194 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_06260 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013170  Ccur_06260  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  100 
 
 
86 aa  171  1.9999999999999998e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0413231  normal  0.0182875 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12190  Exodeoxyribonuclease VII small subunit  60.26 
 
 
83 aa  95.9  1e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1731  Exonuclease VII small subunit  62.34 
 
 
85 aa  91.3  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.735568  normal  0.0195932 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0642  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  53.85 
 
 
87 aa  68.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.768801  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1321  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.71 
 
 
83 aa  67.4  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3476  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  45.76 
 
 
79 aa  60.5  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.173082  hitchhiker  0.00255329 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2769  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.54 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.365151 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.94 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.046824  hitchhiker  0.0000314592 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2729  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.19 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00285704  normal  0.425427 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2802  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.19 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.269499  normal  0.706037 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2788  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.62 
 
 
78 aa  57  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0306157  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2899  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.19 
 
 
79 aa  57  0.00000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152416  hitchhiker  0.000215653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3327  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.54 
 
 
79 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.779429  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1277  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.11345  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0844  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.91 
 
 
104 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.44 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1384  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.62 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.402794 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0581  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.21 
 
 
80 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.47 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1359  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.62 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00292788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1345  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40 
 
 
79 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00230985  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0529  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.21 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0328  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.91 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0612  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.91 
 
 
104 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1510  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.91 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1704  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.91 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2536  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.91 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2394  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.91 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0362  exodeoxyribonuclease VII small subunit  50.91 
 
 
97 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0563  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.21 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.159377  normal  0.90532 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3001  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.62 
 
 
79 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.121829  decreased coverage  0.0000000571856 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2989  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  43.1 
 
 
82 aa  54.3  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.247958  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0935  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.1 
 
 
80 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2238  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.28 
 
 
78 aa  53.5  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.264356 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2892  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.81 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1776  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  46.43 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782365  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0574  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.19 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0834  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.79 
 
 
85 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00522049  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.19 
 
 
82 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1147  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.44 
 
 
80 aa  52.8  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.164326  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2277  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 
76 aa  52.4  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2249  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 
76 aa  52.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0526  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.44 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0484  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.44 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0463  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.44 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0471  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.44 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0465  exodeoxyribonuclease VII small subunit  35.44 
 
 
80 aa  52.4  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2569  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  40.32 
 
 
78 aa  52  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0788452  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4822  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.67 
 
 
93 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.237878  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3296  exodeoxyribonuclease 7 small subunit  42.11 
 
 
80 aa  52  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2434  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.76 
 
 
79 aa  52  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691221  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0700  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  48.21 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0606  exodeoxyribonuclease VII small subunit  48.21 
 
 
81 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.60315  normal  0.0881534 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1600  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.02 
 
 
88 aa  50.8  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.937975  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01175  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40 
 
 
80 aa  50.8  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004256  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.68 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2893  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.35 
 
 
86 aa  50.8  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1059  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
80 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.378404  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2436  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.79 
 
 
85 aa  50.8  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0889  exodeoxyribonuclease VII small subunit  37.33 
 
 
80 aa  50.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00370  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.76 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3187  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.76 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.498051  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0453  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.76 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20610  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.91 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.375138  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0343  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.76 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0946  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.33 
 
 
85 aa  49.7  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0846  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.96 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.136632  normal  0.343056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11570  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.89 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3211  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.76 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0493  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.76 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0458  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.76 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07890  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.91 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0166035  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00374  hypothetical protein  36.76 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0505  exodeoxyribonuclease VII small subunit  36.76 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1080  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.35 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000691643 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1652  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.86 
 
 
88 aa  49.7  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5005  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.64 
 
 
80 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3840  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  39.39 
 
 
132 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.77898  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1991  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  36.59 
 
 
155 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1090  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  37.1 
 
 
82 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0880  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.86 
 
 
103 aa  48.5  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2184  exodeoxyribonuclease VII small subunit  38.24 
 
 
77 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000051669  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2131  exodeoxyribonuclease VII small subunit  43.64 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.62561  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3650  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1677  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  41.54 
 
 
79 aa  48.5  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4488  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3877  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.62 
 
 
97 aa  48.5  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.209796 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4745  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  44.83 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.820479 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1514  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 
83 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0097  exodeoxyribonuclease VII small subunit  42.65 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3248  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.344342  normal  0.0166439 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3774  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.18 
 
 
97 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00863673  normal  0.0479075 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0090  exodeoxyribonuclease VII small subunit  39.29 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1150  exodeoxyribonuclease VII small subunit  44.83 
 
 
82 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1706  exonuclease VII, small subunit  37.5 
 
 
77 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0954  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  35.48 
 
 
81 aa  47.8  0.00006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2223  exodeoxyribonuclease VII small subunit  40.32 
 
 
94 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2617  exodeoxyribonuclease VII small subunit  41.67 
 
 
102 aa  47.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.113058  normal  0.543608 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1424  Exonuclease VII small subunit  37.5 
 
 
77 aa  47.8  0.00006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.506182  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0779  exodeoxyribonuclease VII, small subunit  38.57 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.144683  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>