47.46 
 
 
77 aa  54.7  0.0000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0097  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
101 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>